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凡间百姓若遇坎坷离合会去求神拜佛，可若是神仙呢？该剧讲述了上古界四位真神中白玦与上古之间几经生死离别的情深虐恋。以上古的成长为主线，从灵力低微的小“菜鸟”成长为身负苍生之重的主神，却终究逃不过命运的劫难枷锁。神生长远，情根深种，有人为了她不惜毁天灭地，即使三界化为虚有也在所不惜，有人默默等待了六万年，用自己还给她三界永生。九州八荒之下，她又是否能够承载这一场超越三生三世的亘古之恋？
神界伊始，祖神创神、仙、妖三界，传灵力修炼之法，后破碎虚空而去。神界至高无上，听四大真神令统领众君。神界内，两名窈窕身姿的曼妙少女嬉戏于琼花之中，其中一名少女天真浪漫，她便是上古真神，而伴于她身侧的星月女神名为月弥，二人结伴前来掌管三界姻缘的姻缘祠中，此姻缘祠正是普华神君所办，月弥心有所属，她进祠中祈求姻缘，上古看着这祠中的恩爱佳人，不由得捏起法诀，想促成一对对神仙眷侣。孰知，上古学艺不精，她捏法诀闯下大祸，被掌管天界的真神炙阳所知，上古与月弥连忙离开姻缘祠。
上古收下了女神君的贺礼，将一众女神君带入长渊殿，众女神为讨白玦欢心都使出全身力气，白玦只心底生气。次日乃是上古寿辰，白玦前来与上古说个明白，他下令让女神君不得再踏入长渊殿半步，且他已然决定下界，他是万万没有想到堂堂混沌主神竟会为了俗物将他出卖。白玦的大发雷霆令上古错愣不已，而天启得知了白玦大骂上古之事，他前来找白玦算账，白玦这才得知原来上古带女神君入殿并非是贪图重礼，而是收集了众女神君最真情的喜乐，打动了血森林的虎妖，让虎妖展开笑颜。
上古勤于练剑，她如今神力大增，心性也改变不少，往日白玦惯用的激将法对上古也不再适用。随后，白玦回到神界，天启与炙阳都让白玦要好生对待上古，万不可打骂上古，白玦不以为然，他此次前来是想要取四样神器给上古，凤凰羽、玄龟甲、奇龙角及玄金铁，听到白玦已为上古开通神脉，天启与炙阳不由得有些意外，炙阳给了白玦三样神器，只不过玄金铁在北海，白玦需自己前往北海走一趟。临走前，炙阳告诉白玦，上古神脉已开，只怕不久便会迎来第一次天劫，白玦在上古身边还需小心些，切莫大意。
上古正与白玦闹着脾气，月弥受上古所托前来向白玦要回上古的混沌之源，红日将白玦早已准备好的混沌之源交给月弥，月弥看着灵力如此浓厚的本源不由得有些意外，认为白玦教导有方，她与天启教导上古数万年都没有此效果。另一边，上古偷偷溜进长渊殿里，正好看到白玦在打坐入定，她上前取混沌之源，却迟迟找不到取出之法，忆起自己将本源送进白玦体内的那一幕，上古红着脸准备吻白玦，从白玦口中要回本源。不料，白玦醒来，上古这才知晓白玦并未入定，她满脸羞涩，嚷着要跟白玦一刀两断便回了自己的殿内。
白玦因幼时经历不喜与他人相处，上古紧握住了白玦的手，她认为人与人之间的相处不应只有冷漠与苛刻，往后她会一直陪伴着白玦，二人共同进退。看着眼前紧抱着自己的小姑娘，白玦在此刻已红鸾星动，他也控制不住地抱住了上古，享受着此刻的温暖。天启担忧炙阳回来会罚自己，月弥在一旁安慰着天启，可在知晓天启心心念念只有上古一人时，月弥不由得心底失望，而日神与月夜依旧因姻缘神而缠在一起，就连天启与月弥也难得将二人分开。另一边，普华来到欢喜室，他看到白玦时不由得为自己捏了一把汗，如实将自己的目的告诉白玦，他是为了促成天启与上古的姻缘而设下此宴，只不过他误将白玦看成了天启。白玦并未重罚普华，只让普华不得再管真神姻缘，且今日之事普华只能当作没发生过，他不希望听到有关于此事的流言。
上古一身素色衣裙前来寻白玦，白玦不在殿中，她只好拿了风筝准备自己外出玩放。不料，雪迎也前来寻白玦，她撞坏了上古的风筝，并对上古口出狂言，称上古不过就是占了混沌主神身份上的便宜而已，否则以她的行事作派，哪能得白玦相看一眼。雪迎笑上古灵力低微，不配为三界主神，她想与上古比试一场，让上古输得心服口服，上古一口应下，二人于桃渊林中比试，由众神君见证。
白玦从南海城的人手中救下了凤焰与梧夕，梧夕犯下大错，正当白玦准备诛杀梧夕时，上古及时拦了下来，她希望白玦能放走二人。白玦执法严厉，不肯放走二人，凤焰为救梧夕愿意担下一切过责，她的元神愿随二人回凤族。因着凤焰的主动，再加上古的求情，白玦这才愿意饶过梧夕，可这时的梧夕已经失了分寸，他拼尽一切想夺回凤焰，却误伤了上古，上古昏迷前要求白玦不要杀梧夕，白玦也只好作罢，带着上古回凤族。
弑神花盛开之时会释放出混沌之力，唯有三界主神才能将其吸收，极利于炼成世间最强的混沌之力，玄一让白玦将上古交给他，不出千年他定还白玦一个混沌主神。白玦没有听完玄一的话，他来到乾坤台，不由得想起先前的预示，心知只有让上古成为混沌主神，才能改变她既定的命运。白玦请上古到长渊殿一趟，上古盛装打扮赴约，她直接换上了天择日的礼袍，白玦眼中闪过一抹惊艳。
白玦因九爪莲之事向上古道歉，他愿意借出暗渊之境助上古修炼渡劫，且他还炼制了一颗能助上古冲破寒脉的丹药。看着白玦的用心，天启不免心急起来，他让想上古拒绝白玦，可上古却满心欢喜白玦对她的付出，她提起自己与雪迎的赌约，想知道若是她赢了赌约，白玦是否会取消让她独自前往九幽的念头，可在看到白玦紧抿的唇瓣时，上古还是自嘲一笑，终究还是她自讨没趣了。
上古于九幽中吸收着弑神花的混沌之力修炼，魔族不断挑衅上古，上古并非是妖魔对手，白玦元神暗中相助上古击退妖魔，且挥动着古帝剑带着上古找到了灵芝伤药。看着上古累到睡着的模样，白玦只安静守于上古身边，他知道上古对他的情意，故在上古眉间落下一吻，待上古继承主神位之日，他便会将自己的心意一一告知上古。
上古独自一人以一把古帝剑破了穷奇的攻击，挡下了墨羽的招招式式，担起了主神二字，也受得了众神的一拜，就连其余三大真神都对上古行起上神之礼。此次穷奇攻击乃墨羽与雪迎设下之计，炙阳问起雪迎如何得知穷奇攻击一事，雪迎只称她是无意撞见便前来通报，她欲重回神界，炙阳只当她是千年已真心悔过，便让雪迎回了神界，继续执掌四季。
白玦与上古在下界一同诛杀穷奇，白玦如今本源虚弱，一场打斗下来耗尽了白玦不少灵力，上古当场渡灵力给白玦，她已不再是千年前那个需要白玦护着的小丫头，如今她也能护着白玦。天启与炙阳得知了穷奇祸乱一事，妖界是天启的地盘，故天启前往妖界查看，却意外发现了玄一的计谋，玄一有意让上古接管主神令，成为真正混沌之神便是为了替他挡劫。上古是天启心中挚爱，为了上古，天启愿意叛离三界众生，背上骂名，哪怕陷入万劫不复之境。
上古用混沌之神与梧桐树心为白玦炼药，她已决心陪着白玦共度生死，不管未来会发生何事。尔后，白玦醒来，他查起了紫涵所盗之物，震惊发觉天启欲启动灭世阵法，灭世阵法祸及三界，上古与白玦均不信天启会是夺主神位之人，他定是有苦难言。上古前来向月弥借寻仙铃，月弥与天启相识数万载，她知晓天启定不是会启动灭世阵法之人。看着月弥对天启无条件的信任跟着急，上古知晓了月弥心仪天启，她从月弥处借来了寻仙铃，并允诺月弥，不管日后如何，她定不会让旁人伤了天启半分。
天启听到上古之名，他再度对月弥冷言冷语，逼月弥离开阵法。月弥猜测到了天启启动灭世阵法是为了上古，她想要陪着上古共患难，哪怕前路是遭三界唾骂，她也愿陪着天启。天启正欲被月弥打动时，芜浣暗中偷袭了天启，月弥为天启挡了一击，倒在了天启的怀中。天启欲杀了芜浣，可月弥不愿意看着天启做错事，她拦下了天启，如今她神力本源震碎，再无回天之术，神生漫长她终于走到了尽头，也将自己的心意告诉天启，她喜欢天启。天启一直都知晓月弥的心意，只是他一直不敢面对，他怕失去月弥，却没有想到今日，月弥会为了救他而死在他怀中。
白玦从天启的命盘中得知了天启宁毁苍生也要夺主神位的苦衷，天启欲以三界生灵殉世来化解混沌之法，可他却亲手将天启的化解之法毁了，是他害了上古，一步步将上古逼进她的命运里。朝圣殿里，上古如今已不顾其他，一心只想炼成主神羽令，继承混沌主神之位，给众神一个交待。白玦前来拦下上古，他称自己在长渊殿观星，却想着上古还欠他一个约定，故邀上古前往桃渊林完成二人的约定，上古深知如今的情势，只能狠心拒绝了白玦，可白玦却出言相求，他紧抱住了上古，只希望上古今日能赴他一次约。
白玦留下手链，他不许上古这样死亡，三界既在，上古身为混沌主神也应当同在，故白玦消耗本能只愿能留下上古最后一丝神识。混沌之劫因上古的牺牲消弥，玄一欲卷土重攻神界，以报自己七万年来的被困之苦，而白玦与炙阳也猜测到了上古之死与玄一脱不了干系，一切都是玄一布下的局。玄一率魔族出兵神界，炙阳与白玦率神兵抵挡，所有神君齐心协力一同应战，雪迎知晓玄一的目的，她真心爱慕白玦，为怕白玦出意外，雪迎前去偷袭墨羽，以自己的本源之力与墨羽以死相搏。
两名下界散仙无虚无妄偷溜进清池宫，欲取清池宫一瓢仙泉饮，却被清池宫的长阙撞见。二人一见长阙便匆忙离开，将火珊瑚落在了清池宫。凤柒知晓这是紫金府的寿礼，两名下界散仙是紫垣之人。纵然紫垣欺清池宫至此，但如今古君不在宫中，后池又灵力低微，凤染决定忍一时，少生些风浪。长阙不解凤染话中之意，明明后池的修为大有长进，凤染轻摇头。原来，后池的灵力并没有见长，她之所以通过凤柒的考验，是因为凤柒看到了她的努力，凤染不愿意让后池失望，这才在考验之时也暗中出手相助后池，让后池误以为自己的灵力大增。
紫垣与凤染争吵不休，景昭出面解决，紫垣当着清穆、景昭与众仙之面，口口声声称凤染勾结妖族之人，景昭欲将凤染拿下。清池宫不在天宫管辖范围之内，凤染身为清池宫之人，她断无可能任由天宫之人拿捏，且她无勾结妖族之行，根本无惧紫垣的污蔑。火珊瑚上有着紫垣的气息，紫垣略一施法便探出了火珊瑚在凤染身上，凤染干脆将无虚无妄闯清池宫盗仙泉一事道出，要求紫垣给清池宫一个交待。景昭向来跋扈任性，她并不将清池宫放在眼里，当下只命紫垣将凤染拿下，凤染因此在殿中与紫垣交起手来。
清穆坦白告诉后池，他苏醒于北海却不知自己是何人，清穆一名是他自己所取，他苏醒之时全身上下除了一个手链一无所有，尔后他云游三界遍寻自己身世，后池与她手中的手链是他如今得到的唯一线索，他这才想同后池一起寻找柏玄。听此，后池也不再对清穆抱有成见，她将柏玄之事告诉清穆，柏玄是她清池宫之人，她待自己如亲妹妹一般，只不过万年前柏玄离开后就再也没有回来，她此次去瞭望山便是准备寻柏玄，只不过竹屋里空无一人，只留下一把扇子。此扇是紫月妖君的法器，她怀疑柏玄跟紫月妖君有关，这才前往妖界。
凤染想靠着进花楼的借口甩掉景涧，景涧却想同凤染一起进花楼，凤染无奈，只好同景涧一起进花楼。清穆与后池来到玄晶宫门口，二人正头疼着要如何混进玄晶宫，正巧看到了玄晶宫二殿下森羽正在挽留狐族的少主常沁，二人本是千年前就已定下婚约，可当年一场仙妖大战中，狐妖小漓为了救森羽而奉出了自己的本源之丹，再也化不成人形，森羽便决定照顾小漓一世，常沁乃狐族少主，她受不得这侮辱便执意离开玄晶宫，森羽却一直苦苦挽留，二人还因此在玄晶宫门口大打一场，让清穆后池这一行路过之人看了场热闹。看热闹之时，后池问起了清穆体内的妖力，她在生死门口见识过了清穆的不凡妖力，清穆只道他的妖力与生俱来，只有当他释放强大灵力之时，才会偶尔不受控制，这也是他想尽快找到柏玄的原因，他想知道自己的身世。
