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该剧讲述澳门“风潮”时期，何若贤、冯柏川、沈氏兄弟等人携手在金融、谍报、物资运输等领域的抗战风云故事，也是第一次将镜头完全聚焦于“孤岛”澳门——这块未遭日本侵占，却仍然英勇抗击共赴国难的土地。
二十世纪四十年代香港，汇隆银号经理何贤一家正在吃茶点，何贤告诉夫人郭绮文，自己一会儿要去澳门办理金融从业许可。澳门码头海面，疍家渔船上一派恬淡。 何贤到澳门办理金融从业许可，正好碰上了澳门各界爱国募捐义演，现场气氛热烈，海面上疍家渔民们也被感染，纷纷解囊，托小渔为他们带上捐款。
澳门，马万祺与林老板刚准备发货，就被匆匆赶来的葡商罗德礼叫停——他要求货款改付美元。矢崎连夜召见泽荣作、福江商议澳门问题对策。罗德礼仓库办公室内，马万祺等傻了眼，这么大笔货款，仓促之间，上哪儿去换成美元？罗德礼却不管这些，不付美元，绝不发货。
何贤妻子郭绮文委婉劝说何贤将最后一笔留作家用，纠结后何贤最终还是扛住了诱惑，按时出现在金融街，等待这位神秘客户的出现——即便此时家中已准备举家迁往澳门，而最后一位持单者的存款是家里最后的积蓄。英军上尉威廉卷入钨砂走私案，央求妻子玛丽求助远亲莱恩斯上校，将罪责推给水警小队长杨昌。
夜幕下，尖沙咀海滩，争相逃命的难民人山人海。船少人多，一座难求，一片混乱中，船价更涨上了天。乔音婉因相册跌落险遭踩踏，幸得何贤出手相帮。但因之前的误解，她一时也说不出感谢的话来。杨昌与玛丽一行顺利登船。何贤搜空全家剩余的钱交了船钱，却偏偏被杨昌、黄子侠认出了他。帮过黄公杰的人还想上大濠帮的船？黄子侠把何贤全家赶下了船。
柯麟医生带领医疗队进入关闸内救助难民，意外与弟弟柯正平重逢，才知弟弟正是护送首批保护对象的地下党。兄弟二人默契配合，将何香凝、柳亚子等保护对象伪装成医疗志愿者，避开了日军搜捕。黄公杰带着特务混入关闸，借发放通行证之机排查“逃犯”，蔡楚生等人险些暴露，幸得何贤机智解围。
泽机关，泽荣作给黄公杰下达了任务：一是继续搜捕失踪的中国名人及英军逃亡战俘。第二个任务更紧要，他要黄公杰马上带人马去一趟中山，武力控制中山米市，禁绝粮食输入澳门。中山县内，黄公杰在日军授意下以暴力封市，强占全县粮食，血腥镇压反抗者。澳门，日军拦截越南运粮船，并封锁拱北口岸，导致澳门粮价暴涨，难民饿殍遍地。
澳门街头，柯麟义务防疫点看诊，乔音婉路过见柯麟忙不开，主动帮忙。花尾渡，郭绮文让仔仔把煎好的药端给小渔妈，这才发现小渔母女早已不知去向。镜湖医院，经柯麟诊断确认，病人里出现霍乱病例，镜湖医院因此被列为防疫医院，不再收治其他病人。
马万祺牵线大濠帮黄三合，黄三合起初因中山被黄公杰控制而犹豫，直至龙海珊亮明身份——她正是中山抗日游击队白鸽队队长，曾与区司令共同抗敌救人，黄三合感念救命之恩，同意在除夕之夜协助转移。镜湖医院，里夫向柯正平求助，柯正平并未承认自己的身份，只让他等消息。
面对泽荣作的一再质疑，押车的柯麟摆出诸多证据，时间线也无懈可击。泽荣作仍不死心，坚持开车厢验尸，柯麟淡定打开车门。车内并无异常，泽荣作最终只能悻悻离去。原来，柯麟从医院运出的，正是全体保护对象。是柯正平通知杨昌，提前在棚屋区收集好了足够的尸体，及时在中途完成了替换。
一切准备就绪，计划如期开展——何贤带着崔、傅的合同，争取到了黄公杰的信任，并拿到了其亲笔写下的售粮委托书，以做自己日后的脱身保障。黄公杰有意防备，何贤顺水推舟，同意用联昌团队运粮。何贤前往联昌办理通航手续，巧遇何鸿燊，何鸿燊展现出惊人能力，一月内掌握日语和葡语，高效完成通航审批，获斋藤赏识。
黄公杰满心欢喜地给泽荣作打电话，准备随时出手大赚一笔，却得知澳葡政府拒绝了签约。码头戴思乐宣布喜讯，民众一片欢腾，黄公杰却气得跳脚，正准备却发现何贤被绑在角落里。黄公杰再三审问何贤，何贤却回答得滴水不漏。烂赌荣虽然拼命喊冤，说辞却漏洞百出。
玛丽毫无情报工作经验，杨昌旁敲侧击，让玛丽聘用自己为雇员——经过买粮事件，出于对何贤等人的钦佩，杨昌也决心干点正事。乔音婉入职镜湖小学当音乐老师，何贤夫妇协助乔音婉布置新家。另一边，汇丰银行的乔仁宇、祁礼宾遭日军矢崎胁迫签发无储备金的巨额港币。矢崎以枪杀职员及家属威逼，乔仁宇不忍众人被害只能暂时答应签字。
镜湖小学，何贤为了避免乔音婉看到乔仁宇为日军做事的新闻，趁午间休市赶去探望，却撞上杨昌找何贤确定罗伯特身份，三人一同赶往镜湖医院。在柯麟的抢救下，罗伯特临终前向何贤揭露日军逼迫汇丰签发 1.2 亿无储备金新港币、计划作废港币的阴谋。泽荣作率人一路追到柯麟诊所，为了防止消息泄露，他把所有人都扣在诊所，防止消息外泄。
三方会谈上，马万祺代表华商与日方竞价，乔仁宇被日方带来验证李光前合同签名，何贤担心假签名暴露，没想到乔仁宇却认定签名是真的。洗手间内，乔仁宇通过肥皂刻字传递出日方伪造的一亿两千万港币的钞号区间。何贤破解信息，确认了这批无储备港币的具体范围。
柯麟安排马万祺说服大濠帮黄三合投入资金，以 “运现金” 的假象迷惑特务；何贤则找到乔仁宇的妹妹乔音婉，告知其兄长参与的港币阴谋。下午开盘，大西洋银行董事局内部生变，罗德礼力排众议停止抛售并转为买入。乔音婉在交易所外揭露新签港币是日军掠夺来的无储备钞票，且即将被废除的真相，引发市场恐慌。
香港，日军宪兵司令部刑讯室，乔仁宇已遍体鳞伤。酷刑之下，他始终坚持，自己没有向任何人泄露过逼签港币的钞号。何贤一战成名，被破格聘请为大西洋历史上首位华人业务经理。乔音婉深受打击，即便郭绮文登门劝说，她依旧过不了心中那道坎，洛柏因此对何贤充满敌意。
原来威廉提出：想要救出乔仁宇，必须连他一起救，玛丽被迫无奈，只能答应。泽荣作撞破威廉接近乔仁宇，威廉立即供出了连带玛丽在内的营救计划，台湾看守牺牲。矢崎得知仍有大批印钞纸藏在香港，喜出望外，一面下令刑讯祁礼宾、乔仁宇，一面命泽设下埋伏抓捕玛丽等营救者。当玛丽按计划引导日军伪装 “患病” 的乔仁宇进入医疗所时，威廉叛变指认。
握住妹妹的手，乔仁宇向矢崎提出要吃一份苹果派。兄妹俩通过童年童谣与回忆暗语交流，日军监听未察觉异常。乔仁宇假意承诺交代印钞纸下落，要求先释放妹妹。待乔音婉安全离开后，他趁矢崎不备袭击对方，随后纵身跳楼牺牲，以生命守护秘密。目睹哥哥的牺牲，乔音婉悲痛欲绝。
马万祺将何贤留在了满载印钞纸的后船上，自己与大濠帮水手驾驶空船，在前方开路。澳门海域就在前方，迎面，黄公杰率领的几艘快船却搜索而来。为掩护载有印钞纸的船只，马万祺主动暴露吸引日军火力，幸亏游击队及时赶到支援，剩余人员最终将印钞纸安全送达澳门。
大西洋银行，何贤力排众议，说服大西洋银行及华商银号共同承销，公债发行顺利推进。柯正平现身，带来华北敌后军队急需过冬物资、药品的消息，何贤等人当即决定筹措。何贤向罗德礼订货时，得知其货物在拱北被日军以 “无泽机关通行证” 扣留，泽荣作借此施压澳葡政府，要求禁止华人反日。
