...
魔法使光之美少女！
即将升上初中二年级的朝日奈未来，在春假的某天晚上，看到一神秘物体从天落入附近的公园里。期待着“难道是魔法使！”的兴奋的未来第二天一早就和自小就喜爱着的绒毛玩具熊“毛芙伦”一起向公园前进。结果在那里看到的是……骑着扫帚漂浮在空中的女孩…！自称是理子的那个女孩子，竟然是魔法使！！ 未来对魔法使非常感兴趣，对理子问东问西的。理子好像是为寻找“某物”而来到未来居住的世界。此外，仔细一看，她们两人带着同样的吊坠…。 就在此时，暗之魔法使多库罗克希的部下巴提出现在两人面前！虽然他逼迫理子交出“波纹翡翠”（リンクルストーン・エメラルド，Wrinkle Stone Emerald），但是理子好像也在寻找“波纹翡翠”…。 当被巴提的黑暗魔法所诞生的怪物欲望怪逼入绝境时……未来和理子、还有毛芙伦手牵着手，不断地喊出魔法的咒文“Cure Up・Rapapa！”，突然吊坠发出了光辉。 于是，传说的魔法使“光之美少女”就此诞生！！！
朝日奈未来是一个即将成为中学二年级的13岁女孩。在一个月夜，未来目睹了一位魔法师女孩乘坐魔法扫帚从天空中掉落的场景。这位女孩的名字是理子。未来帮助了因为饥饿而力不从心的理子，但接着出现了一名可疑男子……！
成为传说中的魔法使光之美少女的未来和理子，带着会说话的绒毛玩具熊毛芙伦和未来一起回到了魔法学校。但是，因为带了一个普通的人类，校长老师很生气，几乎要将理子开除。为了保护理子，未来决定去见校长老师……。
在春假期间，未来决定去魔法学校学习魔法。她和理子、毛芙伦一起乘坐魔法地毯前往魔法商店街购买魔法道具，但在途中，她的链接石被像蜘蛛丝一样的东西夺走了……！
魔法图书馆。那里有一个校长老师也会迷路的“知识之森”。在魔法学校的补习课上追逐纸蝴蝶的过程中，未来前往图书馆，却迷失在了知识之森中。在骷髅党手下的加梅兹逼近之际，未来和理子被一本书引领着...
今天是第二次补习课。这次课比较容易掌握，是关于如何用比较简单的魔法水壶煮沸水，泡茶的课程。但是，艾萨克老师指定的任务是在覆盖着雪和冰的冰岛上煮沸水。要成功完成任务需要相当的专注力。在这样的情况下，为了抵御寒冷，未来和大家一起开始了某个行动。但是，只有理子没有参加...
补习课由教育实习生，也是理子的姐姐的理子老师负责。课程内容是使用魔法棒制作物品，并保持10秒钟。理子想要在姐姐面前表现出色，但却一直失败，最终与理子老师吵架并离开了课堂。
这次的补习课在人鱼之村进行，补习的内容是声音练习。要通过声音打开紧闭的马尔贝壳。大家都很难打开贝壳而苦战。这时，未来和理子结识了三个人鱼孩子并成为朋友，被带到了一个秘密场所。
这次的补习课是与飞翔在空中的飞马一起合影留念。虽然未来还不太会乘坐魔法扫帚，但她充满了干劲，追着飞马。但是，她却意外地掉进了森林里。在那片森林里，未来和理子找到了一些东西...
最终的补习课终于来了。内容是进行魔法对决，让对手的花开放。参加补习的未来等五人组成一个团队，挑战与理子老师的魔法对决。但是他们一个接一个地失败，最后只剩下未来和理子还在坚持。
校长先生告诉理子下一个林克鲁斯通会出现在无魔法界，理子追着未来乘坐着蜗牛列车前往卡塔图姆里。一到车站，两人就发现了林克鲁斯通·托帕兹。但是，一只乌鸦叼走了托帕兹，飞到了某个地方...
理子住在未来家，也开始上学了。但是，明明不能让人知道使用魔法，却被人看到了骑着扫帚上学的地方，偷偷跟来的毛芙伦被小哈发现了，手忙脚乱。毛芙伦注意到了甜美的气味，但是……
从今天开始未来和理子所上的中学开始上课了。在魔法界是优等生的理子，但因为魔法界和无魔法界有不同之处，进行得不太顺利。未来对于不和未来她们一起玩，一个人关在家里房间预习的理子……
未来和理子她们来露营场烧烤。带着校长老师信件的理子在那里等着。未来兴奋地开心准备着烧烤，但第一次的理子不太明白方便的电器制品和不使用魔法的理由。
数学考试的试卷发回来了。未来不及格要补考，但理子是班上唯一一个满分。未来很消沉。鼓励为了补考而学习的未来，并一起学习的理子。未来知道了理子一直在努力……
肚子饿了的哈酱，但是未来和理子都不管她，没办法只好自己用魔法变出早饭吃了。吃饱了的哈酱，好像每次打喷嚏都会变身。就这样去外面玩，被大家目击到引起了大骚动！
从魔法界一起来补习的魔法学校同班同学准、慧、艾米丽，还有裁缝师傅弗朗索瓦来无魔法界玩了。马上带领大家游览街区的未来和理子，必须注意不让人知道大家是魔法使，非常辛苦！
从一张照片，聊到了奶奶在像现在的未来这么大时遇到的不可思议的男人，至今难忘。在意回忆中的人的未来和理子，在水晶小姐的协助下，为了寻找回忆中的人走上街头，但是……
收到了来自加梅兹的挑战书，未来和理子为了夺回被抢走的石榴石，前往魔法界。面对变回本来面目魔法战士的加梅兹，光之美少女倒下了。那时，哈酱想要阻止加梅兹……
为了向校长老师请教救了光之美少女危机的、哈酱不可思议力量的秘密，未来和理子去寻找不见了的校长老师，听说在支撑着学校、俯瞰下方的大树顶上，有一扇只有校长老师能打开的门，立刻前往，但是……
未来、理子和毛芙伦，想着校长老师打开了魔法之门，那里是多库罗克希的大本营。多库罗克希的真身，是校长老师的朋友库西。校长老师解放了一直封印着的魔法之力，挑战多库罗克希，但是……
