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新安琪莉可
故事发生在第一季六个月后。前半部分描绘了背负成为“女王”命运的女主角与伙伴们一同奔走、试图拯救走向毁灭的世界的姿态；而后半部分“Second Age”则展开了更加波澜壮阔的故事。以命运的巨大齿轮开始转动的阿尔卡迪亚为舞台，故事围绕在更加荒废的世界中交错的各种人间百态展开。因名为“塔纳托斯”的魔物失去双亲的少女安琪莉可，作为拯救世界的“女王之卵”，与雷因、尼克斯、杰特、日向这4位伙伴一同成为净化塔纳托斯的“晶石猎人”。在这场战斗中，安琪莉可逐渐觉醒真正的力量。就在此时，发生了震撼整个阿尔卡迪亚的事件……事件之后，晶石猎人们突然消失了踪影。追查他们下落的新闻记者贝尔纳和情报商罗什努力收集情报……另一方面，长年传承女王传说的“塞莱斯蒂亚教团”也即将遭到无情波澜命运的袭击……
阳炎邸被烧毁后，塔纳托斯以惊人的速度增殖，太阳已有六个月未见。大多数人将责任归咎于晶石猎人。
雷因带着贝尔纳和罗什来到火灾后众人一直躲藏的地方，讲述了那天发生的事情。马蒂亚斯接受了艾伦弗里德的提议，建造Jinx并饶过约尔戈。
在前往塞莱斯蒂扎姆的途中，安琪莉可被三个男人抓住。一位女子出现救了她，原来是一艘船的船长。途中塔纳托斯袭击了船只。
塔纳托斯出现在“灵魂幻影塔”，银木骑士们前往调查。途中，迪翁爵士向安琪莉可讲述了日向的过去。
雷内和安琪莉可在圣都见面，他告诉她自己将接任组织的领袖。罗什和贝尔纳试图通过研究一封过去的信件来查明尼克斯的真相。
就在雷内即将加冕之际，马蒂亚斯阻止了仪式，声称只有他才能成为国王。杰特知道自己时日无多，请求安琪莉可和他一起逃走。
马蒂亚斯命令杰特将安琪莉可带到他面前。当尼克斯和安琪莉可来到尼克斯的家时，她询问他那晚在阳炎邸发生了什么。
一行人安全抵达尼克斯的家，安琪莉可告诉大家尼克斯被埃列波斯附身了。艾伦弗里德因制造神器芯片而感到内疚，为弥补过失给了雷内一个幸运符，用于拯救马蒂亚斯。晶石猎人正在安全转移时，贝尔纳发现罗什不在队伍中。
在前往沃顿拯救约尔戈的途中，艾伦弗里德得知约尔戈的处决定于次日清晨日出时执行。约尔戈和艾伦弗里德前往法里安，研究如何让星之船再次飞行。杰特出现在晶石猎人面前。
雷内向晶石猎人讲述了关于埃列波斯的事情。圣都变得空无一人，马蒂亚斯感到非常孤独。雷内找到马蒂亚斯，请求他的原谅，因为自己从未考虑过马蒂亚斯的感受。马蒂亚斯出现在众人面前，而埃列波斯饶了罗什一命。
尼克斯出现在晶石猎人面前，众人试图与他讲道理，但罗什和安琪莉可告诉他们这是徒劳的，因为尼克斯已经被埃列波斯控制了。
所有人都恳求安琪莉可留下来。她终于告诉大家，她唯一能获得幸福的方式就是保护阿尔卡迪亚免于毁灭。就在大家即将乘船出发时，艾伦弗里德发现船上被安放了炸弹。
最终话。晶石猎人乘坐星之船抵达埃列波斯所在之处，发现那是一片荒凉的阿尔卡迪亚，只有阳炎邸完好无损。尼克斯短暂恢复了对身体的控制，安琪莉可呼唤尼克斯回来。晶石猎人攻击尼克斯以保护安琪莉可，但过去三位女王之卵的形态向他们发起攻击。安琪莉可持剑冲向尼克斯，要求埃列波斯把尼克斯还回来。
