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在南北合作沼气水合物海拔基地，明俊和珍才作为南北研究负责人重逢，十三年前在俄罗斯留学时期相爱的他们曾经无奈分手。十三年后珍才想重新开始这段爱情，但明俊却担心再次给珍才带来伤害。两个人的不同的态度产生了误会，在基地内南北组员之间也产生微妙的矛盾。
南北团结队与澳洲的世界杯预选赛开始，在基地观看电视比赛的南北队员之间发生了矛盾，最后演变成了相互拔枪，在开发组总负责人徐明俊的说服下平息下来。这一时刻南北团结队打败澳洲进入世界杯，第二天即将举行南北自由往来议题的历史性正常会谈。明俊确信不久会论议统一问题，他为珍才的生日准备了戒指，误会明俊的珍才向政府报告完成了接收沼气水合物的核心技术。
沼气水合物正式启动当天，基地发生火灾，徐明俊追查责任，决定把疏忽检查的朝鲜的技术人光泰等三人驱逐基地。但是依然发生接二连三的事故，原来这一切是朝鲜研究员为了让林珍才夺取沼气水合物核心技术的计划。因自己的失误感到心情沉重的光泰等人为了挽回错误来到事故现场，不知道里面有人的研究人员放下防火墙，阻断了事故现场。珍才潜入明俊的房间偷核心技术，发现锁着核心技术的保险柜的密码是自己的生日后震惊，还发现明俊为自己准备的礼物和信，明白自己一直误会明俊。
朝鲜军部占领沼气水合物基地，要求徐明俊对朝鲜忠诚。明俊用核心技术来要求队员们的安全，但随后被告知核心技术已被珍才转交到朝鲜的事情。发生事故后从基地撤出的记者朴惠贞得知朝鲜军部占领基础的事情，于是掉头重新来到基地。徐明俊在珍才的帮助下成功逃脱，这一幕被朴惠贞拍下，基地情况通过电波迅速被外界传出。
参加下届大选的现任总统姜大炫在离大选6个月的时候突然昏迷不醒，竞争对手正义党代表吴昌日趁机确保了50%的支持率，政界关注起青瓦台秘书室长朴道明的行踪，不知道朴道明选择谁来当下届总统的人选。徐明俊从沼气水合物基地凯旋而归，朴道明向他提议做这个国家的总统。
国情院接到朝鲜和俄罗斯将有武器交易的情报，怀疑徐明俊泄露了核心技术，指责徐明俊是间谍。为了阻止朝鲜把核心技术交给俄罗斯，国情院决定杀死唯一知道技术密码的珍才。预感到珍才陷入危险的徐明俊向记者朴惠贞寻求帮助。
朝鲜为了把沼气水合物核心技术卖给俄罗斯，带着珍才前往位于布勒特斯特的秘密研究所，依然怀疑珍才的军部对她严密监视，并计划完成技术移交后立刻除掉珍才。而韩方也开始迅速行动，为了阻止移交核心技术，最好的方法就是除掉握着密码的珍才。徐明俊也为了救珍才前往布加勒斯特，一落地就被一群人追击。
明俊摆脱国情院和朝鲜作战部的严密监视，成功带着珍才逃离。腿受伤的珍才把核心技术的密码交给明俊，让他一个人逃跑。因移交前的突发事件，俄罗斯对朝鲜施加压力。而通过卫星预感朝鲜和俄罗斯之间进行秘密武器交易的美国也开始行动起来。正当所有人寻找明俊和珍才的行踪时，明俊前往出国时得到帮助的大山企业位于图尔达当地的工厂。
明俊和珍才在林哲宇的朋友帕维尔的帮助下计划越国境，不料在约定场所等待他们的是帕维尔的尸体。这时闵东基举着枪出现。在国内传开徐明俊把核心技术卖给俄罗斯的消息，朴道明来找吴昌日解决混乱局面，两个人找出解决方法。徐明俊再次成为英雄回国。
徐明俊决定接受朴道明的提议，参加韩半岛的大选。吴昌日访问韩美联合训练现场，严重警告朝鲜恐怖组织，成功把人们关注的焦点从徐明俊转移到自己身上。曹国哲在演讲中表示韩国下届总统会由自己来决定，徐明俊绝对不会当选总统，南北关系再次陷入紧张。
徐明俊的‘不能论北是敌人’的发言引起一阵骚乱，朴道明告诉徐明俊要立刻重新发言，被徐明俊断然拒绝。朝鲜军部给珍才最后一次活命的机会，就是让她公开批判自己的父亲，并发誓要对共和国忠诚。珍才父被处刑，明俊接到消息后陷入混乱。
明俊疯狂地开车来到板门店附近，但是想到自己无能为力，再次感到绝望。徐明俊留下要去一个地方呆几天的话后失踪。为了去找珍才，明俊要做的第一件事情就是去找因自己的发言而受伤的西海交战中的兵士的家人，去请求他们的原谅。
徐明俊独自参加西海交战战士团追悼会，得到家属们的原谅。徐明俊的支持率也逐渐上升。这时闵东基从朝鲜来到韩国，他告诉明俊如果去朝鲜就可以救出珍才，并告诉去朝鲜的出发时间和地点。想到可以救珍才，明俊开始焦虑不安。
回到朝鲜的闵东基给珍才带来明俊的照片。最终明俊没有接受闵东基的条件，选择了国土大长征。虽然徐明俊得到大众的关注，但国土大长征却被舆论排斥，原来是吴昌日利用媒体阻止了明俊的国土大长征。
网络上迅速散播希望树的照片，国土大长征的参与者们也越来越多起来。感到危机的吴昌日欲利用一直怀疑徐明俊和闵东基之间的申昌锡，情报机关开始监视徐明俊的邮箱和手机。从监狱放出来的珍才回到家给明俊发邮件。
徐明俊的支持率得到第一位，珍才越过国境来到韩国。洪学秀下令对外界严守珍才来韩的事情。不料珍才来国情院接受调查的时候，已经有无数媒体在等待。
媒体报道了珍才和明俊的恋人关系，记者们围在明俊家门前追问，明俊表示不回答相关问题，以为明俊会否认与珍才关系的参谋们感到震惊。朴道明来找珍才，表示她父亲希望的和平和统一的梦想现在该由明俊来继承。
明俊在姜东元的帮助下终于和珍才见面，但珍才告诉他回去实现统一的梦想，不要再来找自己。第二天珍才在记者招待会上表示自己和徐明俊只是研究院同事，并不是恋人关系，遭到吴昌日方面的最后反击，这时徐明俊走进会场。
