...
与人类形象无异的仿生人由于发展过快，引发公众的担忧。“明眸”组织专门负责仿生人案件，组员程诺头脑冷静，安秋善于共情，面对仿生人不断被害，两人联手揭开谜团。众生烟火，仿生人间。人类和仿生人的命运都正在被悄悄改写。
例会时，明眸部长万国峰详细讲解了三天前一名女性持械闯入温泉旅馆袭击一对母子的案件，案件中孩子方愿为保护母亲陈心慧正当防卫反杀了这个疯女人，该女性因跌入屋内碳火面部严重烧毁无法辨认长相。由于死者身份不详查无此人，警方要求明眸协助展开工作，判断是否为仿生人案件。
在明眸的入职测试中，安秋凭借优秀的同理心能力，让失去妻儿的男人接受现实，顺利过关。万国峰介绍安秋给程诺，但因为沈立的事情，二人互看不顺眼。安秋察觉到新案件与一名叫金焰的艺术家有关，追寻线索，来到关序的酒吧。另一边，程诺正帮金焰从一个醉汉身边解围，两人留下联系方式。
程诺在老街疑似看到吕言，一番追逐之后跟丢，却听到垃圾填埋场又发生多起仿生人遇害案件，受害人下身同样被捆绑摆成奇怪姿势且周围也画有双生星象图腾。随后，安秋在尸体身上找到一条项链。安秋向万国峰询问为何程诺见到吕言会如此激动，万国峰告知吕言可能与程诺母亲张雅的死有关。因未追到吕言案情线索中断，同时再次因为母亲的死，程诺借酒消愁。
幸存的两个仿生人名叫李义和尹天宏，明眸系统中却查不到两人信息。程诺怀疑是实验室的人动了手脚，从张雅的遗物中寻找线索未果。安秋和程诺推测李义需要赚钱生活，于是找中介问来李义的工作经历。来到李义最终工作的物流公司，遇到公司领导黄仕鹏。程诺翻查黄仕鹏一家资料发现其女儿黄聪儿疑似仿生人。
程诺跟随黄仕鹏发现他确实在给别人钱，但却没找到接受人。安秋在黄聪儿学校门口观察记录聪儿的生活行径，发现聪儿每天的时间安排完全一致随即产生怀疑来到聪儿家继续询问调查，从黄聪儿的回答中感觉黄聪儿确实很像仿生人但过于顺理成章。两人开始从头查起，安秋在跟踪观察聪儿放学的时候发现聪儿对仿生人的事情很困扰。
程诺安秋从李义给聪儿的礼物中得到线索，发现李义化名李非现在在远方船厂工作，于是两人前往船厂搜寻，路上安秋问起棚户区行动有程诺签字的事情，程诺含糊其辞。两人通过在船厂找到的信息发现李非去了码头，来到码头后发现李义和另一个人遇害，凶手见状逃跑，程诺追踪未成跟丢。
得知自己是仿生人的安秋陷入迷茫，她决定先保守秘密。程诺和安秋推测吕言没有交出所有的仿生人评估报告，于是再次找到他。在二人的巧妙劝导下，吕言交出尹天宏的资料，资料显示尹天宏精神状态异常。张雅将与尹天宏进行心理治疗的过程用视频记录下来，从中可以看出，他对“梦乡俱乐部”和“双生星象图”有非常强烈的反应。
程诺和安秋前往轮渡公司查探船员证的线索，路上二人各怀心事。船长证明船员证是假的，而年初的一桩仿生人偷渡案也引起了程诺和安秋的注意。为继续调查，程诺带安秋见了他高中同学孙遥。孙遥曾是海员，现在改行摆烧烤摊。程诺在孙遥的邀请下参加第二天的聚会，见证了孙遥向女朋友徐一念求婚的一幕。同时间，好奇自己身世的安秋找到沈立，侧面打听关于自己过去的事情。
徐一念在明眸被注射了药剂，接下来将被送往召回中心。程诺心中愧疚。正在这时，孙遥主动自首，希望再见一次徐一念。程诺没能将他劝阻，而另一边徐一念却选择不再见孙遥。看守所中的孙遥听说徐一念即将被召回，万念俱灰，对程诺大发脾气。安秋劝慰喝闷酒的程诺，程诺不经意说出自己曾杀死过一个仿生人。安秋联想起尹天宏的话，对程诺怀疑加深。
尹天宏、安秋、程诺三人在棚户区对峙，尹天宏说出了是程诺杀死了安阳，挑拨安秋和程诺之间的关系。安秋愤怒的质问程诺为什么一直在骗自己，在程诺陷于自责的时候被尹天宏迷晕，迷晕前用最后的清醒摸向了手机。明眸内，沈立收到程诺的求救信号。尹天宏将程诺绑起来，用安阳的死教唆其杀死程诺，但安秋迟迟想到遗忘的片段下不去手，尹天宏觉得安秋的初始执念被调换了。
梦乡俱乐部中，安秋从尹天宏手里结果匕首，走向程诺。万国峰收到直播地址联手特警一同前往抓捕，直播现场，安秋天人交战，最终还是下不了手。尹天宏失望至极，认为安秋和罗粟没有本质区别，都无法突破自己的初始执念。程诺告诉尹天宏罗粟行为的真相，是因为向老板求情放尹天宏走不得。
几年前，万国峰邀请张雅加入明眸实验，实验的目的是置换仿生人的初始执念，培养仿生人调查员。他们本身是仿生人，对于搜查自己的同类有天生的优势。一方面可以保护人类调查员，另一方面必要的时候可以为人类调查员去牺牲。张雅认为这个想法违背人类道德，仿生人本来就是因为人类需求和私欲研发出来的工具人，现在却又要利用他们来达到其他的目的。
