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该剧讲述了国企干部齐本安临危受命，团结广大干部群众，加强党风廉政建设，挽回流失的国有资产，带领企业在经营困境中成功突围的故事。故事仍然发生在汉东省京州市，时间为《人民的名义》反腐风暴半年后：京州一家有着八十年壮阔历史的大型国企中福集团在转型期陷入困境，其中既有市场变化的因素，也有不可忽视的严峻的腐败问题。一场意外的爆炸，炸出了五亿资金的离奇失踪，将各种尖锐复杂性的矛盾逐步暴露出来。党政高官、企业高管、社会各界、底层弱势群体，各类栩栩如生的人物——你方唱罢我登场，故事惊心动魄……
上世纪三十年代，在一片白色恐怖之中，我党在上海、京州等地建立了一批商业贸易企业，为党筹措革命经费，上海福记中西贸易公司即为中之一。该公司由共产党人朱昌平、谢英子夫妇筹资创办，历经八十年血火岁月的洗礼，存续至今。2013年春的某一天，时任中福集团董事长的林满江，带着集团宣传总监齐本安等人，站在一张老照片前感慨不已。
牛俊杰为了解决京州能源经营困境，专程赶到京州市棚户区程端阳家找董事长皮丹解决资金问题。而“佛系”干部皮丹因无法忍受京州能源的形势危机，专程回到母亲程端阳家，希望老劳模程端阳向自己的徒弟林满江推荐自己，从而得到提拔离开面临经营困境的京州能源。
京州中福集团全体干部会议召开，宣布对董事长兼党委书记齐本安的任命。但没想到京州中福党委副书记陆建设、京州能源的董事长皮丹和总经理牛俊杰都未到场。陆建设借故在机关医院住院，拒绝到场参会。齐本安在任职大会报告上提起矿工新村棚户区改造问题，要求把棚户区改造当作自己的事，要切实对棚户区改造负责。
皮丹意识到齐本安新官上任三把火，对自己的处境感到担忧，会后立即回到母亲程端阳家，希望程端阳帮助自己给林满江打电话调整职位，却遭到程端阳的严词拒绝。石红杏担任京州中福集团总经理多年，对集团空降齐本安到京州中福任董事长颇有不满。
齐本安随同牛俊杰视察京州能源的几个大矿，矿上的问题让齐本安感到棘手。牛俊杰简单给齐本安介绍京州能源这些年的情况，提起京州能源给市里提供的五亿元棚户区改造基金。在矿上，牛俊杰抱怨老婆石红杏的决策，齐本安问起京州能源公司债逾期风险问题，牛俊杰提起京州中福四十七亿收购京丰京胜矿的事。
秦小冲的父亲秦检查是牛俊杰的师父，所以牛俊杰希望为刚出狱的秦小冲安排一份谋生的差事，但秦小冲却并不领情，并认为自己的入狱和牛俊杰一家人关系重大，秦小冲告诉父亲秦检查自己当初是被冤枉的，自己出来之后要揭露京州中福和京州能源更大的问题。
齐本安第二天就带着办公室主任吴思泰到昆明来找靳支援，但刚到昆明就被告知靳支援已经飞到了西双版纳，齐本安与吴思泰赶往西双版纳，却接到电话称靳支援因为开党组会议已经回到了北京，齐本安与吴思泰只得连夜赶回北京。爱好写作的吴思泰一路发布朋友圈，并P图写游记记录自己的行程。
齐本安因为吴斯泰的朋友圈，不得不向组织写检查说明。范家慧要求齐本安在京州时报与京州中福的合作协议上签字，没想到齐本安大为光火，坚持原则拒不签字。齐本安得知有人发现齐本安的房间里被安装了三个监控探头，首先怀疑是石红杏做鬼，但石红杏矢口否认，牛俊杰提醒石红杏不要使用非法手段，没想到石红杏勃然大怒。
京州中福会议上，齐本安点名石红杏质问五亿元资金的情况，石红杏以党性保证五亿元资金与京州中福没有关系，把五亿元资金归罪到金一勤身上。齐本安明确表态自己将密切配合京州纪委彻查五亿元资金问题。王平安突然晕倒在地，齐本安安排陆建设送王平安到医院，并特意叮嘱陆建设一直陪着王平安。
张继英向国资委纪委徐副书记汇报京州“三二八”事故情况，徐副书记对5个亿的国有资产流失问题高度重视，指示张继英安排齐本安配合京州市委调查王平安事件。林满江、齐本安、石红杏到医院看望程端阳，吕德光到医院慰问陈英诚，吕德光真诚向陈英诚道歉，并告诉陈英诚准备报道他在爆炸事件中的事迹。
齐本安配合市委调查五亿资金流失事件，到市委向纪委书记李学习汇报情况。李学习询问齐本安是否要隔离审查石红杏，已经开始关注石红杏的违纪行为，齐本安向李学习保证京州中福密切配合市委的调查，绝不会成为任何一个腐败分子的保护伞。从李学习处离开之后，齐本安脑海中反复回想着石红杏的所作所为，径直来到林满江办公室。
面对京州中福的混乱局面，齐本安困惑不堪，范家慧关切问起石红杏的问题，并提醒齐本安注意处理问题的方式方法。程端阳醒来的消息传来，林满江、齐本安、石红杏、皮丹立即赶到医院看望。林满江授意齐本安、石红杏免掉皮丹京州能源董事长职务。秦小冲被认定为协助黄清源逃离的内奸，并被怀疑为卧底，遭天使公司开除。
家宴上，石红杏借着酒劲，终于对林满江说出了五亿元去向的实情：原来，这五亿元是她授权给王平安去做国债回收的。林满江虽然大发雷霆，但同时敏锐地意识到李功权在这件事情中可能存在的问题，并把李功权和齐本安联系在一起。李学习到钱国富处汇报工作，汇报自己和吕德光搭档工作中所遇到的问题，重点交待和请示了五亿资金专项资金的问题，担心京州中福领导相互包庇。
民主生活会上，林满江对众人提出批评，并代领众人严肃回顾中福集团的创业史。秦小冲把自己卧底身份暴露的原因怪罪为牛石艳，跑到《京州时报》向范家慧控诉，但牛石艳坚决否认。范家慧鼓励秦小冲和牛石艳摒弃前嫌，要求众人协助秦小冲洗清冤屈。秦小冲当即表示只要能为自己翻案，自己一定为《京州时报》创造奇迹。但刑警大队突然来到《京州时报》，因天使公司之事要求带走秦小冲配合调查。
钱荣成参加完京州市银企协调会议，对自己的企业重新树立了信心，刚散会便来到天使公司，要求给李顺东五百万慰问费让李顺东归还自己的劳斯莱斯，但对于李顺东的追债，钱荣成仍然耍赖。在被押送回京的车上，李功权向纪委陆建设交代自己伙同王平安向金一勤行贿五百万的事实。此外，陆建设还诱导李功权证明齐本安有索贿的嫌疑，迫使他们去行贿。
以秦检查为代表的棚户区广大居民不满部分群众反对棚户区拆迁的行为，希望通过上访解决棚户区的改造问题。众人到医院看望劳模程端阳，希望程端阳帮大家向政府请愿废止24号文件，但程端阳认为政府也有政府的难处，让群众们对政府树立信心，相信政府会想办法解决。林满江与妻子童格华坦言自己后悔任命齐本安，担心齐本安在京州中福的行为会对自己造成不利影响。
范家慧出面协调牛石艳和秦小冲之间的误会，安慰牛石艳的同时，让牛石艳多理解秦小冲的处境，言语中透露出对秦小冲艰难经历的理解。但没想到秦小冲两年前的案件勾起了牛石艳失恋的往事，牛石艳对范家慧谈起自己的情感往事，伤心落泪。
民主生活会仍在继续，牛俊杰提出京州能源的问题，要求齐本安、石红杏指出应对方案，同时公开提出中福集团以四十七亿高价收购京丰、京胜矿的事件，矛头直指石红杏、林满江。会议最后，齐本安做出要在最短时间把党风廉政建设的欠账补上还上的承诺，牛俊杰带头鼓掌支持。
李顺东对秦小冲谈起自己和牛石艳的情感往事。原来，当年石红杏不同意宝贝女儿嫁给李顺东，并拿出十万元让李顺东和牛石艳断绝关系。李顺东放弃了爱情，以石红杏给自己的十万元作为创业基金，创办了天使公司，暗暗发誓一定要出人头地。
京州中福与长明集团的合作不止矿产交易，所有合作都是在林满江的授意下经石红杏之手完成。牛俊杰不同意集团战略委员会以十五亿价格将京丰、京胜矿转让给长明集团，并怀疑林满江与傅长明之间存在利益输送关系。胆小的石红杏借看望程端阳之际，把牛俊杰对四十七亿交易案的推论告诉程端阳。
