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くノ一ツバキの胸の内
椿是女忍者“茜组”的优等生。一直与男忍者分开上课的女忍者们，自小就没见过男人。那是因为长久以来，茜组有个规定：“禁止与男人交流，因为男人都是危险的生物！” 老师们的禁令反而激发了她们对男人的好奇心。某次执行任务时，椿阴差阳错地见到了一个疑似男人的身影，明知不能违反规定，但内心这股小鹿乱撞的感觉又是怎么回事呢？
在人烟稀少的深山里，有一群时而严厉，时而和气融融一起努力修行的女忍者集团“茜组”，其中隶属于戌班的山茶花和朝颜，在深夜偷偷起床溜出去，前往某个地方。戌班班长桩抓到她们后，质问偷跑出去的理由，她们居然回答是为了打倒男生。
努力与天才：茜组会不定期举行测试班级之间实力的实战演练，桩带领的戌班在某天的班级对抗赛遇上了未班，自称是天才的未班班长杏李，对班上成员隐瞒的秘密是…… 姐姐大人与逃脱计划：山茶花对于桩最近不太理睬自己这件事感到耿耿于怀，为了吸引桩的注意，她叫朝颜留下来把风，自己翘课偷溜出去，此时在高年级生教室上课的桩，突然有股不祥的预感。
友好对决：山茶花和朝颜是不合拍的搭档，个性也正好相反，不擅长团结合作，因此桩便请教总是形影不离的巳班成员茴香和桔梗，有没有什么办法能让她们两人感情变好。 男鬼抓人：包含桩在内的高年级生们，对从来没见过的男生充满兴趣，常常在下课的时候分享自己对男生的想像，对这种行为感到担心的华，为了让大家重新意识到男生很危险这件事，宣布要进行男的鬼抓人游戏。
男生和女生：桩无意间从华口中得知有关男生的冲击性真相，之后依据华的决定，决定把一切都告诉桩，包含过去曾经和男性忍者集团“苍组”有过交流的事，以及男生和女生之间萌生的，令人心跳不已的“那件事”。 木莲的医术：申班的班长，精通医术的木莲，本来打算悠闲渡过难得的假日，却因为没办法拒绝别人的要求，被一些小意外和拜托治疗的各种请求搞得非常忙碌。
水果争夺战：最喜欢吃东西的朝颜遇到一个沉重的打击，那就是她小心翼翼呵护长大的木通果被午班的雏菊吃了，而且宣称自己比任何人都可爱的雏菊，还向桩提出对决，要比比看谁更可爱，桩该怎么对抗呢？ 独立与骄纵：丑班的低年级成员紫阳花有一个很大的烦恼，那就是班长紫苑和高年级的成员铃兰对自己保护过头，紫阳花为了让她们认可自己是独挡一面的人，向桩提出决斗，想借此证明自己的实力。
转校生芸豆来了，但她并不是女孩们所期待的。因为特殊的背景加入狗队，芸豆的第一个大挑战，可能就是争取自己的队友！
龙胆的决心 ：芸豆正在慢慢适应她在新村庄的生活，但一些女孩急于让她摘下面具。 深夜的邀请：当花在深夜召唤椿和芸豆时，山茶花开始感到怀疑。
最强的班：号称是茜组最强的班级，由蕺率领的亥班，带着野猪肉作为土产回到村落。戌班成员开开心心去见个性豪爽豁达的她们，却因为朝颜不小心说出了某句禁语，害她们不得不提出对决…。 姐姐大人：芸豆对山茶花称呼桩为姐姐大人的理由感到很好奇，椿便把这个称呼的由来从头到尾告诉了她。那是发生在她们被分到戌班那一天的事情…。
蛇和男生：看到布告栏公告的茜组学生们，为了让配菜增加，争先恐后想抓住华的蛇。椿也开始一起寻找蛇，但在知道山茶花和朝颜把蛇称为“男生”之后… 所谓的成果：一直在山里隐居的酉班，终于回到村落里了。班长菫为了重新锻炼散漫又引人注目的成员蒲公英和蓟的心智，决心去山里隐居修行，虽然蒲公英和蓟一开始摆出一本正经态度，但是…
班长的烦恼：子班的班长蜀葵，有一件感到不安的事情，实在很没有主见的她，对于自己是不是一位好班长有点没信心。某天，她对班上成员向日葵和萩下达指示，却害她们白忙一场… 借出与借来：山茶花和朝颜为了感冒的椿，决定去山中采感冒药需要用到的草药，这时候未班班长杏李出现了，她向山茶花她们提出挑战，比赛看谁先采到草药…
成名术：椿从以前住在有男生村落的龙胆那里，得知了「受欢迎」这个概念。她和曲解受欢迎意思的山茶花还有朝颜为了让男生大意，借此趁机打倒他们，努力学会「受欢迎术」，但是… 想受欢迎：山茶花和朝颜把「受欢迎术」传授给身边的人，在低年级生之间流行了起来，但这件事要是被严禁她们接触男生的老师们知道，一定会挨骂…这么想的椿，想在事情闹大前解决这个问题…
劲敌：受欢迎术作为忍术虽然已经没人在使用，但低年级生却把它当成游戏，掀起一股流行。影响最深的莫过于被大家装可爱的受欢迎术搞得失去自信的雏菊。午班的旌节花跑去拜托杏李帮雏菊加油打气，结果… 男生的画像：自从受欢迎术盛行后，椿对男生的事情感到越来越在意。椿看不懂龙胆画的男生，可是她在书库里发现一个卷轴，得知里面画着男生的模样…
茜组要跟男生决战！ ？华老师和木叶老师暂时离开了村落，把这段期间的事情交给学生代表的椿来处理，知道没有老师看管后，大家开始吵吵闹闹。想让她们好好自习简直难如登天，让椿一个头两个大。此时屋漏偏逢连夜雨，发生不知道是什么人入侵村落，破坏农地，以及摧毁一部分宿舍和食堂的严重事件。龙胆推论犯人应该是名为山贼的残暴男生，结果究竟是…？
