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迷失
大家继续探索孤岛的秘密，寻找脱身方法，没想到的是，岛上竟然存在组织严密、早就在此生活的“其他人”。“其他人”将杰克（马修·福克斯 Matthew Fox 饰）、凯特（伊万杰琳·莉莉 Nicole Evangeline Lilly 饰）、索亚（詹姆斯·福特 James F ord 饰）抓进了监狱， 他们设法逃脱，帮助杰克逃脱的是“其他人”中一个叫朱丽叶特的女人（伊丽莎白·米切尔 Elizabeth Mitchell 饰），她跟着杰克来到营地，又揭露了岛上存在过的“达摩计划”，而今“其他人”的领导者本（迈克尔·爱默生 Michael Emerson 饰）正是曾摧毁“达摩计划”的人。朱丽叶特到达营地，似乎带着本赋予她的使命，即带走幸存者中的孕妇……
杰克被囚禁在达摩计划的水底工作站Hydra里，这时一个自称称朱丽叶的女人出现，试图与他沟通。凯特和索耶被关在附近的笼子中。索耶尝试和另一个叫Karl的小伙子（“其他人”一员）一起逃跑，却不幸又被抓回来了。“亨利·盖尔”的真名叫班，并且是这群“其他人”的领导。回忆里面，杰克努力找出谁抢走了他的妻子萨拉，导致了他们婚姻的失败。杰克怀疑他自己的爸爸，因此在戒酒中心的聚会上打了他一顿。杰克被捕，而他的太太保释他。
班和杰克作出了交易：只要杰克合作，班就会放他离开荒岛。“其他人”要凯特和索耶敲碎石块，而他俩那时才发现他们一直都在闭路电视里受到班的监视。在帆船上，善华、真秀和萨伊德被“其他人”暗中袭击。善华一枪射穿了“其他人”的一员Colleen，而帆船则后来被“其他人”拿去。最后他们三个人走回到了生还者营地。回忆中显示出善华的父亲发现了她和Jae Lee的不寻常关系，并命令真秀杀了Jae。然而真秀只是威胁了他，尽管最后Jae还是跳楼自杀了。
洛克、戴斯蒙德和伊高在舱口内爆之后并没有死。洛克在暂时说不了声的同时，却仿佛看到了布恩，于是因为某些相关的原因和查理一同从一头北极熊的洞穴中救出了伊高。赫利逐渐发觉在舱口内爆后，戴斯蒙德有了“记得”未来事件的能力。回忆里面，洛克是一个大麻种植场社区的一分子，有一次他意外地从外带进了一个假装迷路的警察。
可琳因枪伤去世，她的丈夫皮克特以殴打索耶泄愤。索耶受班的欺骗，以为一个心脏起搏器已经被植入自己的体内，只要自己的心跳超过每分钟140次，心脏便会爆炸。班后来告诉索耶他尝试逃走是没用的，因为他们根本不在生还者营地的那个岛上，而是旁边的另一个小岛。回忆中，索耶因欺骗罪入狱，却发觉自己有一个女儿。在假装对女儿毫不经意的同时，他也给了女儿一大笔金钱。
伊高跟着一个似乎是他死去的弟弟的人走进了丛林，却发觉那是只烟雾怪兽，正准备要杀了伊高。杰克知道了自己被“其他人”捉去，是为了要帮班做脊椎肿瘤切除手术。茱莉叶倒戈相向，并和杰克一起对抗班，还设计了一个计划，要杰克在做手术时假装意外杀死班。在回忆中，伊高的弟弟死去之后，他成为了一名牧师，而且为了保护自己的小镇而杀死了几个威胁他安全的人。
凯特和索耶在笼子里做爱，表示出大家互相的爱情。杰克中止了班的脊椎手术，并且威胁“其他人”要是不给凯特和索耶时间逃走，他就杀了班，这时火冒三丈的Pickett差点杀死索耶。回忆中，凯特千方百计想过正常的生活，却最终还是在对丈夫自首之后逃走了。
“其他人”之一的青年艾莉克斯提供了一只独木舟给凯特和索耶，让他们回到自己所住的岛屿上；却要求他们先让她救出自己的男朋友，因为他被关在一间房间里被迫开影片洗脑。茱莉叶从后杀死了用枪指著凯特和索耶的Pickett,另一方面杰克完成了班的手术。回忆里描写，飞机失事之前三年，茱莉叶一直是一位不孕症医生，并且曾是自己不育的妹妹怀孕。Mittelos Bioscience访问茱莉叶。
查理和赫利尝试灌醉戴斯蒙德，好套出他能预见未来的原因。回忆描述在舱口内爆之后所发生在戴斯蒙德身上的事。他回到了过去，重新过了一次来荒岛之前和Penny一起的生活。同时他在买戒指时从一位能预知未来的店主学到了宇宙有“路经修正”的能力，世上所有的事件如果要发生，就终会发生，谁也阻止不了。他忽然又回到了岛上，从此有了能看到未来片断的能力。他沿用学到的道理，预言查理被上天选中，很快便会死。
茱莉叶因谋杀Pickett而接受审讯。有了杰克和班的帮助，茱莉叶才没有被判死刑。“其他人”和杰克回到了“其他人”在生还者营地所处的岛屿上落后的住所。回忆中，描述杰克在一次奇异的泰国旅行中认识了一个泰国女人，并得到了他肩膀上的纹身。
凯特和索耶回到了海滩上。赫利在森林里找到了一辆被荒废的破旧小货车，并且和查理、索耶和真秀一起驾驶它。凯特、萨伊德和洛克出发营救杰克。回忆里，赫利的父亲在赫利赢得乐透头奖之后回家了，因此被赫利认为是为他的奖金而来。
洛克、萨伊德和凯特调查一个达摩通讯站，并遇到了居住其中的Mikhail。离开时，洛克把这个工作站炸了。索耶为了取回自己的财物而和赫利进行了一场乒乓球赛，然而他输了，因此需要遵守约定：一个星期之内不准帮人们改别名。回忆里面，萨伊德在巴黎碰上了一个他曾经拷问过的犯人。
克莱尔得知了德斯蒙德能预知未来的秘密，并且把一条求救纸条绑在一只候鸟脚上再放走它，希望有一日会有人发现。洛克、萨伊德和凯特在拯救杰克的路上被一条保护“其他人”住处的超声波防线挡住了。Mikhail被洛克迫使穿过防线，超声波导致他口吐白沫身亡。大家以从上饶过探测器成功穿过防线。回忆中，克莱尔在一次车祸之后进了医院，遇到了自己从未见过的父亲——原来她的父亲就是杰克的父亲。
洛克、萨伊德和凯特第一次来到“其他人”住的地方，却发现杰克在那里生活得很高兴。感情日渐加深的杰克和茱莉叶跟班定下协议，要班用“其他人”的一艘潜水艇运走他们，然而洛克一手炸了潜水艇，使计划泡汤。班告诉洛克，洛克的父亲已经被他关起来了。回忆中，洛克的父亲把他从窗户推了出去，使洛克下身瘫痪。
查理告诉善华他和索耶是在森林里绑架她的幕后策划者。生还者们发现妮姬和保罗倒在地上。回忆里，妮姬和保罗为一些从一位百万富翁television executive那里骗回来的钻石而争执。回到荒岛上，妮姬在保罗身上释放了一只剧毒蜘蛛，保罗即时瘫痪了；那蜘蛛引来了许多蜘蛛，也把妮姬瘫痪了，他们双双被困八小时。后来，生还者们并没有察觉他们被毒液瘫痪，因此活活埋了他们。
“其他人”和洛克一起离开了“其他人”的住处。Hurley cons Sawyer into making amends with his fellow castaways。回忆里，凯特用尽办法，最终和抛弃她的母亲见面了。
杰克、萨伊德、凯特和茱莉叶从“其他人”的营地回来了，因为杰克一直信任著茱莉叶，尽管其他生还者对他的举动深表怀疑。一种奇怪的病出现在克莱尔身上，是“其他人”在他身上植入的物体引起的，茱莉叶却为她十分担心。回忆描述茱莉叶在荒岛上的生活。茱莉叶被迫住在岛上，眼睁睁看着一个个在岛上怀孕的人莫名其妙地死去而无能为力阻止。回忆又显示茱莉叶和班联合计划阴谋，让茱莉叶潜入生还者们作内奸。
为关于未来的“记忆”驱使，德斯蒙德说服查理、赫利和真秀徒步穿越森林，使他们得以发现刚刚用降落伞着陆的娜欧米。在看到杰克和茱莉叶单独相处后，凯特的爱情目标转向了索耶。回忆之中，显示出德斯蒙德曾是一位修道士，并描述他如何遇上Penny。
善华得知在岛上怀孕的女人都会在分娩前死去，因此要求茱莉叶检验一下她是否在岛上怀孕，茱莉叶于是把她带到了一个达摩医疗站。善华离开后，茱莉叶向班报告了情况。德斯蒙德在森林里碰到了前段时间竟然没有死的Mikhail，并让他救救娜欧米。回忆显示善华被真秀的生母敲诈，然而早前真秀告诉她母亲已去世。
回忆里，洛克的父亲被“其他人”关起来了，而他则正常地和“其他人”生活。回到当前，洛克说服了索耶到“黑岩”看看洛克的爸爸。索耶后来以枪杀了洛克的爸爸，因为他就是“索耶”这个假名的由来，也就是杀死父母的人。
洛克回到了“其他人”那里，而班很不情愿地带洛克去见“其他人”神秘的真正领袖Jacob。洛克并没有看见他，但能听见他，尽管班却聼不到，因此才在洛克独自上打了一枪。自从发现茱莉叶是内奸之后，生还者们对杰克越来越不信任，但是茱莉叶却表明她和杰克已经一起对抗“其他人”了。回忆里面，还是个小男孩的班第一次来到荒岛上，成为达摩计划的一分子。班和“其他人”（at least one of whom, Richard Alpert, does not age in the next thirty years）计划阴谋，杀死了大部分的达摩计划成员。
