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黒魔女さんが通る!!
灵异事物狂热粉黑鸟千代子在帮同学做恋爱占卜时，竟阴差阳错招来了黑魔女秋比特。秋比特声称，只有将千代子训练成合格魔女才能返回魔界。于是不管千代子怎样拒绝，她只能在秋比特大人的命令下展开艰苦修行。在此期间，她必须兼顾自己的小学生身份，在超级自我的紫苑惠、无论什么都要成立委员会的一路舞、帅气的男孩三条翔等人的环绕下，小魔女别开生面、妙趣横生的爆笑校园生活就此展开……
喜欢神秘学的小学5年级学生黑鸟千代子（通称巧克力），被同学拜托用恋爱占卜召唤恋爱丘比特，但那天正好鼻塞……
班级委员小舞设立了“1组大家一起变友好委员会”，周末大家一起去骑自行车。巧克力想阻止这个计划。因为巧克力都5年级了还不会骑自行车！
东海寺阿修罗和麻仓良太郎总是为灵异现象是真是假大吵。对两人的争吵厌烦的班级委员小舞设立了“灵异争论委员会”……！？
5年1组来了转校生罗门露露。对露露酱一见钟情的是色狼王牌小岛直树。露露酱似乎也不是完全没意思……！？
蓝川结实非常喜欢动物！光是走路各种动物就会靠近。绰号动物女王。像平时一样在公园疼爱野猫时，取名为“拉比酱”的黑猫不见了。
对时尚不关心的巧克力被梅格带去原宿购物。被梅格搭配各种衣服的巧克力。正想着好想回去啊……这时……！？
今天去比久井山远足。但是，在山路上向井里鸣不见了！父亲是名侦探的要陆君以日本波洛自居的推理寻找里鸣。
小舞设立了“天气好的星期天在公园吃便当委员会”，大家来野餐！女孩子们忙着向1组的偶像三条翔推销便当。
5年1组的须须木凛音说从小学入学以来运气就很差。这样的凛音来到巧克力的房间，向熟悉灵异的巧克力哭诉，希望想办法解决自己的坏运气。
决定出演扮演魔法师介绍自己班级的电视节目“扮演魔法师教室”的5年1组来到电视台。大家第一次来电视台很兴奋，但是……！？
5年1组的宫濑灯子是父子家庭，照顾弟弟妹妹的温柔姐姐。巧克力想让她在温泉悠闲一下，于是用魔法把小学变成温泉旅馆！
前往临海学校的途中，突然出现在电视画面上的是魔界情报屋恶魔情！“问题。这辆巴士穿过隧道就会爆炸。请用黑魔法救大家”
在魔界成为灰姑娘的巧克力。为了得到王子的爱去参加舞会。那个舞会上，梅格、小舞和小百合排着队等着和王子跳舞！
梅格带着亲戚的桃酱来了。为了自己去玩，把小学2年级的桃酱推给巧克力照顾。无奈之下巧克力带桃酱出去。
桃酱的真名是桃花·布洛萨姆。真身竟然是黑魔女！是吉尤比德上过的魔女学校的后辈。桃花·布洛萨姆正准备举行献给恶魔的祭品仪式。
今天是课堂参观。代替不能来的妈妈，变装成妈妈的吉尤比德来了！“巧克力～来了哦～！嘻嘻嘻嘻～”太过羞耻，巧克力切盼课堂参观早点结束。
小学运动会快到了。每天都有练习，但运动白痴的巧克力非常忧郁……大活跃的是转校生铃风沙耶香。沙耶香运动神经出众，是班上的人气王。
转校生铃风沙耶香和巧克力一样是黑魔女见习生！她说为了因病住院的哥哥手术成功，要举行“向天诅咒神的仪式”。那到底是什么样的仪式呢？
唱了魔界法律禁止的契约妨碍咒文的吉尤比德从巧克力面前消失了……而且巧克力周围有魔界警察们埋伏。
被通缉的吉尤比德她们，为了拯救母校王立魔女学校的危机，不顾危险来到魔界的巧克力、吉尤比德和桃花。巧克力，在魔界逃跑！
