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沈不言在梦中见到一名全然陌生的古代女子，可她望着自己的眼神却似有万语千言。随着女子自城楼一跃而下，一块玉佩碎成五瓣。在南梦湖畔的许愿树下，沈不言再次见到这枚碎裂的玉佩。因血迹沾染玉佩，沈不言穿越回晟国皇宫，见到了一直在等待自己的皇后陆鸢。这一日恰逢上巳节，陆鸢请沈不言帮自己做了三件事，并回答了沈不言三个问题，之后目送其远去。沈不言意识到现在是元启十五年的上巳夜，据记载妖后会猎杀贤相李拥，史称“元启之变”。沈不言赶去营救，却意外看到李拥携城防图投敌。
陆鸢为沈不言挡箭受伤。沈不言回到现代，发现史书已改写，陆鸢在这场政变中身故，而碎玉佩则已由五块合为四块。为了把李拥的阴谋告诉陆鸢，沈不言划破手指，再合并一条玉佩裂缝，重回上巳节夜晚。在熙熙攘攘的江都城大街上，沈不言再次见到陆鸢，可陆鸢却道不认识后匆匆离去。沈不言偶然结识了心智宛如孩童的天启皇帝。间谍误把沈不言当作皇帝绑架，陆鸢从天而降将其搭救。陆鸢告诉沈不言如今是元启五年，自己只是御前掌宫而非皇后；沈不言则把十年后发生的事情告诉陆鸢，陆鸢却道荒谬。沈不言眼见陆鸢乘李拥的马车回宫，自己便也使用皇帝赠送的令牌入宫，得知皇帝痴傻、李拥掌权，外敌北烈虎视眈眈。
陆时希望率兵攻打火峰堡，从北烈人手中收复失地，但权相李拥反对。陆鸢表面支持李拥决定，实则暗中将消息传递出去、提前布局。第二天的朝堂之上，李拥面对沸腾的民意措手不及，只得同意陆时出兵。为制衡陆鸢，李拥与北烈人合作，计划在此战中除掉陆时。沈不言告知陆鸢，史书中的陆时殁于此役。为保家国，陆时坚持出兵。沈不言欲替陆时率兵前往史书中他牺牲之地，并让陆时另辟蹊径攻打敌军主力，然被陆鸢抢先一步。沈不言从陆鸢的留书中得知，原来自己早已出现在陆鸢的生命中。
在火峰堡之战中，沈不言的计策生效，成功收复失地，并保护了陆时。沈不言决定留下来，帮助陆鸢改写命运。陆鸢拿出皇帝五年前给自己的凤牌，告诉沈不言自己本有机会以皇后之尊来对抗李拥，但自己始终在等心上之人。众人结伴回到南梦湖畔的旧居。邻家老伯怀抱一婴儿已等候陆鸢姐弟多时。他告知众人，当初火峰堡沦陷之后，李拥杀害北安王，自己则偷偷抚养了尚未被发现的北安王遗腹子。陆鸢决定收养这位最后的皇室血脉，为其取名楚同裳。
在李拥的策划下，刺客潜入南梦湖旧居，围杀已卸甲归家的陆时。陆时为保护倚华和楚同裳，战至力竭。被调虎离山的陆鸢和沈不言赶回，只来得及见陆时最后一面。与此同时，陆时已死的消息在城内被大肆传播，军心涣散，北烈军队卷土重来。李拥也带兵赶往火峰堡，只待坐收渔利、夺得虎豹营兵权。为平息民变，陆鸢出示凤牌，对百姓宣称自己是皇后，会与满城百姓共进退。至此，沈不言看到历史正沿着原本的轨迹前行。
沈不言与陆鸢等人用计逼退兵临城下的北烈军之后，丞相李拥率兵围城，直指陆鸢矫诏自封皇后。为了不起内战，陆鸢只得把火峰堡以及虎豹营交托给杨副将，自己则被被押解回江都。沈不言请皇帝在朝堂上配合陆鸢，承认其皇后身份，并问罪李拥通敌。奈何皇帝心智有缺，遭识破。李拥反将一军，当着满朝文武指责陆鸢操控皇帝、妄图夺权，做实其“妖后”之名。沈不言孤注一掷刺杀李拥。现代的沈不言醒来，发现史书上的结局并未能更改。
元启元年上巳夜，丞相李拥因为反对新皇的举国北伐之举，遭官兵围捕。其义女陆鸢凭借新皇所赠信物作掩护，成功藏匿李拥。李拥坦言，新皇执意北伐，穷兵黩武。沈不言寻机刺杀李拥，却遭陆鸢阻挠。沈不言本欲陪陆鸢好好过一次上巳节，然而二人却为李拥之事起了争执。陆鸢道自己跟随李拥三年，深知他体恤民生，且所有情报皆通过自己之手，绝无可能勾结外敌。二人不欢而散。
沈不言一心想改变陆鸢入宫的命运，决定带她离开江都城，远离纷争。陆鸢接受了沈不言的示好，两人和好如初。在沈不言的提议下，众人结伴回南梦湖踏青。闲云野鹤的几日匆匆而过，沈不言从信鸽传书中得知，陆鸢邀约新皇前往镜花楼赏乐。沈不言希望陆鸢不要卷入此事，但为黎民百姓，陆鸢无法放手。
新皇抵达镜花楼后，陆鸢晓之以情，沈不言动之以理，成功说服新皇暂时搁置北伐计划。因沈不言提出了让新皇耳目一新的改革措施，新皇对其大加赞赏，直言要沈不言顶替空缺的丞相之位。殊不知李拥也在此间。李拥哀叹自己鞠躬尽瘁数十年，于帝王而言竟不抵此人寥寥数语。新皇坚持将皇后凤牌留给陆鸢，尽管陆鸢已坦诚自己有心上人。他还采纳沈不言建议，命陆时打造一支所向披靡的悍兵，以图来日收复国土。
心灰意冷的李拥被北烈间谍说动，决心扶植傀儡皇帝，自己当晟国真正的掌权人。新皇遭下毒后心智宛如孩童，李拥代为执政。沈不言询问陆鸢的贴身玉佩来历，陆鸢终于明白自己的宿命。陆鸢为了制衡李拥、保住新皇性命，决定入宫做女官、潜伏在李拥身边，以待来日昭雪沉冤。沈不言理解她的理想和坚持，答应陪她一起囚于深宫。
现代的沈不言在救护车上醒来，未能完成陪陆鸢入宫的承诺。玉佩的最后一条裂缝合上，沈不言在南梦湖见到了十八岁的陆鸢。此时的陆鸢姐弟与祖父一起住在南梦湖畔，全家的卖身契都在牧监周大人家的公子手中。眼见陆鸢姐弟遭周公子欺凌，沈不言决定教会她安身立命的技能。为使陆鸢答应跟随自己学习，沈不言以回答陆鸢三个问题作交换。周公子当街欺凌受“军马案”牵连的弱女子倚华。陆时路见不平，与周公子起了冲突。
陆时因为骑射优异，入选预备军，但入伍信函却被周公子扣留。及时赶到的沈不言舌灿莲花，顺利说服周公子放走陆时。陆鸢主动表示愿替倚华嫁入周家，条件是明媒正娶且以礼相待。陆鸢在牧监府内探查到“军马案”的真相，且寻得牧监通敌的物证。设法脱身后，陆鸢拜访节度使并呈上罪证，让牧监等人受到惩处。沈不言认为陆鸢已可以独当一面，打算主动离去
陆鸢说服沈不言留下来，众人在南梦湖的陆家小院里度过了一段平静的岁月。沈不言把玉佩卖掉，为陆鸢买了一架箜篌。陆时从军中寄回家书，告知火峰堡即将沦陷，家乡恐会变为战场。陆鸢上街变卖首饰时，看见小贩出售沈不言的玉佩，遂赎回。节度使召见陆鸢，请她以乐师身份进入已沦陷的火峰堡，以便刺探敌情，即刻出发。陆鸢与沈不言匆匆话别；同时，陆时奔赴前线。
现代的沈不言再次来到南梦湖畔，遇见当初兜售自己碎玉佩的老奶奶。她告诉沈不言，陆鸢在“元启之变”时中箭恰是计策中的一环，城防图在双方打斗中已被掉包。北烈军因使用假图节节溃败，李拥终于明白陆鸢棋高一着，但他随后以身死逆转局势，在史书上留下“贤相”清名。陆鸢的结局一如史书上所记载，被楚同裳以“妖后”之名除去。南梦湖畔陆鸢的墓因考古重见天日。多年后，沈不言通过史料研究终为陆鸢正名。新皇抵达镜花楼后，陆鸢晓之以情，沈不言动之以理，成功说服新皇暂时搁置北伐计划。因沈不言提出了让新皇耳目一新的改革措施，新皇对其大加赞赏，直言要沈不言顶替空缺的丞相之位。殊不知李拥也在此间。李拥哀叹自己鞠躬尽瘁数十年，于帝王而言竟不抵此人寥寥数语。新皇坚持将皇后凤牌留给陆鸢，尽管陆鸢已坦诚自己有心上人。他还采纳沈不言建议，命陆时打造一支所向披靡的悍兵，以图来日收复国土。
