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电视剧《父亲的战争》中黄海波扮演的剿匪工作队长关勇波身世坎坷，自幼被富裕的覃家收为义子，同任泉扮演覃家亲子覃天恕一同长大，两人情同手足，随着剧情的发展，兄弟二人因为种种误会而分道扬镳，覃天恕转而和土匪结盟，站到了阻挠解放的反动阵营当中。
睡梦中，覃老爷被一阵婴儿的哭声闹醒，睁眼看见微白的天色，想是自己盼儿心切出了错觉。正待离去，众人都听见了婴儿的哭声。可是放眼望去，方圆几里地，除了一棵老树一眼枯井，什么也没有。那哭声正是从那枯井里传来。管家放下锈蚀的轱辘，拉上来看见一个瓦罐里面盛着带血的胎盘。老爷闻到那热乎乎的血腥味后，亲自顺着轱辘下到井里。不一会儿，他果然抱着一个赤裸裸的男婴上来了。
老爷给他们取名，大的叫关勇波，小的叫覃天恕。家中忽然遭到流匪袭击，绑架了除天儿外的所有女孩子。女儿们救命的呼喊声在山涧沟壑间回荡。兄弟俩听见了呼喊，赶紧奔回家。老爷给土匪送了白银和粮食，却没有换回女儿们的命。
十年之后，老爷渐老，时局动荡，把俩儿子送去省城读书。途中路遇土匪，土匪强留神任泉枪手为匪，关勇波顶替覃天恕落了草。关勇波和土匪下山打劫，抢了新嫁娘。山头老大要破那女人身子，遭到拼死反抗。半夜，关勇波去到被五花大绑的女人那里，放女人走。
关勇波接受组织安排，即将回家乡开展清匪反霸革命斗争。军分区召开全军区剿匪动员大会。已任军分区副政委的罗大成介绍了鄂西剿匪形势，第一阶段剿匪战略为跨省越界联合剿匪，集中兵力攻打流匪。此时的梨川县，只解放了一个区一个镇和42个村，还有6个区7个镇104个保没有解放。因不满所在国民党部队向我军缴械投诚，国民党上校团长蒋光心，投靠“湘鄂川黔反共救国军总司令部”。
但是，翟队长在邻县民兵大队的配合下，没等关勇波回来就召开公审大会，镇压了覃慕文。冉五爸因为气血攻心暴毙。带着县委领导的决定，关勇波和新派来的胡政委以及新工作队队员，一起回到文沙场，得知覃慕文已被镇压。和田缨一起匆匆从省城赶回家的覃天恕，夜宿哥来客栈，遇到从文沙场一战后休整的蒋团长，得知父亲已被共产党镇压。
覃天恕和幺姑复仇心切，借助蒋团长兵力，攻打乡政府和被工作队进驻的覃家大院。关勇波死里逃生后再次去山洞，劝说覃天恕不要以共产党为敌。两人大打出手，而后覃天恕抱着他痛哭说，哥我不能让我们的父亲就这样死去，我要让他在九泉下瞑目。关勇波说，可你继续这样下去，就是要把哥往黄泉路上整啊。
被土匪释放回到工作队的翟队长，对拿自己和土匪做交易大为不满，觉得受到了羞辱。而做出这个决定，一方面是为了减少牺牲，另一方面是为以后劝降彭秀才留后路。获释后的翟队长说，除了彭秀才，幺姑和覃是绑架的主犯。覃天恕是有武装的新生土匪匪首，幺姑是哥老会舵把子，这两股土匪势力都应该剿灭。关勇波提出要把他们和蒋团长、跛豪区别对待的看法。翟队长对关勇波的立场提出质疑。
得到情报后，工作队由于兵力不足，不能对土匪进行剿灭，为了保全两人安全，决定王新军化妆成盐帮走出凉风垭。马县长和翟队长即将通过垭口，被同样化过妆的土匪们发现，双方枪战。等马县长和翟队长通过垭口后，关勇波采取行动，打退了伏击的土匪。战斗即将结束的时候，关勇波看见化过妆的覃天恕。他策马迎面而去，一把竹箭射向他的双腿，把无法动弹的覃天恕横在马背上，直奔天儿住处。
坐在茶楼上看着这一切的覃天恕，挑起门帘就想冲下去，被幺姑一把抓住。不明真相的群众傻眼了。关勇波说，现在你们相信老子不是怕死鬼了，老子就是共产党的剿匪工作队队长。现在，你们不是土匪的都听着，往后退，这里真正想杀老子的是土匪，要是你们不是土匪不怕死的话，也可以继续在这里闹事，不过老子的子弹是不长眼睛的。
马上就要到农历7月初7，梨川县的青年男女都在忙着准备赶女儿会。天儿去关勇波家，关妈把从小为她准备的嫁衣和银饰送给她，让她在女儿会上好好为自己选一个如意郎君。关妈不知道天儿从来就没忘记过她和关勇波的娃娃亲。女儿会来临了，彭秀才把鱼木寨的小土匪们都放下山，自己也跟着年轻人去赶会凑热闹了。
关勇波不但没有接受批评，反而公开表明，一定要给覃留活路，因为没有到罪已该死的程度。被胡政委批评的关勇波，嘴巴硬可心中也在反思自己的行为。他对自己母亲说，剿匪自己绝对没有二心，可是一旦这剿匪剿到覃天恕身上，怎么就跟绞自己的心窝窝般难受？他思量再三，还是决定去找覃天恕劝说投诚。在他们儿时的山洞中，关勇波再没见到覃天恕。
田缨真的怀孕了。孤灯下飞针走线，等待覃天恕回来看他，也在期待腹中婴儿的降生。姑妈几次催促她该休息了，田缨笑而应答，只是不见移动脚步。星夜，轻轻的马蹄声从户外传来，覃天恕回来了。田缨扔下手中的针线冲出门去。田缨急不可耐地扑进覃天恕怀里。姑妈已经沉睡，田缨去伙房给覃天恕下面条。看着覃天恕吃得很香的样子，田缨的内心充满了幸福。
覃天恕虽然担心田缨，但从三先生那里已经知道田缨去了关勇波那里，到也心里踏实了不少。端午前夜，月色清朗，覃天恕和幺姑在院子中茗茶叙旧，想起来许多他们俩的童年往事。说到开心处，忍不住都大笑起来。覃天恕不是在幺姑那里闲逗留，他是铁了心不让幺姑参加端午暴。他留在幺姑家中，一宿未合眼，就是想看着幺姑，不让她参加暴动。
铜锣寨上，吊着一支胳膊的蒋团长和跛豪、幺姑一起，分析端午暴动失败的原因。三个匪首围着一张梨花木圆桌，一桌子的酒菜，却只有跛豪吃得津津有味。跛豪喝一口小酒，嘴中啧啧有声，说，他妈的共产党是神仙吗？怎么就会防守得那么到位？蒋团长折断手中一支筷子，站起来，踱着步说，你真相信共产党是神仙？不对，共产党也是人，不是神，我们所以会大败，还是输在自己人手里。
关勇波在大石庵，关照田缨一定要注意安全，土匪的势力正在被削弱，他们一定会做垂死挣扎。田缨告诉关勇波，覃天恕已经来过了，自己也劝说他投诚，但还是没用。
关勇波为了和天儿结婚，和胡政委较上了劲。胡政委告诉关勇波，县大队不同意他们结婚。关勇波想不通，说，共产党还不允许人结婚？那共产党的干部难不成都要成孤男寡女啊？胡政委说，组织上没剥夺你结婚的权力，只是不同意你和一个土匪匪首的姐姐结婚。关勇波激动地跳将起来，说，老子参加革命大学学习的第一课，就懂了共产党是最讲实事求是的，那土匪的姐姐不是土匪，为什么就不能结婚？
红杉树林一片寂静，关勇波没有见到天儿。他等了一会儿刚要走，还没回头，感觉自己的腰间已经被一管枪顶上了。蒋团长在一边，仪容整洁，说，久违了，关队长。关勇波的视线四下寻找脱身的机会，来不及了，被蒋团长活捉，抓去了铜锣寨。关勇波悄悄把上衣口袋的钢笔扔在地上。
幺姑和覃天恕赶到铜锣寨，把守寨门的小土匪放下吊桥，两人策马直奔山洞。这时，蒋团长把天儿押到关勇波面前，说，只要把驻守梨川县的独立团引诱到山下埋伏圈，你的小新娘终究还是你的，不然的话，蒋团长说着，一把扯开天儿的斜襟大褂。关勇波看见天儿的腰间缠绕着一排炸弹。关勇波不理蒋团长，却对天儿说，我的好天儿，听着，别怕，那玩意儿是吓唬孬种的，那不就是一条不会爬的毛毛虫吗。
山下，胡政委坐不住了，第六次打电话给县委请求派兵，去救援关勇波。马县长批评了胡政委，你是苏区来的老革命了，怎么还和毛孩子一样感情用事！眼下部队兵力有限，梨川县大部分区还都没有解放，剿匪任务还相当繁重，虽然也是为关勇波担心，但是绝对不能盲目出兵，那样会遭受更大的损失。
一颗带血的子弹头落进铜盆里。幺姑满脸满身是汗。覃天恕给她上完药，拿一个枕头，垫在幺姑的后背。幺姑无力地靠在床上。覃天恕用毛巾给幺姑擦汗，擦着擦着一把抱住了软软的幺姑。幺姑惨白的脸上露出无力的微笑，用一只手抚摸他的头发，用轻得几乎只有她自己能听到的声音说，对不起，刚才。
