...
1997年，元龙里小区一对父女在电梯口离奇消失。刑警何远航（潘粤明 饰）带新晋警员冉方旭（王鹤棣 饰）受命调查。冉方旭经侦查后认定失踪父女是为躲债故弄玄虚。经此一案，冉方旭崭露头角，何远航则因能力有限事业原地踏步。 2006年，徐父尸体被意外发现，推翻旧案结论。师徒再次搭档锁定嫌犯，但在追捕中嫌犯身亡，何远航受重伤，虽立功却被调至内勤。离开刑警岗位的何远航郁郁寡欢，与叛逆女儿何晓荷（任敏 饰）矛盾不断。2008年，冉方旭车祸身亡，何晓荷决心继承其遗志。 2018年，何远航退休，何晓荷成为刑警。两人偶然发现冉方旭的死竟与元龙里旧案有关。父女接力侦查，在元龙里即将拆迁之际，终于将隐匿18年的真凶绳之以法。
1997年6月30日，魏阳全城都在关注香港回归，一对神秘父女来到元龙里国际花园小区后离奇失踪。借调到刑警队的何远航与新晋警员冉方旭奉命一起搭档调查，两人在案情判断上产生分歧，随后又在调查方式上产生冲突，不欢而散。2015年，已经退休的何远航拉着来魏阳出差的冉方旭再次到元龙里寻找刚失踪的孩子韩梓昂，两人回忆起当年的失踪案十分感慨。
何远航感叹当年的失踪案至今还是桩悬案，冉方旭则坚持说是错案。1997年，何远航找从警多年结识的各种社会人员帮忙分发寻人启事，还通过走访调查去打探失踪父女的下落。另一边，冉方旭则运用警校所学知识以及对各种失踪案的研究，来到元龙里调查失踪父女的消失路径并找到重大线索。何远航接到线索举报后来到小区，一举抓获了嫌疑人金满廊。
何远航和冉方旭连夜审讯金满廊，但神秘父女的失踪与其没有直接关系，父女二人的去向依旧成谜。有群众看到寻人启事后提供线索，何远航和冉方旭来到消失女儿工作的足疗店调查，确认了女子的真实姓名叫徐萌。之后两人赶往徐萌的住处，探查时突然有神秘人来访。2015年，何远航和冉方旭在元龙里居然看到了1997年的寻人启事，更奇怪的是，寻人启事的墨迹纸张居然是新的，两人认为背后有人在搞鬼。
1997年，徐萌的住处早已人去楼空，何远航和冉方旭探查时遇见小混混上门找徐萌要债，盘问后得知小混混也不知父女俩的去向。两人决定先去徐萌的亲戚家找线索，亲戚说他们也不知道父女俩的行踪，随后何远航和冉方旭找到徐萌的债主金满山询问，也没有发现线索。2015年，何远航女儿何晓荷想调去刑侦外勤工作，被赵队委婉拒绝。何远航和冉方旭继续寻找失踪的韩梓昂，结果却撞上韩梓昂正持刀砍流浪汉。
1997年，矿场发生特大盗窃案，冯队要把冉方旭调到专案组，但冉方旭坚持继续调查父女失踪案，何远航也帮冉方旭说情，两人关系得到缓解。冯队限期三天查明真相，两人又返回足疗店调查，新的线索指向嫌疑人宋青松，冉方旭继续到元龙里寻找证据。2015年，何晓荷对何远航强拉冉方旭到元龙里找孩子的行为非常不满，何远航把冉方旭带到自己的书房，里面放着97年失踪案的海量资料。
1997年，冉方旭请宋青松到刑警队配合调查，来的却是宋青松的司机吴山龙。何远航和冉方旭问询无果决定跟踪吴山龙，之后见到了宋青松，但遭到他的反抗。宋青松逃跑，两人一路追踪结果以失败告终。何远航决定死盯宋青松，冉方旭发现元龙里居然还有隐藏空间，于是前去探查。2015年，全市接连发生少年失踪案，何晓荷想参与调查，领导却只让她负责韩梓昂持刀伤人的善后工作。
1997年，何远航跟踪宋青松，没想到被宋青松反将一军。冉方旭带着何晓荷来到元龙里的楼顶天台，准备把每个楼层逐一巡查一遍。何晓荷弄得满身狼藉，冉方旭带她到之前查案结识的乔素清家里清洗。何远航和冉方旭汇合，两人得到徐萌社会关系的新线索。2015年，何远航又带冉方旭来元龙里调查韩梓昂持刀伤人一事，冉方旭发现何远航真正目的是想带他继续调查97年的失踪案。
1997年，何远航和冉方旭根据新线索认为徐萌的一位客人孙正勇有重大嫌疑。两人在元龙里监控室查看监控时看见孙正勇正出现在电梯里，随后两人将其抓捕，一番审讯后发现孙正勇没有作案时间。何远航和冉方旭决定再去找宋青松，却被告知宋青松已经跑路，案件陷入僵局。2015年，冉方旭出差时间到期要返回北京，何远航想让他留下来继续查案，还拉着冉方旭当年的好友乔素清一起劝说，结果被冉方旭拒绝。
1997年，何远航和冉方旭在元龙里调查，终于查明了徐萌父女当日离奇消失的路径以及消失动机。何远航邀请冉方旭到家里吃饭，何远航的妻子想让何远航继续留在刑警队，何远航却想回派出所，两人因此产生矛盾。2015年，何远航对冉方旭的拒绝十分气愤，他不听冉方旭的劝阻来到元龙里继续调查，冉方旭无奈跟随，恰巧他们在元龙里碰到何晓荷，三人联手寻找韩梓昂持刀伤人的真相，之后冉方旭再次决定离开。
何远航到火车站送别冉方旭，两人依依惜别。何远航看着冉方旭离开十分不舍，心里不免悲伤，他回忆起两人当年查案的场景。2002年，回到派出所的何远航过得并不如意，老婆疏远、孩子叛逆，冉方旭则在刑警队屡破大案，成了远近闻名的神探，还升任了副队长。与此同时元龙里突然出现新的线索，97年的失踪案顿时成了凶杀案。
2002年，何远航和冉方旭研判凶杀案因宋青松逃到国外难以调查，他们在调查后发现宋青松的司机吴山龙也有作案嫌疑，但一时找不到吴山龙的犯罪证据。技术科的报告显示，凶杀案死者徐志宏生前有被长期投毒的嫌疑，何远航和冉方旭分头调查投毒人的线索。2015年，韩梓昂即将被学校劝退，何晓荷联系秦校长想让学校收回劝退的决定，秦校长让何晓荷七日内查明真相。
何晓荷为了证明孩子的清白来到元龙里寻找线索未果，何远航知道后再次带着她来到元龙里展开调查。2002年，何远航和冉方旭找到投毒嫌疑人张尔颂，一番调查发现投毒是场乌龙，但张尔颂提供了吴山龙的新线索。恰巧吴山龙来派出所报案，何远航和冉方旭审讯之下吴山龙胡搅蛮缠否认杀人。由于没有直接证据，两人决定分头行动，何远航调查其社会关系，冉方旭负责跟踪吴山龙。
2015年，何晓荷查到案件的新线索，她想进入专案组继续调查，再次被瞿大海婉拒。何远航来到刑警队为何晓荷极力争取，领导最终同意让何晓荷协助调查连环失踪案。2002年，何远航和冉方旭查到吴山龙的作案证据及背后动机，两人前往吴山龙的住所准备将其抓捕，结果吴山龙异常狡猾提前逃跑。两人奋力追捕下吴山龙意外身亡，何远航也因此受了重伤。
2002年，何远航和冉方旭觉得凶杀案还有疑点，何远航从徐萌亲戚处得到线索后赶往外地查实，另一边，冉方旭也从被抓小偷处得知元龙里的钱大钧藏有许多“宝贝”，于是前去查证。何远航到外地寻找徐萌的前男友万启明，万启明却恰巧去外地采风。冉方旭带着何晓荷到酒吧排练，与她约定两小时后接人。冉方旭返回时，酒吧突发大火被烧成废墟。
2015年，失踪孩子的家长来到警局讨要说法，赵杰队长向家长保证七天内破案。2002年，离开酒吧的何晓荷得知自己的好友死于大火十分崩溃，她与冉方旭起了争执后负气跑走，找到一处地方藏了起来，冉方旭着急带队寻找。另一边，何远航找到万启明，万启明交代了他与徐萌之间的往事，但万启明没有作案嫌疑，案件存留的疑点依旧没能解开。
2015年，何晓荷调查再度受阻，她与何远航讨论案情时受到启发，案件又迎来转机。2002年，冉方旭带着警队同事全城寻找何晓荷，何晓荷一心要离家出走，于是她决定跟新认识的苑自强离开魏阳。冉方旭找到何晓荷曾经藏匿的地方发现化名“苑自强”的梅叔是个被通缉的人贩子。与此同时，已经发现梅叔真实身份的何晓荷想逃走失败。冉方旭电话通知何远航，紧急关头何远航出现将何晓荷解救。
2015年，何远航带着何晓荷循着线索探查，何晓荷发现当年拐卖儿童案的人贩子梅叔再次出现，他与这些孩子的失踪有关联。何晓荷申请带队前往元龙里调查，何远航作为外援从旁协助。几人来到元龙里寻找梅叔，没想到梅叔已经死亡。2002年，何远航的救女行动让父女俩的关系得以缓解，冉方旭突然觉得何晓荷有做刑警的潜质。有人到刑警队报案称有元龙里凶杀案线索，何远航和冉方旭决定利用这次机会，彻底查清案件的真相。
2015年，梅叔尸检报告显示他只是少年连环失踪案的凶手之一，背后还有另一凶手。何远航、何晓荷等人通过监控找到线索快速锁定了另一名凶手并将其抓捕，同时解救了被绑架的孩子们。2002年，何远航和冉方旭找到已经偷偷返回魏阳的宋青松，宋青松交代了事情的全部经过，案件留下的最后疑点也被解开。
2015年，凶手交代了自己相继绑架多名孩子的经过，少年失踪案彻底结案。何晓荷将冉方旭的物品交给何远航，何远航通过冉方旭留下的手机信息得知冉方旭发现了新的线索，这个线索足以把当年查明的所有真相推翻，何远航十分震惊。2002年，元龙里案结案，何远航因为身体原因离开刑警队，调往新的部门。冉方旭继续留在刑警队，在一次整理档案时，他发现元龙里案的档案有新的疑点。
2015年，何晓荷来到警局档案室查找97年元龙里案的证物，发现重要证物“蓝皮鞋”不知所踪。何远航再次找到当年案件的知情人，他与何晓荷同时发现吴山龙是被人陷害的。何远航搬到即将拆迁的元龙里小区寻找线索。2002年，冉方旭瞒着何远航调查了多名当年与元龙里案相关的知情人，有人告知他一些新的信息。
