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台湾联大医院外科主治医师苏怡华（言承旭 饰）年轻有为，善良的他希望能做一个好医生，心中只想着帮病人解脱疾病的折磨。老院长即将退休，外科主任唐国泰（吴孟达 饰）与内科医生徐大明都是接任的人选。面临升迁的大好机会，两人开始明争暗斗。此时，台湾领导人的女儿刘心萍（Sanya 饰）患白血病入住了联大医院，院方高度重视。刘心萍也成为了内科与外科之间较量的主要对象，一场白色医袍下丑陋的尔虞我诈的人性角力正式开始。面对一系列的钩心斗角以外，苏怡华与外科副主任邱庆成（戴立忍 饰）也要面对剪不断理还乱的感情线，医生能医不自医。
圣诞夜，张建和美杏遭遇车祸，性命垂危。外科医师邱庆成和郝孝刚奋力抢救，最终救回张建，并为美杏接生，但婴儿需插管维持生命。与此同时，医院内部暗流涌动：外科主任唐国泰因偏执暴躁在手术室发怒，麻醉科医师关欣机智化解危机。苏怡华被内科主任徐大明选中为高层领导之女刘心萍手术，引发唐国泰不满，他威胁院长赵仲民试图更换主刀医生。而苏怡华与关欣之间若即若离的情感，以及“花莲”背后的秘密，为冰冷的医院增添了一丝温情。权力斗争与生死急救在这座白色巨塔中交织上演。
医院护理长雯丽对住院医师郝孝刚的追求无动于衷，却因苏怡华关心病患的举动而心生好感。唐国泰临时更换刘心萍手术主刀为邱庆成，引发与徐大明的冲突。苏怡华发现手术变更后，仍惦记为心萍买头巾。雯丽暗中爱慕常值夜班的苏怡华，而邱庆成与妻子因生活观念产生分歧。心萍手术如期进行，苏怡华虽被排除在外，却不知自己即将卷入这场权力纷争。与此同时，他与关欣未解的过往情感仍萦绕心头。
邱庆成与马懿芬暗中勾结，利用更衣室冲突录像换取利益。苏怡华虽被排挤出心萍手术，仍专注病人状况。朱慧锳手术突发意外，关欣冒险修改麻醉记录担责，却遭院方施压。念玮在妻子死后崩溃，为她戴上戒指。心萍因术后发烧情绪低落，怡华暖心安慰并承诺常来探望。权力斗争下，医生们各自面临抉择，而病患的生死悲欢仍在医院不断上演。
孝刚误以为怡华有女友，重燃追求雯丽的希望。怡华察觉关欣陷入医疗纠纷，主动关心却被婉拒。心萍收到怡华送的头巾，强掩对他的好感。邱庆成警告怡华远离心萍，同时院方施压关欣承担朱慧锳手术责任。唐国泰接受季院长贿赂，密谋争夺院长职位。心萍病情恶化，怡华察觉异样却被邱庆成阻挠探视。权力斗争与情感纠葛在医院交织，怡华与关欣的隔阂愈发明显。
邱庆成封锁心萍病房，刻意排挤苏怡华。怡华愤懑难平，却遭徐大明劝阻。另一边，关欣在朱慧锳医疗纠纷说明会上，面对家属质疑仍坚持专业立场，却被马懿芬带记者搅局。怡华寻求关欣支持，反因理念不合不欢而散。心萍独自忍受痛苦检查，还要强撑安慰父亲。唐国泰趁机与黄院长交易，暗中操控舆论。医院权力斗争愈演愈烈，医患关系在猜忌与误解中愈发紧张。
唐国泰用关系压下医疗纠纷新闻，并收下黄院长的厚礼。邱庆成提议为心萍手术遭唐拒绝，郁闷中与马懿芬暧昧。关欣回家见二姊反常做饭，却无心进食。怡华得知心萍病情危急，冒险救治被邱阻止，两人反而互相理解。念玮带人闹事医院，指控关欣"杀人凶手"，场面失控。怡华紧急把关欣带离现场，医院乱局持续升级。权力与医德的角力中，每个人都面临抉择。
医院风波后，苏怡华护送情绪崩溃的关欣回家，发现她家遭人涂鸦威胁。两人在旧物与回忆中重拾往日温情，怡华彻夜守护。隔日清晨，他留下字条悄然离去。重返医院时，两人默契如初。与此同时，麻醉科主任试图用200万收买关欣，要她承担手术事故责任，但关欣坚持追查真相，拒绝妥协。权力与良知的角力仍在继续。
总统探视转入加护病房的心萍，院方高层惊慌失措。唐国泰在会议上被苏怡华顶撞勃然大怒，迁怒邱庆成。关欣面对院方施压咨询律师，确认自己无法律责任。念玮与关华人马爆发冲突。深夜，怡华收到匿名邮件警告外科暗潮汹涌，各方势力角力愈演愈烈。
医院权力斗争白热化：苏怡华遭外科集体孤立，手术被刻意刁难无人协助；关欣坚持病理解剖还原真相，却遭恐吓报复；心萍夹在唐国泰与怡华之间左右为难。黄凯元被泼红药水，关欣收到恐吓邮件，医疗纠纷演变成暴力冲突。邱庆成劝怡华低头，他却宁让病人受苦也不妥协。在这场体制与良知的对抗中，理想主义者们正被系统一步步吞噬。
马懿芬挖出关华涉毒及教唆伤害的丑闻，在新闻中大肆渲染，关欣在医院与她对峙后前往警局保释关华。同时，唐国泰在外科全面打压苏怡华，连病人也遭牵连。关欣家中，姊妹因冲突争吵，怡华前来安慰，关欣情绪崩溃痛哭。另一边，张建急需手术却无人协助，怡华被迫独自上阵，明珠见状惊慌失措。
危急时刻，怡华在孝刚协助下完成张建手术，却遭唐国泰记恨。心萍突发状况，庆成与怡华冒险手术，唐国泰大闹手术室被王主任撞见。朱母被关欣真诚打动，终于同意病理解剖。医院内部斗争愈演愈烈，而医者仁心终在危急时刻显现。
关欣陪朱妈妈追忆慧锳，两人在伤痛中相互理解。朱妈妈最终同意病理解剖，医患关系得到修复。怡华带关欣到寺庙祈愿，两人重温旧情，但关欣心中仍忘不了庄明哲。邱庆成因心萍病情与家庭、工作压力濒临崩溃，与唐国泰彻底决裂。马懿芬为独家新闻不断施压，医院权力斗争愈演愈烈。
马懿芬借送礼之名接近邱家，埋下家庭危机。心萍术后大出血，总统震怒发现医院权力斗争真相。孝刚被调职却乐观开解自责的怡华。关欣坦白当年背叛，两人关系急转直下。关华送冰箱示好反遭妹妹责备。美杏独自承受新生儿病危的痛苦。邱庆成家庭疑云渐起。
邱家因马懿芬送的脚踏车爆发争吵，揭露小敏有学习障碍。孝刚欢送会上，醉酒的怡华错把雯丽当成关欣倾诉。关欣在急诊室遇见执着的洪威。邱庆成抢救危急的张佑婴儿，同时朱慧锳的病理解剖即将开始。各条故事线在医患关系和情感纠葛中交织推进。
病理解剖揭示朱慧锳死于肺动脉栓塞，关欣主动要求同列被告，怡华承诺不离不弃。孝刚精心安排与雯丽的一日约会。张建夫妇忍痛放弃病危婴儿的急救，终得拥抱孩子。小敏学会骑车让庆成感动不已。医患关系与个人成长在生死考验中交织。
唐国泰借故记过邱庆成与苏怡华，并逼怡华退出研究计划。朱母拒绝赔偿金，坚持要医院道歉，最终将400万捐出。关欣获得黄院长理解，而唐国泰继续打压异己，医院权力斗争持续。怡华与陈宽坚守原则，关欣姐妹关系缓和。
心萍出院前向怡华表白心意，含泪告别。怡华与关欣在电话中吐露真心，却因醉酒记忆模糊。陈庭父子为升等拉拢评委会，暗藏报复唐国泰之心。唐国泰反思家庭关系，对儿子学医产生动摇。医院权力斗争持续，各方势力明争暗斗。
陈庭为儿子升等四处打点，派儿媳送礼遭邱妻退回，引发家庭冲突。怡华获埔里医院邀约，想带关欣同往。邱庆成周旋各方势力，既收陈庭股份又向马懿芬炫耀。唐国泰为校长支持积极筹款。医院权力角逐愈演愈烈，各方暗潮汹涌。
陈宽升等投票因邱庆成临阵缺席而失败，陈庭多年谋划落空。唐国泰自信院长之位势在必得，却在手术中得知徐大明接任的消息，当场中风倒地。总统暗中干预医院人事，黄凯元与校长被迫妥协。权力版图骤变，各方势力重新洗牌。
唐国泰中风后，医院权力格局彻底重组。徐大明接任院长，各方势力纷纷转向巴结。邱庆成周旋新旧势力间，与马懿芬关系暧昧。苏怡华辞职遭挽留，埔里计划突生变数。唐夫人召集外科医生宣誓效忠，但唐的时代已然终结。怡华在理想与现实的落差中陷入迷茫。
