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鎧真伝サムライトルーパー
新生！超越时代的武士，参上！ 曾经让人间界陷入恐怖的妖邪界封印被解开，无数妖邪兵开始了入侵。奔赴人类危机的是五位年轻的武士。他们名为，武士军团！！他们的战斗之日，即将开启新的篇章！
妖邪界袭击35年后，以柳生娜斯蒂为中心成立的“防卫特殊案件对策总部”（通称DST），正致力于强化防卫力量并培养肩负下一代的铠传战士。为了防备妖邪界可能再次入侵的那一天…… 而这一天终于到来了。连接妖邪界与人间界的门突然出现，妖邪开始入侵人间界。北条武藏等现任铠传战士们勇敢地迎接这一紧急事态。 然而，在口中哼着怀旧金曲的残忍妖邪面前，他们完全束手无策……
上杉魁人在追踪杀害祖母芳江的妖邪途中，盗走了武装齿轮。随后，在他为了祭奠祖母而前往的火葬场，那些无处可去的死者化作“傀儡”向魁人袭来。为了保护其他幸存者，他试图变身为“Under Gear”战斗，但面对曾是人类的傀儡们，他犹豫了。就在这时，织田龙成和凯现身并开始与他并肩作战，然而十勇士之一的根津也随之出现了——。
魁人正式成为了铠传的新成员。与此同时，北条大和也擅自加入了进来。凯等人带着新成员开始了成为铠传武士的特训。然而，满怀热忱参加的大和甚至连武装形态都无法进入。就在这令人焦躁的情况下，十勇士中的才藏和镰之助攻了过来。看着凯他们展现特训成果，自己却束手无策的大和，想起了曾经救过他们的英雄所说的话——。
在各自发动铠甲装备，作为新生铠传勇士初具雏形的凯等人面前，前任铠传勇士石田紫音突然现身。这位断言“无论是妖邪还是勇士，都由我来无双”并穿上独自开发的动力装甲的青年，究竟是敌是友？就在这时，龙成因不明原因的剧毒倒下了。甩开龙成并叫他别碍事的紫音，独自叩响了通往妖邪界的大门——。
妖邪帝王罗真我终于在凯等人面前现身。面对其压倒性的力量，凯他们甚至无法靠近。就在陷入绝境之际，龙成及时赶到，与紫音一同协助铠传战士们展开反击。随后，他们突破了守护罗真我的结界，凯与罗真我正面交锋。凯能否抓住这大好时机，亲手打败自己的父亲——。
罗真我表示会给凯他们七天的宽限期。在凯被迫选择是乖乖成为罗真我的傀儡，还是寻找替代傀儡的过程中，魁人一行人正沉浸在失去龙成的悲痛与战斗的残酷之中。紫音独自背负起龙成留下的遗愿，宣称“我要创立新生铠传”，并夺取了要塞列车——。
山野纯拥有关于能打倒罗真我的传说之铠“霸皇帝”的情报，但他现在的样子与少年时期的照片判若两人。为了完成霸皇帝，必须得到霸道之镜，加入了紫音的新生铠传武士小队动身前往调查寻找镜子。那里是大和与武藏度过幼年时光的儿童福利院。两人与院长时隔数年再次重逢，但院长那与记忆中截然不同的温和态度让武藏感到了一丝违和感——。
由于宇治原院长留下的冲击性事实，魁人一直无法释怀自己的身世。就在这时，众人得知要完成霸皇帝，仅靠集齐三件神器是不够的，还必须让制霸之剑重现往昔的光辉。为了达成这一目的，凯等人得知需要某种圣兽的力量，于是与纯一同前往动物园寻找圣兽，然而傀儡们却诡异地苏醒了——。
由于宇治原院长留下的冲击性事实，魁人一直无法释怀自己的身世。就在这时，众人得知要完成霸皇帝，仅靠集齐三件神器是不够的，还必须让制霸之剑重现往昔的光辉。为了达成这一目的，凯等人得知需要某种圣兽的力量，于是与纯一同前往动物园寻找圣兽，然而傀儡们却诡异地苏醒了——。
闯入妖邪城的凯等人面前出现了五道门。罗真我以美丽为人质，向五人发出了习得奥义的试炼。而在门后世界等待着的十勇士，则向凯等人拷问“仁义礼智信”之心。何为正义？战斗的理由又是什么？为了救出美丽而奋起的凯等人，能否习得奥义并成功发动霸皇帝——。
凯一行人终于发动了霸皇帝，以压倒性的力量克服了残酷的命运。思念着牺牲的同伴，佐助开始对他们的战斗产生怀疑。在罗真我面前，凯一行人被告知了35年前令人震惊的事实。随后，盛大宴会的帷幕拉开，与罗真我的正面交锋正式开始——。
凯与真田辽。灼热与烈火。两位火焰使者并肩而立，对峙着夺得梦寐以求的霸皇帝的罗真我。铠传勇士们是否还留有足以对抗最凶霸皇帝的力量——。铠甲在闪耀！照亮黑夜！五位年轻的武士向最终决战发起挑战！
凯挺身而出，为妖邪之乱画上句号的三个月后。DST 接替纳斯蒂，迎来了新任司令官，满目疮痍的东京也显现出复兴的迹象。就在人们安享这份和平时，唯有凯一行人们，因凯的缺席而心中怅然若失。然而，东京上空再度出现异象，预示着妖邪即将卷土重来。于是凯一行人们为查明缘由奔赴妖邪界，在寂灭之泉，发现了已然石化的凯 ——。
此番，为毁灭人界与妖邪界，来自天导界的阴冥现身于此。在他身旁，是一身天导界装束的龙成。而夺取凯的肉身得以复活的罗真我，将矛头对准了阴冥与龙成，战局愈发陷入混乱胶着。龙成投向凯一行人的冰冷目光，其真正用意究竟为何。面对摆在眼前的残酷现实，他们又将做出怎样的抉择 ——。
英雄凯再度身披霸皇帝，回到了凯一行人的面前。达成压制妖邪界这一目的的阴冥释放出威力强大的天业，与龙成一同离去。士兵与十勇士从正在崩塌的妖邪界仓皇逃离。众人回到人界后，来自天导界的四兽士 —— 古冥、死冥、骸冥，挡在了他们的去路。四兽士此番前来，目的是夺回霸皇帝。凯一行人陷入苦战，就在这时，不知从何处，有声音向凯呼唤而来 ——。
紫音与龙成在充满回忆的地方对峙。紫音想要探明对方的真实心意，换来的却是龙成冷漠的态度。曾一同度过训练岁月的二人，将会道出怎样的话语。 就在此时，佐助知晓了寄宿于凯体内的祢津等人姓氏一族的存在，下定决心要助凯一行人一臂之力。 联合训练就此展开，可佐助一众始终找不到战斗的意义，训练之时完全无法投入心神。见状，紫音向佐助他们提出了一个方案。那正是紫音自己过去对战斗的理由感到迷惘时，亲身经历过的办法 ——。
吸收人类生命力而化作漆黑形态的霸皇帝，不断折磨着凯。面对阴冥陷入绝境的凯，出手相救的竟是本应站在敌方的龙成。从背后刺穿阴冥的龙成，其真正的用意究竟为何 ——。与此同时，天导界开始搜寻完成真正霸皇帝所必需的“霸业之盾”。各方心思盘绕交错，战斗的走向朝着出人意料的方向发展 ——。
紫音为了覆灭印冥，代替龙成献出了生命。继承这份意志的龙成，再度披上闪光铠甲。再次启动的霸皇帝反弹了霸者勾玉的力量，成功击退印冥。然而代价太过沉重，无人能为这场胜利感到喜悦。众人皆沉浸在失落之中，凯前往纳斯蒂处寻求指点，得知紫音在开战前曾来找过纳斯蒂。紫音当时倾诉的心意究竟是什么。而再度奋起的凯一行人所选择的答案又是 ——。
凯一行人背负着紫音的心愿，下定决心连紫音的那份一起战斗，他们压制住盖梅召唤出来的怪物，与第一关隘的守门人盖梅展开战斗。面对惊人的力量，凯等人陷入劣势、身处绝境，佐助一行人及时赶来支援。一直在持续修炼以习得奥义的他们，能否真正成为英雄？又能否成功施展奥义——。
习得奥义的佐助一行人成功击败盖梅，刚刚开始产生默契的凯等人，却因罗真我暗中谋划而被分割成两股势力。魁人一行人被俘的第二关隘处，四兽士中唯一的女性——希梅挡在他们面前，众人被迫迎接没有凯参战的这场试炼。另一边，西造等人与再度夺走凯身体的罗真我对峙。印梅夺走了盖梅胸口的水晶，萨古梅不惜损耗自身推进计划。怀揣各自的盘算，一场赌上真正霸皇帝之位、前所未有的生存之战就此拉开序幕——。
