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FAIRY TAIL 100年クエスト
菲欧烈王国有一个著名的魔导士公会“妖精的尾巴”，不仅是全国最强的，还常常引发各种骚动。公会成员纳兹、露西、哈比、格雷、艾露莎、温蒂和夏露露组成的最强小队，正准备出发前往北方的土地——基尔提纳。那里有世界上最古老的魔导士公会“魔阵之龙玛吉亚·德拉贡”。在与黑魔导士泽雷夫和黑龙阿库诺罗基亚的生死战斗中胜出后，纳兹等人获得了挑战比S级任务更高级的“百年任务”的许可。这项“百年任务”是自“魔阵之龙”公会成立以来百余年间无人完成的传说级难度的任务。踏上未知大陆的“神秘之城”，首次遇见的“不可思议之神”，以及开始行动的“诡异敌人”……
新加入魔导士公会「妖精尾巴」的新人名叫桃华，她非常仰慕纳兹，但却无法见到他。这是因为纳兹和他的伙伴们正身处遥远北方的未知大陆·基尔帝那。他们的目标是前往世界上最古老的魔导士公会「魔阵之龙」，接受传说级的高难度委托「百年任务」。当纳兹一行人抵达「魔阵之龙」并进入建筑物时，立刻感受到了一股异样的气息。就在此时，一条自称法龙的神祕巨龙出现在他们面前……！
「百年任务」的内容竟然是狩猎五只龙！纳兹一行人为寻找第一只龙的水神龙情报，来到了名为艾尔米那的港都，并在那里遭遇了奇异的经历。整个小镇沉入海中，镇上的居民都变成了鱼的模样。就在此时，当格雷提及水神龙的名字时，友善的居民态度突然转变……！？另一方面，在「妖精尾巴」，因为新人桃华的一些言行，让戈吉尔和茱比亚对她产生了怀疑。此外，杰拉尔造访了「剑咬之虎」，他正在寻找某个人……！？
水神龙梅尔克佛比亚现身，并邀请纳兹一行人前往他的水中神殿。作为讨伐对象的水神龙意外地性情温和，但他却表示一直在等待能够杀死他的人。这让纳兹一行人心情复杂。然而此时锁定水神龙的魔导士公会「DIABOLOS」的奇丽雅等人忽然袭击，纳兹他们被卷入战斗之中。另外，在菲欧烈王国继续寻人的杰拉尔，在造访「人鱼脚跟」时获得了重要的情报。
最近魔导士的魔力被夺走的神秘事件在各地频繁发生。杰拉尔为追捕这些案件的嫌疑人「传说中的白魔导士」而来到马格诺利亚，并质问「妖精尾巴」的新成员桃华。与此同时，在北方大陆，纳兹等人与DIABOLOS苦战。艾尔莎被奇丽雅制伏，与纳兹和温迪一起被带上敌人的船。露西等人离开艾尔米那，乘船寻找同伴时遇到了意外的人物。
行进的船只停了下来，纳兹等人一举反击。露西和格雷也成功会合，与「DIABOLOS」的战斗愈发激烈。感受到局面处于劣势的敌方领袖史卡利昂决定暂时撤退。纳兹等人乘坐剩下的小船返回艾尔米那，却在海上发现城市的异状。急忙登陆后，发现建筑物半毁，居民们惊慌逃窜，场面一片混乱。在这片混乱之中，附近升起了几根巨大的水柱！压倒性的水的破坏力……水神龙梅尔克佛比亚失控了！？
「请杀死水神龙吧。」卡拉蜜儿的悲痛决心使纳兹等人决意面对暴走的梅尔克佛比亚。所有人拿出灭龙的力量一同挑战水神龙，但纳兹的火焰在强大到足以举起海洋的力量面前被扑灭，陷入困境。火与水的属性相克无法改变……就在这时，出现了一个让事态急转直下，谁都没料到的闯入者。而“他”口中所提到的名字竟然是意想之外的人物……！
在伊格尼亚的帮助下，纳兹和他的朋友们终于击败了水神龙梅尔克恐惧症。埃尔米纳的居民失去了守护神，但已经开始重建被毁的城镇，卡拉米尔正在接近他们……在获得了剩下的四条神龙的信息后，纳兹和他的朋友们前往下一个目的地，吉尔蒂纳大厅的中心。与此同时，暴露了自己真实身份的白魔导士已经摧毁了“妖精的尾巴”，并决定纳兹等人将成为他的下一个目标……
“妖精的尾巴”是一个人才公会，其成员与“妖精的尾巴”长得一模一样。格雷遇到了与朱比亚一模一样的女人朱比娜，他与她互动并表达了对朱比亚的感情。随后一行人来到了吉尔蒂纳大城最大的城市德拉希尔，寻找有关木龙奥尔德隆的线索。纳兹和他的朋友们在人群中休息，但突然地面开始剧烈震动……！ ？ 这个小镇的惊人秘密被揭晓！
「妖精尾巴」落入了白魔导士的手中！？当纳兹等人抵达木神龙阿尔德隆的“右手城市”多拉席尔时，茱比亚拚命地发出了警告。原来白魔导士正在进行夺取五神龙全部魔力的“白灭计划”。被操控的米拉珍、戈吉尔、拉格萨斯接连向纳兹等人发动攻击。为了拯救同伴，他们必须与同伴战斗……这难道是「妖精尾巴内战」的再次上演！？
正如白魔导士所计划的那样，“妖精的尾巴”的袭击已经在各地展开。格雷面对雷神，纳兹面对伽吉鲁，露西面对米拉珍等人。为了击败强大的盟友，露西释放了她的新必杀技“星衣合成”。与此同时，针对五神龙的迪亚波罗成员也聚集在奥尔德隆。温蒂和查尔斯朝着右肩的球体前进，与新的噬龙者面对面……！
为了从白魔导士的控制中解放伙伴们，纳兹等人开始展开与「妖精尾巴」成员之间的内战。然而，目标锁定五神龙的DIABOLOS成员也加入了战斗。各地爆发了三方混战。击败了戈吉尔的纳兹，迎击新的刺客「灵龙雷斯」。自称幽灵的雷斯发动攻击，将纳兹的灵魂抽离。但在自己的无意识下的精神世界中，纳兹意外地与怀念的人们重逢了……！
纳兹对战雷斯、温蒂对战涅巴鲁、拉格萨斯对战奇丽雅、艾尔莎对战杰拉尔……「妖精尾巴」、白魔导士和DIABOLOS的三方混战愈加混乱。被逼入绝境的雷斯附身在马卡罗夫的身体上，向纳兹发起攻击。雷斯对他和马卡罗夫超乎想象的高同步率感到惊讶，原来他们之间有着意想不到的联系……！？而为了破解白魔导士的魔法，露西想出了一个秘密策略……！
在背上城市的教堂里，纳兹和哈比发现了倒下的桃华。当她醒来时，是那个憧憬着纳兹的桃华。从她的口中得知，白魔导士与「真正的自己」的关系被揭开……！？另一方面，击败奇丽雅并准备破坏宝珠的拉格萨斯，却被艾尔莎阻挡。面对持有灭龙属性武器作战的艾尔莎，拉格萨斯也施展出了新招式。「妖精尾巴」中S级魔导士的两人此刻展开了激烈对决！！
艾尔莎与拉格萨斯的激战终于落幕。察觉到各地战况不利的史卡利昂决定让「DIABOLOS」撤退。然而，正在与温蒂交战的涅巴鲁仍执着于捕食天龙，无视了命令。他使用了被视为禁忌的第五世代龙之力！在压倒性的力量面前，深感自身无力的温蒂，施展了仅能使用一次的附加魔法，孤注一掷。而降临到温蒂面前的，竟是恐怖的「绝望」……！
五颗宝珠终于被破坏了，木神龙阿尔德隆因此失去了力量，其强大的魔力本应落入白魔导士手中。然而，大地的震动直冲天际，阿尔德隆复活的咆哮响彻云霄。而白魔导士丧失了魔力，痛苦不已。面对高耸入云的木神龙，纳兹等人是否能够应对？而将白魔导士逼入绝境的恐怖黑幕，究竟其真实身分为何……！？
复活的木神龙操控着寄宿于宝珠中的守护神——神之种子，开始动手排除人类。面对着纳兹的乌尔芬，利用能够读取心中浮现的强者的能力生出了瑟雷夫……！？ 同时，各地也爆发了神之种子 与「妖精尾巴」之间的战斗。在围绕着宝珠的连续战斗中，疲惫不堪的露西和温蒂等人迎来了从白灭中解放的可靠伙伴的支援！与「妖精尾巴」的伙伴们齐心协力，迎接全面战斗的挑战！
「妖精尾巴」的伙伴们迎击树木巨人群，但不管怎么打都没完没了。要阻止巨人们的胜利条件就是打倒操纵他们的神之种子·梅特罗。格雷与茱比亚背负着众人的希望，联手挑战与强大的敌人作战！同时另一方面，杰拉尔与另一位神之种子·基亚兹对峙。然而面对基亚兹夺走思考能力的魔法，杰拉尔陷入了无法反击的境地。众人为对方互相着想的心意，成为战斗的力量！
成功击败了四位神之种子的「妖精尾巴」伙伴们。在布兰堤修的魔法下巨大化的戈吉尔，对木神龙展开了更猛烈的攻击。剩下的只有「本体」神之种子阿尔德隆。尽管魔力稍有下降，但阿尔德隆依然拥有强大的力量，纳兹决定与之对抗。「人类是我的养分」。对于毫不在意人命的阿尔德隆，纳兹的火焰熊熊燃烧起来！
纳兹和他的朋友们终于击败了木龙奥尔德隆。与朋友们短暂休息时，熟睡的白魔法师和藤香醒来了。白魔法师似乎有什么急事，留下了“埃伦蒂亚没有时间”的神秘文字，并使用水系魔法消失了。与此同时，纳兹和他的朋友们身上的魔法被激活，他们被传送到了遥远的土地。无法使用魔法的一行人感到困惑，但出现在他们面前的是怀念的“朋友”，有着熟悉的面孔……！
临界魔法世界爱连提亚。在这个魔力泛滥的异世界中，存在一只拥有跨越世界之力的龙──月神龙赛雷涅。纳兹一行人在与桃华会合后，一同寻找出身自爱连提亚的白魔导士。走投无路的白魔导士向纳兹等人求助，并透露自己的真实姓名，同时说明了爱连提亚所面临的问题和自己的使命，以及针对亚斯蓝德五神龙所策划的「白灭计划」背后的真正主谋……！
