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千百年来，外星掠夺者们通过灰暗虫洞来到地球，将人类抓到各星球去做奴隶。 2016年，国家天星局局长游大星组建了空间战击队全力打击外星掠夺者。队员为六位游戏高手：阿空、阿静、阿能、阿震、阿风和杨一击等六位个性迥异的年轻人，在唐少校、柯娜和福伯带领和帮助下，组成了团结勇敢、战无不胜的“巨神战击队”。 六个年轻人运用各种高科技神奇力量去对抗想要破坏并占领地球的邪恶势力，他们不断地迎接一次又一次挑战，在历经无数次艰难险阻之后，最终在大家团结齐心的不懈努力之下，战胜了邪恶力量，保护了地球的和平。
宇宙是个广大无边的神秘空间，它一直是人类积极探寻的课题，随着科技的进步探索宇宙的愿望即将变成现实，国家航星局为了甄选电子宇航员举办了天星大赛，但这场大赛却早已被一股神秘势力所操控，频频发生参赛选手失踪的案件……游希碧想要让迪小龙加入空间删除者同盟的请求遭到了其拒绝，本以为自己能够控制局面的琼儿等人，在作战中却遇到了局限。
接到命令的阋臭蟑来到地球上统领巴嘎军团，准备继续抓捕人类，而阿碧让父亲停止天星大赛的要求也没能实现，迪小龙也没有按照她所说的加入空间删除者同盟。当阿碧等人根据现有资料调查外星人入侵事件的原因时出现了强烈的漏洞犯能量反应，赶到现场的他们和阋臭蟑展开了战斗，而了解到情况的迪小龙根据名片找到了基地。
找到基地的迪小龙为阿碧他们带去了重要的信息，但小龙本人却依旧不愿加入同盟。当游大星了解到是自己女儿阿碧劝小龙退出考试后，非常尴尬，听到游大星的话后小龙将信将疑。阋臭蟑的失利让老板派来了妊腥鲨，满身腥臭的妊腥鲨要为水星抓去懂得建筑的人类，而察觉到腥疤疙能量的阿碧立即让空间战击队出动。
阿碧一直感觉到并不是幻觉，而是三星国王鲁修迪的全息投影，曾被腥疤疙抓去当奴隶的他想要避免地球受到劫难，在他的指导下阿碧成功说服小龙加入。在鲁修迪为他们指导时腥疤疙出现了，快递来武器的妊腥鲨厉害非凡，天羽和琼儿已经不是她的对手，而下定决心的小龙化身为火战卫参加了战斗，三人的力量激发了太阳战击王真正的实力。
妊腥鲨在之前的战斗中失败，而这次老板又叫来了鸟秃怪。与此同时，局长对于航星局设备任由不明人物的访问感到烦恼，而突然退赛的小龙让他想到了自己的女儿阿碧，想要小龙和自己的女儿一起到电影院里看电影。这次的腥疤疙事件在城北的公园，因为小龙的迟到琼儿和天羽陷入了苦战，这场战斗让这个新生战击队出现了裂痕。
空间战击队成员们的矛盾更加激化，这让阿碧非常头疼，各执己见的小龙等人无法达成共识。以宇航员候选人资格来诱惑小龙的局长想要套出阿碧的下落，仔细思考后的小龙识破了局长的意图，回到局里后局长了解到了无人宇航机被盗用的事件与任我行有着关联。在鲁修迪耐心的劝导下空间战击队的众人又重归于好，相互协作的他们在战斗中表现出了强大的凝聚力。
在阿碧和鲁修迪的指导下空间战击队的队员们都有了很大的进步，相互协作保持好奇心对于他们是很重要的。找上了小龙的游大星再次逼迫他约阿碧看电影，在小龙犹豫的时候他已准备好了电影票，这时腥疤疙又出现了。这次出现的卡戎蜥一来地球就劫持了一架飞机，态度强硬的他立即盯上了空间战击队。
从小龙那里套出阿碧现状的局长不想兑现之前的承诺，而空间战击队擅用设备的行为让局长非常头疼。和任我行起名的金不败也曾一同参与了宇航机RCV的制作，为了证明自己的金不败再次出山，也挑选出了两名空间战击队成员和小龙等人竞争，在小龙他们思索如何发挥太阳战击王的实力时，腥疤疙再次出现。
金不败所挑选出的两个空间战击队成员：陈力京和王易杰准备取代小龙等人，喜欢四处挑衅的两人和小龙他们发生了很多摩擦，而新的腥疤疙又出现了。灶王星的腥疤疙开始肆意的虏获地球人，先赶到的陈力京和王易杰立即开始战斗，而小龙等人也不甘示弱加入了战斗，这场战斗不光是战胜腥疤疙那么简单，他们还要证明谁才是真正的空间战击队。
不同归属的两方空间战击队矛盾越来越大，而陈力京和王易杰竟然找到小龙他们想要没收星能变，陈力京的挑衅态度和无礼要求让小龙和天羽非常生气，但任我行却相信五位空间战击队员终将会齐心合力。急于补充劳动的腥疤疙又展开了行动，意见不合的空间站及队员们竟然自己打了起来。
两支空间战击队之间的不和，让腥疤疙有机可乘，婚浊蛆的出现让地球再度面临危险。狡诈的婚浊蛆利用地球的通信网络给局长发去了和平共处的要求，表面上想要求和的腥疤疙却在背地里做一些见不得人的勾当，以考验诚意的名义婚浊蛆在大街上光明正大的抓捕地球人，赶到的小龙等人又与不明真相的易杰他们发生了冲突。
被金不败察觉到的任我行不打算再继续隐藏自己，在他的指示下阿碧找到头脑冷静的王易杰商量对策，在听到空间战击队的过往之后，他同意促进双方的关系。没有成功的婚浊蛆再次使用诡计约出局长，得到消息的王易杰立刻联系阿碧。阿碧与局长是父女关系的这事，让队员们吃惊不已，赶去营救的小龙等人与易杰他们联手打败了敌人，空间站及队员们的心结终于解开了。
经历过上次的危险后局长开始了动摇，但他想将空间战击队两方力量结合起来的想法却遭到了金不败的否定，一心想要打败任我行的金不败又展开了计划。在灶痛蝇和婚浊蛆失败后，来自智神星的腥疤疙也出动了，为了引出任我行的金不败不光让局长利用阿碧展开调查，还私自联系了腥疤疙，为了达到自己的目的他完全不顾地球人的安危。
金不败与任我行的会面并不愉快，而任我行也开始怀疑金不败的行为，局长在看到痴狂报复任我行的金不败后也非常生气。在阿碧为队员们讲解空间穿梭装备由来的时候局长找到了他们，明白了事情真相的局长决定站在他们这一边，而腥疤疙又在这时展开了行动，这次的信号出现在了两个地方，分为两组的空间战击队展开了行动。
金不败对任我行的执念遭受众人的反感，而找到阿碧的局长也想要和任我行会面好好谈谈，在局长和阿碧讨论的时候腥疤疙突然出现。因为有人告密的缘故腥疤疙抓住了落单的局长和阿碧，与任我行取得联系的阿碧想到了逃出去的办法，但这却被腥疤疙反过来利用成为了捕捉空间战击队的陷阱，出动的空间战击队能够救回局长和阿碧吗？
金不败还是没有放弃对任我行的纠缠，力京拒绝了他想要刺探空间战击队的要求，但金不败却偷偷在力京的身上装了跟踪器。金不败的刺探行动并没有得到预想的结果，但落单的力京却遭到了腥疤疙的围攻，身单力薄的力京很快陷入了劣势，接到信号的其他队员立即展开了救助，齐心合力的五人将所向披靡。
局长已经做出了让任我行回到航星局的决定，这一决定让金不败非常气愤，他准备展开疯狂的报复。另一方面，在阋臭蟑被打败后又出现了新的腥疤疙，排名第二的腥疤疙冷血异常，他这次的目标竟然是还未成年的小孩子们，及时赶到的空间战击队成功组织了他们的暴行，而暴虐的腥疤疙竟然互相残杀，在反地图里空间战击队面临着一场恶战。
任我行的重新回归对于金不败来说简直就是场恶梦，决定不再协助空间战击队的他竟然还想要倒戈。这次腥疤疙又收到了水星的订单，而他们也同时收到了来自航星局的秘密邮件，谷历驼和冥噩耗意见不合打了起来，在与空间战击队的战斗中不合的腥疤疙相互妨碍，但空间战击队也遭到了金不败组合程序病毒的侵害。
为了更好的进行地球侵略活动腥疤疙的老板同意了金不败的倒戈，而空间战击队也正是收编为航星局的一部分，但空间穿梭机器的损坏让队员们感到非常不安。不光是空间战击队员们，还有任我行也以总工程师的身份重新回到航星局工作，不光修好了所有空间穿梭装备还制造出了可以即使达到犯罪现场的空间穿梭技术，这样空间战击队就能够及时的保护地球民众的安全。
能够变幻外形的水浪妖制造了人群大量失踪的事件，得知此事的空间战击队认识到了事态的严重性，而与之前的腥疤疙不同的是水浪妖对金不败非常的器重。再次出现的水浪妖展开了人类的搜捕，赶到的空间战击队员们揭穿了水浪妖的伪装并救出了被抓走的人类，来到反地图的他们遇到了金不败发明的拆爆王，一场恶战在所难免。
