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武警总队特勤中队长秦观报仇心切，在行动中强行解救人质失败，导致恐怖分子“血狼”逃走，人质被害。秦观受到降职处分。部队决定吸纳女兵加入特勤队伍，秦观接兵时目睹了武术专业女大学生柠檬在街头维持正义，对她的身手大为赞赏，动员柠檬参军。同寝室的陈萱、柳真真决定和好友一同应征。入伍后，秦观变身魔鬼教官，要求严苛，新兵训练结束，三位同学一起被分到新组建的特勤第八组，队长正是秦观。特勤第八组是尖刀部队，成员各个身手不凡。在与“血狼”数次交锋中，化解了多次恐怖袭击，但也经历了沉重的流血和牺牲，曾经懵懂无知的女孩们成长起来，成为了真正的特勤战士。直到最终将恶贯满盈的恐怖分子击毙，击溃了国际恐怖组织的阴谋。捍卫了祖国荣誉，守护人民的安康。
六月十八日，武警战士宁檬陪母亲来延州人民医院检查身体，正当二人讨论病情时，一群恐怖分子冲入医院，对人民群众进行施暴。在简单安顿好母亲后，宁檬立刻加入到紧急救援当中。此时，中国武警延州支队反恐特战大队队长秦观和陈浩哲正好途经医院，看到了被歹徒追杀的人民群众，秦观在冷静指挥陈浩哲报警后就加入到救援当中。
在严苛的考核中，被淘汰的战士们都忍着泪水与蓝色闪电突击队告别。在3分钟搏斗逃生的考核中，宁檬突然被打晕，在千钧一发之际，她战胜了自己的心理压力，以最后一名的成绩留了下来。在战士们努力训练的同时，恐怖分子也在暗中密谋着计划。他们要找到詹姆斯博士留下的新能源方程式，进而垄断新能源市场。休息时宁檬向李思思讲述了自己一定要进入蓝电的原因。
宁檬立誓要成为一名军人，继承哥哥的遗志。考核训练升级，这次队员们要在半夜进入丛林，在规定时间内找到属于自己的徽章。整个丛林中险象环生，队员们决定结伴前行，突然有人炸伤了胳膊大腿，恐惧指数升级。越过重重困难，战士们终于找到了自己的徽章，但依然有人被淘汰。
秦观不得不接受了组织的安排，将宁檬留下来。藏在暗处的恐怖组织首脑吴梅再三催促吴杰，要不惜一切代价找到新能源方程式。除此之外，他们还准备破坏新能源大会以保住他们的利益。恐怖分子找上了詹姆斯博士的合伙人，仍未找到博士留下的数据，残忍地将人杀害。秦观带领队员户外训练时，突然一辆车违规冲出检查岗。秦观当即下令让战士们原地展开救援，他则跃上汽车一路追击歹徒。宁檬放心不下，于是跟了上去。
宁檬替李思思解了围，在蓝电选拔阶段与李思思的友情升级。蓝电男兵也秦观的带领下越来越团结。看到宁檬的表现，精通心理学的文静不禁想到牺牲的宁磊，原来文静与宁磊曾经是一对恋人。严酷的选拔考核进行到最后一轮，这次每名队员都需要从三名“绑匪”手中解救人质。淘汰赛中，由于敌我比例悬殊，单独执行任务的队员纷纷被淘汰。指挥室里秦观道出了这场比赛的用意，原来这场比赛的核心就是要培养队员的团队意识。
秦观通知“绑匪”将最后一名人质转移到三号车间，他指挥在场所有人在有限时间内抢夺最后一个名额。所有人都追击“绑匪”和人质来到天台，宁檬与高小伟配合，抢夺最后一个名额。童梦瑶此时秦观下令实行B方案，匪徒突然向众人开枪，慌乱之余，郭小伟被队友梁伟丽“爆头”，患有“斯德哥尔摩”的“人质”一边扫射一边从天台跃下，宁檬不顾自身安全，抓起地上的绳子毫不犹豫的跟随“人质”跃下，拿到最后晋级名额。
在饭局上，秦观被曹总的合作伙伴丁总为难，却偶然发现丁总是之前被捕毒贩的哥哥。曹总当即决定不再与丁总合作，并且秦观和严大民之间浓浓的战友情谊令曹总感动不已，决定让严大民进自己的公司工作。“闪电行动”日期越来越近，蓝电突击队训练升级。在配合训练中，宁檬因之前伤痛服用过量止痛片产生副作用，在“两两”协作的配合训练中开了小差，梦到临时处突任务，在即将击毙犯罪分子的时候突然出现死去哥哥的影子。
熟悉黑客技术的恐怖组织S集团成员李丽利用网络攻击武警的指挥系统，却被童梦瑶借机锁定位置。秦观立刻指挥宁檬等人去追击李丽，陈浩哲带队去追击 逃跑的马明。出租屋内指挥的李丽和吴杰发现位置暴露，立即准备逃跑，马亮担心哥哥马明决定留下边应对武警指挥马明逃生。陈浩哲等男兵在通风管道内失去匪徒的踪迹。宁檬与徐冬冬等人来到出租屋内与留守的马亮正面交火，马亮将指挥电脑砸坏后逃跑，徐冬冬和李思思随机追击。
恐怖组织s集团抢夺新能源资料的任务失败，还提前泄漏了要在新能源大会召开之间制造恐怖爆炸的信息，吴杰大发雷霆，但当看到秦观的信息时计上心头，准备从秦观父亲处下手，原来秦父是此次新能源大会召开会展中心的总承建商。吴杰利用资源找到做灯饰生意的刘羽希，扶持她参与会展中心的招标，企图通过灯光运输及安装将炸弹带入会场。
林奕父亲得知了林奕被处分的事，立即打电话过来怒斥林奕。林奕向徐冬冬吐露心声，原来林奕出身于军人家庭。虽然从小受到他人的羡慕，但同样也承受着家里带来的心理压力。徐冬冬了解情况后，耐心劝导林奕，二人决定要共同进步。蓝色闪电突击队授徽章仪式举行，14名蓝电成员在秦观的带领下在国旗下完成宣誓。蓝色闪电突击队正式成立，秦观带领战士们集体庆祝。
“炼炉”的训练男兵们已经经历过，但对于刚加入蓝电的女兵们却苦不堪言，残酷的训练让女兵们身上都挂了彩，教导员心疼不已，女兵们也相互鼓励着坚持。超负荷的宁檬再次出现幻觉，宁檬把自己内心的恐惧告诉了教导员，教导员指出这是心理上的问题。宁檬很受挫败，秦观得知宁檬的情况后，在雨中开导宁檬。
徐冬冬在宁檬等人的帮助下顺利通过索降科目。残酷的“炼炉”训练还在继续，下一个项目是抗眩晕训练，看似简单，实则难度非常大。几天训练下来，一向永争第一的杨姝还是没能克服生理障碍，没有通过抗眩晕科目的考核。热心宁檬找到教导员和队医庄茜，想寻找能够帮助杨姝的方法，却被“孤傲”的杨姝拒绝。
秦观看到女兵们拼命训练很欣慰，此时支队长打电话询问女兵们的训练情况，同时透露相关部门刚刚截获恐怖组织秘密囤货的一批新型能源材料—GHR3。这女兵们的拼搏精神也感染了男兵，大家纷纷加入训练中。为了打败男兵们，宁檬、童梦瑶等人在宿舍讨论接下来的男女对决战术，而男兵们因体型和力量优势根本不把女兵们放在眼里。最终的对决在野外山岭中进行，女兵们按照商量好的策略，采用逐个击破的方式，一时间打得男兵们措手不及，女兵们取胜。
蓝电突击队要竞选突击组长，宁檬、陈浩哲、杨姝三人都是正在考察的候选人。在做引体向上时宁檬和杨姝暗地较劲谁也不服谁，两人的较量吸引了大批围观的士兵，但二人最终因体力不支同时掉下单杠。男兵们在宿舍讨论竞选突击组长的事情，大家纷纷给男兵选手陈浩哲打气。宁、杨，陈三人还在为竞选突击组长暗自较劲的时候，大家迎来了更严酷的魔鬼周比拼。
在接下来紧张的急行军过程中，杨姝却突然晕倒。此时杨姝嗓子发炎又泡了水，发了高烧。蓝电本着不抛弃不放弃的精神，简单制作了担架，抬着杨姝冲向终点。蓝电突击队和特训队几乎同时到达了指定地点，面对这两支表现突出的队伍，支队长提议改变演习规则。两支队伍可以对抗，哪队先到达终点哪队算赢。最终蓝电成员率先到达终点，大家激动地抱在了一起。
一番努力后大家都取得了补给。顾不上身体的不适，大家纷纷狼吞虎咽地吃起来，但还没吃两口又开始了急行军。新的挑战开始，特训队和蓝电狭路相逢，这次的比拼是生吃牛肉。面对特训队的轻视，蓝电喊起口号给自己加油助威，最终蓝电获胜。蓝电在野外扎营休整，秦观趁机拿白天生吃牛肉的事刺激大家，让大家做好心理准备，随时应对挑战。
蓝电突击队又迎来了新的挑战，将与特训队抢夺勋章。陈浩哲带领男兵绕后去特训队偷袭，宁檬等女兵在营地留守引诱伏击。支队长决定给演习增加难度，派出暴风队加入，前去偷袭的陈浩哲等人被暴风队包围。埋伏在周围的特训队决定前去偷袭只剩女兵的蓝电营地，不想反被女兵们设计。女兵们利用自身的优势，分散引诱，设下陷阱，逐个击破，顺利拿到徽章。
童梦瑶受不住沙漠的恶劣气候，轻度中暑。大家齐心协力，挖了个沙坑给童梦瑶做物理降温。正在整休的突击队偶遇驼队，宁檬心起疑意，无人区怎么会出现驼队。宁檬决定利用女兵的优势，以看骆驼为由侦查他们运送的物资。虽然发现了端倪，但也惊扰了驼队，驼队趁机匆忙离开。
荆轲取完水，刚想离开，但水壶相互碰撞的声音引起了恐怖分子的怀疑。眼看行踪就要被发现，荆轲躲进水源才躲过一劫。驼队意识到此地不宜久留，匆匆离去。秦观让徐冬冬留在水源地照顾童梦瑶，自己带着队伍继续追赶驼队。林奕艰难地抵达营地，体力透支加上蝎子毒让林奕晕倒在营地门口。被救醒的林奕立刻跟部队汇报了情况，请求支援。
总队为了嘉奖蓝电的突出表现，给蓝电配发了最新的高科技装备。装备的说明书全是英文并且没有图片讲解，宁檬和童梦瑶连夜为大家翻译难懂的说明书，以帮助大家能尽快熟悉并使用新设备。吴杰跟S集团头目吴梅汇报了GHR3运送失败的事，吴梅交给吴杰另一个任务。秦观告诉大家一定要尽快熟悉新型装备，为闪电行动做好准备。
