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装甲騎兵ボトムズ ペールゼン・ファイルズ
正值百年战争末期，基利可·丘比在纵横交织的枪弹下生存。 另一方面，Pailsen被RED SHOULDER的丑闻事件包围而垮台。军队的首领决定将他处决，蛤去被情报省的次官沃茨卡姆从法庭救了出来。 对Pailsen留下的秘密文件志在必得的沃卡姆，目的在于对“异能生存体”的有用性进行实验，从而在战后得到地位。 于是在沃卡姆监视下的基利可，和被秘密文件挑选出的四人：巴可夫、哥登、扎奇、可恰克一起，不停地转战在过于残酷的战场上。“如果不是异能力，就没有生存的机会。”……
史上最大作战·泰巴斯渡河作战拉开帷幕。吉尔加梅斯军AT部队对守卫河岸的巴兰特军陷入苦战。填满空间的爆炸声与弹雨，奇利科也在其中。同一时刻，作为奇利科监视者的佩尔森大佐，因追究红肩队之罪而陷入军事审判的困境。
在泰巴斯所受之伤未愈，奇利科被配属到行星加雷亚德M7基地，遇到强韧的老兵戈丹、莫名照顾人的巴科夫，以及不知为何想杀奇利科的少年兵扎基。连短暂休息都来不及，奇利科便与戈丹一起遭到神秘狙击者袭击。
奇利科等巴科夫分队被送往前线基地X-2，在那里与另一名同伴科恰克合流。为让吉尔加梅斯军本队通过马尼德峡谷，被命令攻略防卫峡谷的巴兰特军。奇利科等人毫无彼此信任，乘滑翔伞突袭悬吊在峡谷顶上的空中要塞。
收到压制巴兰特空中要塞报告的吉尔加梅斯军地上本部开始通过马尼德峡谷，奇利科等人注意到科恰克漏击的巴兰特AT存在，再次探索空中要塞。突然，巨大物体开始在他们头顶下降，得知要塞炮已启动。
奇利科等人因从死之谷奇迹生还，虽暴露在怨恨与监视目光下，仍从事通常军务。AT整备训练中发生不可解事故，更甚，奇利科与戈丹再次被某人袭击。此时，行星库兹斯克情报省医疗收容所中，使用自白装置MRC的沃卡姆对佩尔森的审问开始了。
“被聚集的5人是什么人？”在行星库兹斯克，对佩尔森的审问更加激烈。另一方面，在加雷亚德，将巴科夫分队行动视为叛乱的宪兵出动，M7基地气氛骚然。奇利科与戈丹在愈发激烈的宪兵攻击下，被逼到储存莫大量聚合物凝胶液的储罐区。
前往极北基地的运输机突然遭袭，被迫坠落在荒野。地上等待奇利科等人的是来自某人的狙击。狙击者自称“吉尔加梅斯军净化委员会”，要求交出“死神希拉斯科”即戈丹，否则射杀全员。机内有5人和驾驶员2人。充满紧张、黑暗沉重的密室中，枪声催促7人做出决断。
失去运输机的奇利科等人在狂风暴雪中，靠AT徒步抵达极北的调配地。从加雷亚德全军撤退作业推进，空荡荡的基地中，只有被命令调查尤根特司令杀害事件的瓦普少尉等待。试图处理犯人的瓦普、巴兰特军AT部队，以及显出险恶天气征兆的异常寒波。这一切包围巴科夫分队。
被孤立在极北基地的奇利科等人。眼下巴兰特种大军逼近，头顶超寒气团开始卷成不祥漩涡。为在零下200度超低温中生存，聚合物凝胶液的调配被托付给科恰克。此时，瓦普抓住巴科夫的过去，强迫他告密。焦躁、纠葛、生命，一切都要被粉碎般逼近的时限中，五人的异能受到考验。
确信巴科夫分队不死的沃卡姆，在梅尔基亚最高战略会议讲坛上，为终结百年战争，动议规模压倒性的“行星莫纳德攻略作战”。在加雷亚德战线奋战、身负重伤的奇利科等人被移送至行星库兹斯克，终于与沃卡姆面对面。所有不规则运动合而为一，百年战争向行星莫纳德收束……
舰船与铁骑兵的天文学质量覆盖铁之行星莫纳德。射向空中的火焰描绘几何图形，每一瞬间夺走数万生命。奇利科等人率领漆黑的情报省特殊部队ISS，以星之中枢为目标。在这人工天体的玄室中等待他们的是古代昆特文明的遗产。在激烈的路途上，同行者无论敌我皆消散。但我们仍活着。我们不会死……
在漫长的一瞬间，四名男子凝视着眼前坠落的科恰克机。巴科夫分队看似终于失去了第一个人，但从着陆的AT中，科恰克虽然负伤却若无其事地爬了出来。“异能生存体是真的吗”——就在那安心之后，科恰克被敌人的枪弹击碎，戈丹力竭。在开始崩溃的行星莫纳德上，巴科夫分队的旅程结束。
