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暗殺者である俺のステータスが勇者よりも明らかに強いのだが
高中生织田晶与班上同学一起被召唤到了异世界。在召唤的影响下，他们每个人都被赋予了开挂级的能力，而他或许是因为天生就没有存在感，获得了平平无奇的“暗杀者”能力。然而，他这个本应平平无奇的“暗杀者”，面板数值竟然轻松凌驾了“勇者”这个最强职业！？其后，晶对作为召唤主使者的国王产生怀疑，一边隐藏自己一边试图揭露其阴谋，却反过来被扣上冤罪，遭到追杀。晶发誓要向国王复仇，逃入了人迹未至的迷宫深层，并在那里邂逅了精灵族少女艾蜜莉亚……这是一个，获得了“暗杀者”能力的少年与精灵族少女相遇，并成长为真正暗杀者的故事。
平静的日常突然被夺走，织田晶与同班同学被召唤到异世界。那个国家的国王照例说出那句老掉牙的话：「希望你能打倒魔王，拯救国家。」晶得知自己的职业是暗杀者，然而自己的能力值甚至超越勇者，令他困惑不已。晶不信任国王等人，决定独自行动。在搜集情报的过程中，认识了骑士团长萨兰。随后，他与同班同学一起前往地下迷宫，却面临了生死关头。
晶从迷宫生还后，得知勇者佐藤的异变与公主以及国王的阴谋有关。隔天，晶失去了这个世界唯一理解他的人。他被诬陷杀人，成为逃犯，铭记已逝恩人的忠告，开始潜伏于地下迷宫。经历一场场赌上性命与魔兽搏斗的战斗，他的等级逐渐提升。他在迷宫深处遇见一名美丽的精灵，名字叫做艾米丽亚。那是一场改变命运的邂逅。
晶与艾米莉亚并肩作战，打败第80层的头目后，头目显露出自己的真面目。它是一只名为黑猫的魔物，帮魔王带话给晶。完成任务后，黑猫要晶杀了自己。晶拒绝了，但如果不杀死黑猫，头目房间的封锁就不会解除，所有人总有一天会饿死。唯一能打开房间的办法，就是缔结主从契约。在这场一旦失败就是死亡的仪式中，晶窥见了黑猫的内心深处。
森之林大陆——那是距离雷帝斯王国非常遥远的精灵栖息之地。为了脱离迷宫，晶一行人进入通往艾蜜莉亚故乡的转移魔法阵出口。然而，与家人重逢的艾蜜莉亚却一点都不觉得温馨，事态甚至发展成妹妹绮莉卡和晶之间爆发一场称充满杀机的对决。激烈的打斗后，国王向绮丽卡吐露真相。那宛如忏悔般的自白，一同了结国王和绮莉卡的过去，以及绮莉卡和艾蜜莉亚的过去。
晶一行人越过海洋，抵达崭新的舞台。兽人大陆的兽之境。他们在当地遇见克罗乌，他不仅是一位拥有卓越技术的锻造师，更是前任勇者队伍中的幸存者。克罗乌见艾蜜莉亚下定决心要亲自谈判，便对她说出「阿朵雷亚的恶梦」。回顾那段经历百年岁月的回忆，夜的悔恨和克罗乌的悲愤都历历在目。此时，宿敌魔族突然现身，将艾蜜莉亚逼到绝境。
惊人的影之魔法如暴风般肆虐，将蹂躏港口城市乌尔的魔兽群一扫而空。但晶付出的代价过于惨重，魔力枯竭晕了过去。他才刚醒来，就为了拯救被囚禁的艾蜜莉亚展开行动。他在途中有了一场意外的重逢，并在兽之境迷宫内与夜谈心，道出正义这个概念的危险性。他们最后抵达迷宫深处，为夺回艾蜜莉亚而与魔族展开激战。
晶险胜魔族奥鲁姆，但他连喘息的时间都没有，魔族排名第二的真寻就出现在他面前。真寻含糊地透露自己意想不到的身世，以层级完全不同的实力压制晶。夜向晶提出唯一的对抗方法。在晶和变身后的夜联手作战下，与真寻打得不相上下。然而，潜藏在完美死角的陷阱却袭向晶。命悬一线的危机。不合常理的反击。谁能平息这场混乱无章的战斗呢？战斗结束后，晶许下了一个誓言。
在勇者一行的邀请下，晶等人来到了因祭典而热闹的玛莉之街。恰逢一场大型比赛正在举行，优胜者可获得豪华大奖。一听到“奖品”，艾米莉亚立刻认定那一定是美食，兴冲冲地报名参赛，并在报名处和自称拉提斯内尔的少女意气相投，度过了愉快的时光。与此同时，晶从与克罗乌的交谈中察觉到一个惊人的事实——操控人口贩卖的幕后黑手，竟与杀害克罗乌妹妹的凶手是同一人。这份重合究竟是纯粹的巧合，还是命运的必然？
晶与勇者小队就今后的行动方针进行商议。在确认彼此的最终目标一致后，双方决定暂时分头行动。于是，晶、艾米莉亚、克罗乌三人便前往王都乌鲁克城。在那里，与他们重逢的莉亚将晶和艾米莉亚引领至王宫。然而，在正式觐见时，乌鲁克国王不仅对晶表现出赤裸裸的轻蔑，甚至还提出一连串自私无理的要求。艾米莉亚因此愤然不满，而为了安抚她的情绪，晶不得不与近卫骑士展开对决。
那个对艾米莉亚穷追不舍的人贩集团背后的头目，那个践踏了克罗乌妹妹生命的仇敌，那个引发萨兰死亡的元凶；这三个线索最终汇成一条清晰的轨迹，而晶与克罗乌的复仇也在此重叠。他们要面对的目标，正是格拉姆·克拉斯特。察觉到晶内心深处的挣扎，艾米莉亚默默地替他担忧；莉亚的言行间，也悄然流露出对克罗乌的情愫；而勇者佐藤同样在与晶的相处中，坦率地吐露了自己心底的情感。在这座风景如画的城市中，晶陷入迷惘——而那份迷茫的影子，如同幼时的自己，再次映现在他的眼前。
这段与夜、拉提斯内尔的奇妙搭档旅程即将结束。这也代表对晶来说，已经集齐足以做出抉择的资讯了。当一行人弥漫着沉重的气氛，拉提斯内尔提议转换心情。于是众人决定走上街头。夜体恤晶，邀他单独谈话。夜这样的举动完全来自超越纯粹主从关系的情意。晶也回应夜的心意，诉说自己内心的脆弱。
终于，晶与格拉姆迎来了正面相对的时刻。站在他面前的男人毫不掩饰自己残忍而卑劣的本性，仿佛将艾米莉亚据为己有本就是理所当然之事。更甚者，他还肆意嘲弄萨兰之死，这一举动彻底点燃了晶心底深处的怒火——也让晶下定决心，将格拉姆视为必须亲手了结的存在。将艾米莉亚与夜都刻意支开后，晶独自一人凝聚决意，开始为行动做准备。然而就在那一刻——一个出乎意料的人，向晶开口了。
