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海军罪案调查处：夏威夷
一架实验性海军战机在瓦胡岛坠毁，简·坦南特及其团队必须赶在机密国家情报泄露之前，揪出幕后黑手。
坦南特和NCIS必须铲除一伙臭名昭著的国际盗贼——这群人动用了二战时期的烈性炸药来袭击装甲运钞车，企图在完成最后一笔“大买卖”后销声匿迹。凯在为自己物色新的住处；露西和惠斯勒因之前的一次接触而陷入冷战；厄尼的外勤任务惊险程度远超他的预期，把他吓得够呛。
在一起军士谋杀案中，这名军士原本试图帮助失足少年在海军陆战队重获新生，凯为此打入夏威夷历史最悠久的冲浪帮派之一做卧底。
一名身为海军陆战队员的夏威夷牛仔在野外骑马时遭到枪击，伤势严重。团队展开调查，起初这名队员声称自己是在骑马途中意外遭猎人误伤。经核实，他的说法并不属实。当团队返回医院准备进一步询问时，却发现他不顾伤势擅自离开了。原来，一位亲戚协助他出院，而特工们在这位亲戚处发现了一包装满毒品包裹的袋子，推断这些毒品属于该队员的儿子。这名少年原本被贩毒集团胁迫运送毒品，却中途改变主意，因此其父亲试图保护他。但贩毒集团为达成目的将不择手段，团队必须与时间赛跑找到这对父子。与此同时，凯的父亲一直讳疾忌医，拒绝去看医生，凯不得不搁置复杂的个人情感去帮助固执的父亲。
一名日本水兵在美军基地内遇害，证据直指其远在日本的女友早前惨死一案，NCIS必须抢在冤案发生并引发美日外交危机之前，找出真正的凶手。
坦南特与NCIS奉命寻找一位被绑架的环球社交媒体明星，却逐渐发现她的真实身份远非其丈夫或粉丝所认知的那样简单。同时，团队与怀有私心的国防部调查员惠斯勒产生了严重分歧。
一名海军军士惨遭谋杀，简与团队在调查的同时，必须全力保护受害者的一名朋友兼同事，她掌握着破案的关键线索。
一名反资本主义的抗议者遇害，简和团队在调查中发现自己被卷入了一场生态活动家与科技亿万富翁争夺一块土地的战争。此外，简与海军上尉乔进行了第一次约会。
正值珍珠港事件80周年纪念之际，NCIS团队重启一起涉及二战时期遗骨的悬案。经深入调查，他们震惊地发现，这些遗骸竟然属于一名当年在袭击中幸存、如今已百岁高龄的亲历者。
NCIS在调查一个装满违禁武器的集装箱时，与惠斯勒率领的国土安全部团队狭路相逢。同时，坦南特在是否逮捕亚历克斯好友的父亲这一问题上陷入两难，因为她心知肚明，一旦逮捕对方，亚历克斯的好友将被迫搬家离开。
用于扳倒大毒枭的关键证据不翼而飞，露西卧底潜入一场地下扑克锦标赛，以查明是哪位豪赌客在幕后操纵。与此同时，惠斯勒的前女友突然现身城内，这让露西的情感世界陷入了矛盾与挣扎。
NCIS调查海军工程师约瑟夫·陈的神秘死亡，他们了解到他最后见到的人是玛吉·肖——简的导师兼好友，她随后遭到绑架。一名新西兰情报官员戴维·索拉抵达夏威夷追踪约瑟夫之死的线索，这起案件牵涉到中国的绝密黑色行动。
在调查玛吉被绑架的过程中，坦南特震惊地发现了其这位好友过往的真实身份。她带领团队全力收集证据，试图向她曾经的上司证明自己的惊人发现。
简·坦南特因与一名被策反为中情局间谍的“好友”关系密切而面临严苛的内部审查。她的团队则着手调查一起匪夷所思的案件：在拥挤的海滩上，一队进行两栖登陆训练的海军陆战队员成为了超声波武器袭击的“唯一”受害者，现场的其他游客却毫发无伤。惠斯勒从国防部调职到联邦调查局，加入联合小组后再次与露西产生了交集。
杰西正享受着与女儿格雷西的出海时光，一群海盗却突然从天而降，持枪控制了游艇，并将船上所有乘客劫为人质。杰西在反抗中受伤，情况危急。千钧一发之际，他的团队必须争分夺秒锁定游艇位置，解救他的女儿和其他人质。
凯以厨师身份潜入一家本地餐厅卧底，刺探一位与餐厅有关联的恶名昭彰的犯罪头目的情报。此外，简发现大陆的一所学校以棒球奖学金为诱饵招募了亚历克斯，而亚历克斯一直对家人守口如瓶。
一场勒索软件攻击导致水坝控制系统发生严重故障，夺走一名海军军士的生命。危在旦夕之际，计算机专家厄尼临危受命，紧急召集并带领一众顶尖黑客，誓要在全岛水电中断之前锁定真凶。与此同时，露西和惠斯勒联手行动，这给了惠斯勒一个向露西道歉并修复二人关系的机会。
NCIS探员尼克·托雷斯和杰西卡·奈特来到夏威夷，他们得知自己旧案中的一名关键证人已经带着至关重要的证据潜逃到了这里。这起案件是一场特别的跨界联合行动。
NCIS团队调查了一艘载有外来野生动物的沉船，这些危险的外来物种如今正严重威胁着瓦胡岛脆弱的原生生态，调查发现这一切与一名野生动物代理人的贪婪走私密切相关。此外，亚历克斯在一场关键的棒球选拔赛中遭遇了跟腱断裂的终结性重伤，棒球生涯前景暗淡。凯则鼓起勇气，约鱼类和野生动物管理局的梅兰妮探员出去约会。
一名海军下士兼职网约车司机时卷入了一起谋杀案，NCIS团队在休息日被紧急召集处理此案。此外，露西发现，惠斯勒为了能留在夏威夷陪伴自己，毅然婉拒了联邦调查局在华盛顿特区的晋升良机。
