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玉儿2岁时家中巨变，被义父吴啸天收养，教授其医术。义父临死前让玉儿不忘家仇。后玉儿为复仇进入药商杜远山府上做丫鬟。当玉儿达到自己目的时，杜远山告知当年的真相，并且给了玉儿盘缠让其离开杜家。后杜府面临困境，玉儿因怀愧疚愿回杜家帮助渡过难关。杜远山之子杜明海早已对玉儿有情，他信玉儿真心帮助杜府，杜府上下却误会玉儿，杜远山却让她再进杜府。玉儿展示非凡医术和管理能力，成为杜府大管家，杜远山临终前将家业托给玉儿，玉儿也找到了失散的哥哥，即杜府大少爷杜明江，可杜明江却被欲望迷蒙了双眼，走上不归路。抗战爆发后，玉儿坚守杜府药厂，在新四军的帮助下，为抗日力量提供药材，为千万抗日战士制造良药。
幼女东方靖琪一夜之间父母、兄长均被杀害，东方靖琪被义父吴啸天所救，改名吴小七。十六年后，小七陪同吴啸天重回暨阳县，路遇杜府大管家王富贵率领众家丁参与暨阳码头经营权的拍卖会，吴啸天对于人们口中的杜家老爷产生怀疑。小七与吴啸天在路边面摊歇脚，看到有人在路边办理丧事，小七前去凑热闹，发现已被惠民医院判了死刑，即将入殓的“死者”只是假死还有得救机会，没想到引起了“死者”女儿石友琴的误会，产生了冲突。身为巡警队长的马家少爷马致远在街头枪杀武疯子，救下杜家二太太和小姐杜明溪。小七令“死者”起死回生，被救活的“死者”女儿石友琴对小七千恩万谢。小七的张扬个性和精湛医术令赶来的马致远为之倾倒，谁料刚被救活的石老汉又倒毙，让小七不知所措。身患重病的吴啸天告诉了小七当年的惨案，并让其发誓要为家人报仇，找回《神农药典》。小七心事重重地走在暨阳路上，遇到了因马家与杜家争拍码头经营权失利而急火攻心生命垂危的马老太爷，小七施针救活，并告知马万年此时已是回光返照赶紧料理后事，却从谈话中得知仇人杜远山的消息。最后马老太爷仍死于惠民医院，马万年认为因有世仇，杜明江故意拖延治疗导致父亲死亡，带人围攻酿成医疗纠纷。马致远听闻消息前往医院，与刚从乔司监狱刑满释放的杜家二少爷杜明海发生争执。
小七见事情愈演愈烈，决定趁此机会给杜家留个好印象，以便将来好接近杜家实现自己的报仇大计。此时爱财如命的警察局局长肖金水出面调停，小七用药理知识层层剖析，认为责任不在惠民医院，而是马家无理取闹。杜明江对这个突然出现的外地女郎中生出爱才之心。马万年因医院的事情心生不忿，派人报复小七，要将其赶出暨阳县城。小七在与马家家仆争斗中失手将其误杀，被当街巡逻的马致远遇上，当场抓回警察局。吴啸天病危，将责任揽在自己身上，嘱托小七勿忘家仇后撒手人寰。杜明江因小七医术高超，并且在医院为杜家说话对其产生好感，与杜远山商量，欲招小七至惠民医院坐堂。
马万年约了杜家码头工人大朱哥在茶楼见面，想要买通他为马家做事。恰逢革命人士李凤凰和石友琴在此接头。肖金水接到上级通知亲自带队在茶楼附近做埋伏。行动展开，马致远上楼抓捕，却被识破。李凤凰二人利用马万年跳窗逃跑。石友琴在逃跑过程中遇见了小七。因为之前的事情，小七有所愧疚决定帮她一把，放走石友琴。李凤凰却不幸中枪被捕，身负重伤，危及生命。小七不忍，说服肖金水救治李凤凰，小七运用自身高超的医术将李凤凰成功救治。
杜明海出狱后被杜远山勒令不准回府，只有大哥杜明江暗中给他送大洋。杜明海被逐出杜家，肖若云仍痴情以对，哥哥肖金水对此大为光火。杜明海在赌馆中用一根手指头做赌注，换了一百大洋，可惜却碰上了仇家马致远，手气不好，全盘输光。杜明海用手作抵押与马致远继续对赌，再次输光。小七替杜明海出头，在赌桌上保住了杜明海的手。马致远不服气，认为杜明海还欠一只手指头。众人起哄，杜明海万般无奈，举刀剁下第六指。小七连扎数针在杜明海左手，这是银针止血及刺穴消失痛感。杜明海被小七所感动，由此对小七心生爱意。
肖若云前来码头看望杜明海，心疼杜明海身无分文，居无定所。她希望哥哥肖金水能够帮杜明海一把，在她手底下干活，不料肖金水、杜明海二人一见面就开始争吵，不欢而散。小七在街上看到杜家要招买丫鬟告示，想到也许只能借此机会进入杜家来完成复仇大计，当场决定自卖自身进杜家当丫环。杜府大太太亲自面试，经过层层的选拔，小七很快脱颖而出。
小七给杜远山和二太太送银耳汤，杜远山与其聊了几句，杜远山从小七的对话中找到了几个破绽，让王富贵私下好好调查一下小七的身世。小七凭艺术取得二太太信任，但却因二太太软弱可欺，在杜家依旧立足未稳。大太太等人觉得小七入府动机不纯，千方百计刁难小七，想要将她赶出杜家。小七开始加速复仇行动，一方面暗中寻找祖传的《神农药典》，另一方面在杜远山常用的熏香中掺入慢性毒药。
杜远山和王富贵两人商谈与马家之间业务上的竞争，对王富贵的工作十分满意。商谈完毕让王富贵离开，并让他叫小七送一碗银耳汤来。杜远山久久凝视着桌子上的熏香，对小七的疑心越来越重。杜明江找肖金水打麻将，实则是暗地里行贿，私下找肖金水帮忙，诋毁马致远上杜家闹事给警局抹黑。肖金水强烈反对肖若云和杜明海混在一起，对经常变相送钱给自己的杜明江十分青睐，坚持认为肖若云只有跟杜明江才会有幸福。杜明江则对肖若云家的势力颇为看重，想要娶到肖若云让自己这个养子能在杜家站稳脚跟。
李歪脖等人在码头卸货偶然发现了里面暗藏军火，李歪脖见状不妙赶忙去找杜明海。小七在给马致远治病中无意得知此消息，想要揭发检举杜家趁此机会报仇。马万年将此事汇报给了肖金水，肖金水当即下令抓捕相关人士，扣押军火。杜明海得知此事，立即封锁了码头，让李歪脖通知大管家，查找货物底单。可惜准备时间不足，货主前来提取货物，被杜明海等人阻挠，双方爆发了激烈的冲突，原来这群人是附近铜锣寨的山匪，马致远带领警察及时支援，制服了山匪，同时下令将杜家相关人等羁押。小七连夜赶到县政府向县长检举此事，并献计先抓杜远山。
县政府外，杜远山和王富贵被押上了断头台。行刑时辰到，杜明海飞奔赶到现场，大喝：刀下留人！杜明海带着码头上的兄弟出现，几个码头工人抬着一具尸体，正是那个提货的山匪。杜明海拿出提货单等证据，呈给县长等人。县长无奈放人。杜家码头的经营权被马万年和肖金水合谋夺去。杜远山急火攻心，猝然病倒。小七无意中与杜明江的对话中得到了关于《神农药典》的消息，她潜入杜家已逝的二老爷杜远川别院，却被春儿发觉，王富贵出现帮助小七解围。小七决定先下手为强，毒杀杜远山，逃离暨阳县。事情如期进行，小七喂杜远山喝下毒药后，将灯笼打落，杜远山卧室很快起火。小七赶忙收拾行李逃离杜府。
二太太发现杜远山房间失火，众家丁急忙救火，同时也发觉小七失踪。大太太认为此事和小七脱不了干系，立即派何家宝等人追捕。小七欲从河边上船走水路逃走，可惜却被何家宝等人追上。小七被何家宝押着提到大管家王富贵面前。小七称父母大仇已报，死也无憾。王富贵却告诉她杜远山没死。原来杜远山提前知道小七要对他下手，在王富贵的帮助下，分散小七的注意力，将毒药倒掉。杜远山告诉小七当年的真相。当年小七父母利欲熏心，为夺走《神农药典》杀害了杜远山的二弟杜远川，小七父母才是恶人，并拿出证据。小七当头一棒，内心对于当年的事情已经有了动摇。不久暨阳街头新开出一家以德大药房，马致远发现店主竟然是小七——现恢复原名东方靖琪。以德大药房，药材质优价廉，得到百姓的认可，生意非常好，引起了杜府大太太、马家马万年等人的警惕。
杜明海和马致远因为东方靖琪而展开竞争，两人无事就去以德大药房帮忙，两个人针锋相对。二太太怂恿杜明海与本就喜欢他的肖若云交往，想借助肖若云警察局局长之妹的身份，迫使杜远山同意杜明海早日回府。而大太太也为巩固杜明江的地位，极力想促成杜明江和肖若云的亲事。
被割掉一只耳朵赶回来送信的胖大海惊恐称杜远山进货途中被山匪绑票，山匪索要十万大洋赎金。杜明江稍加思虑，想杜远山若被撕票，杜家产业就将是自己一人独霸，于是去警局报案。东方靖琪察觉到杜明江不顾杜远山死活。东方靖琪和杜明海二人偷偷前去东白山救杜远山。上山途中，偶遇下山去请大夫的山匪，杜明海将其打晕，二人准备乔装进匪窝。
东方靖琪在铜锣寨中找到了隐藏其中受了伤的杜远山，杜明海冒名顶替被识破，二人不幸被俘，成为山匪的人质。杜家得知东方靖琪和杜明海被抓，顿时乱作一团。十万的赎金还没凑够，又添两万。杜明江一面假装积极救援，一面中饱私囊用假币换掉赎金。杜明江拖延时间，匪首山鬼见杜家迟迟不来赎人，派人去山下打探消息，得知杜家报警，一时大怒，派人将三人绑了起来，并下令隔一个时辰砍去一根手指头以示惩戒。危急时刻，山鬼之妻难产，东方靖琪自告奋勇接生，三人得以暂时保住手指。没想到产妇竟然是熟人，是东方靖琪刚来暨阳时所遇到的石友琴。杜明江终于来到山寨赎人，山匪检查之后，准备放人。
马致远等人在山脚等待杜明江的信号，可惜杜明江却早有算计，派何家宝埋伏，想要置杜远山于死地。何家宝冒充山匪出现，与杜远山缠斗，不料被杜远山制服。杜明江情急之下拿起木棒袭向杜远山。东方靖琪终于接生成功，石友琴觉得欠了东方靖琪很大人情，让山鬼听东方靖琪的。山鬼道出了自己劫持杜远山的真相，因为姐姐李凤凰被抓，政府明码标价要十万赎金，为救姐姐，山鬼只能劫持杜远山来凑钱。东方靖琪因为山鬼的义气和刚出生的孩子，决定留下做人质，帮助众山匪出逃。
杜远山虽保住一条命，杜家却因此遭受重创，因失去周转资金，面临停产。杜远山有心无力，同时也因为杜明海两次冒死救父，杜远山心里对他有一定的认可，想让杜明海回家帮忙做事。东方靖琪得知杜家岌岌可危，借机主动请缨入府，并献上刚刚研制成功的速效红伤药方，称若聘任自己为药厂大掌柜，可以在三月之内扭转杜家药厂的颓势。
杜远山找人试用东方靖琪送上的红伤药，并亲自服用，疗效显著，决定聘用东方靖琪为远山制药厂的大掌柜。东方靖琪履行诺言，用一系列换购政策收购质优价廉的草药原料，令杜家药厂起死回生。东方靖琪偶然窥破账面漏洞，设计将十个药店的掌柜诳到药厂，并设法令杜远山到场，一起审计药厂旧账。王富贵将查账的消息通知大太太、杜明江等人。东方靖琪、杜明海触及大太太、杜明江、王富贵一伙的利益，杜明江终于横下心要整倒杜明海，夜里召来了王富贵、何家宝密谋。杜明海在街头突然被人用迷药迷晕掳去，醒来时却在妓院醉红楼内，后被衣不蔽体地扔在街上。
东方靖琪此时已经明白杜明江一伙暗流汹涌，主动找杜远山说出自己的猜疑，杜远山说出自己不得不隐忍的真相，杜明江偷听到东方靖琪和杜远山的对话。杜明江连忙召集王富贵等人商量对策，称杜明海和东方靖琪已经严重威胁到他们的利益，必须要将两人除之而后快。王富贵不忍。但正值大管家换届之年，杜远山为了杜明海可能会推东方靖琪上位。王富贵心生危机感，同意杜明江计划，决定寻找机会暗下杀手。杜明江中饱私囊，挪用货款放高利贷，本想为填补亏空去杭州药展大捞一笔。不料，杜远山一改往年做派，意外派杜明海和东方靖琪前往杭州药品展销会，马致远亦受马万年之命前往杭州历练。杜明江怀恨在心，命何家宝暗中收买青龙会的人假扮强盗，得知马致远也去杭州，决定一箭双雕，借此除去商业对手和争夺家产的兄弟。东方靖琪、杜明海二人因为路上下雨，到达客栈时已晚。客栈客房已满，杜明海随便找了一间上等房，推门而入加钱让房间的主人周山口将房腾出来，周山口不从，二人产生冲突。东方靖琪为杜明海的无理取闹赔礼道歉，赢得了周山口的好感。青龙会的强盗开始行动，堵死了客栈的大门，在客栈周围倒上了汽油，纵火烧房。
客栈乱作一团，大门被强盗堵死。东方靖琪听到周山口的呼救，前去营救。杜明海和东方靖琪成功将周山口救出，冷静下来的三人，觉得这场大火蹊跷。杜明江找王富贵商量事情，这时何家宝慌乱跑来称杜明海回来了，杜明江等人惊慌失措，同时杜明江派人杀害杜明海等人的事情也被躲在暗中的春儿听到。经此一劫，杜、马两家所带样品药全部付之一炬，只能原路返回。周山口为感谢东方靖琪救命之恩，决定取消杭州之行，改道暨阳向杜、马两家采购药品。东方靖琪考虑到周山口需要调养一段时间，说服杜明海将周山口带回杜家养伤。东方靖琪带领周山口参观药厂，周山口对东方靖琪的认真细心大为折服，并心生爱慕，当场承诺大量定购杜家生产的成药。杜明江私自挪用货款之事暴露，被严厉处罚，并降为丝厂管事。东方靖琪建议杜明海出面与周山口签订医药购销合约，杜远山欣然应允。
春儿去丝厂看望杜明江，同时告知自己怀孕的消息，杜明江大惊失色，忙于推卸责任。春儿要杜明江兑现承诺迎娶自己,不然就去找老爷说明一切，杜明江赶忙服软，让她给自己一点时间。春儿寻杜明江已久仍不见其踪影，在其门口苦苦等候，正巧杜明海和东方靖琪碰到，春儿遮遮掩掩但仍被东方靖琪发现怀孕，春儿恐东方靖琪张扬求东方靖琪不要声张，东方靖琪大骂春儿糊涂。春儿小产后，身心俱灰上吊身亡，东方靖琪和杜明海哀叹其遇人不淑，白白搭上了性命。杜明海因春儿的事情不忿，找杜远山同时说出了大太太等人中饱私囊的事情，杜远山声称一些事情他心知肚明，并提出了让东方靖琪参与大管家选举的事情。
杜远山广发英雄帖全城张榜遴选大管家。杜明海带着东方靖琪报名参赛，却在应试资格上被阻，王富贵擅自将参赛人员条件改为只招男性，杜明海气不过，去找杜远山问明原因，被大太太等人圆了过去，因公告已发，杜远山同意了这个决定，杜明海无奈只能失望离开。管家世家马万年参赛，并在比赛中击败大管家王富贵夺冠，令众人大感意外。杜远山背心发冷，知道自己必须得按规矩礼聘，而马万年只要稍有动作，便可将杜家产业尽毁。此时东方靖琪出现，声称新任管家必须比她技高一筹方可上任。杜远山当场宣布加赛一场。东方靖琪果然不负所托，在比赛中胜出。杜远山宣布东方靖琪上任大管家。
