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迷失
第三季的后半部分，掌握着Ben的生死的Jack似乎占据了优势。他要求释放Kate和Sawyer，让他们平安返回小岛，而他将留下来。但Jack真实的动机是什么呢？Kate终于在Jack和Sawyer之间作出了选择，她的感情是真实的吗？Juliet作出了一个危险的决定。Eko死后，Locke 对岛上之谜的探求使Sayid相信，他的动机并不是幸存者。Sun和Jin在庆祝新生命的到来，孩子究竟是不是Jin的呢？Charlie对Claire和她的孩子Aaron重新友好起来之时，Desmond丢向他的炸弹永远改变了他的命运。舱门破裂电磁波泄露之后将会对小岛以及外面的世界产生怎样的影响？Penny Widmore能找到小岛和她的挚爱Desmond吗。幸存者们能不能找到联系外界的方法呢？救援即将到来，幸存者们不知道能否相信Charlie临终前的警告。救援船上的人...
得知查理临死前的信息后，部分幸存者开始思索到底是否该信任娜欧米等人，因此从大队分裂了出来。前叙里，赫利获救之后，几位他不愿意见的人来探望他。
幸存者们遇到了来访的娜欧米队员——麦尔斯、弗兰克、丹尼尔和夏洛特。回忆里描述了娜欧米和以上四人生活中奇妙的故事。
萨伊德和凯特为洛克关起来的人质谈判，因为人质或许能帮他们离开这个荒岛。前叙里，萨伊德有着一项危险的工作，还有一个令人诧异的上司。
凯特从麦尔斯获得了一些资料，结果令她被洛克赶走。在前叙中，凯特养育著克莱尔的儿子艾伦，和她接受审判。
萨伊德和德斯蒙德在前往货轮时遇到乱流，结果令德斯蒙德出现了一些出乎意料的副作用。在时间旅行的闪影中，德斯蒙德回到他当军人的时候。
一个茱莉叶不喜欢的旧人探访了她，并带给她指令：找到夏洛特和法拉第，不计代价，必须阻止他们完成其任务。同时，宾向洛克叙述了关于查尔斯·威德摩的资料。回叙中显示茱莉叶与古德温的外遇，以及她和古德温的妻子哈柏、宾的关系。
茱莉叶为了阻止善华搬去洛克的营地，结果向真秀透露了一些善华的秘密。同时，萨伊德和德斯蒙德在见识到货轮的船长后，开始了解到货轮上人员的企图。回叙中，真秀必须完成送礼的工作。前叙中，善华生下了一个女儿。
萨伊德遇到宾在货轮上的间谍，另外宾劝导他女儿艾莉克斯和丹妮艾尔、卡尔一同逃走，以避开即将来临的攻击。回叙显示，麦可在离开小岛和登上货轮的过程。
洛克的营地遭到攻击，宾的女儿艾莉克斯被俘作人质，克米以她威胁宾投降，最后杀害了她。而杰克想找出被冲上海岸的尸体的身份。在前叙中，宾招揽了萨伊德作为刺客，以及他遇到查尔斯·威德摩。
当杰克的健康十分恶化时，凯特和茱莉叶必须要合作，以拯救杰克。而索耶、克莱尔和米尔斯则离开了洛克，正在返回沙滩营地的路途上。前叙中，杰克开始失去他的理智，并从赫利中得知查理给他的口信，而且他和凯特的关系亦开始崩解。
洛克在探访雅各的小屋后，得知他必须移动小岛。另外，货轮上的人们的生命变得十分危险，因为雇佣兵在船上发生兵变。回叙中，年轻的洛克遇到理查，以及他瘫痪后遇到马修·亚巴顿。
幸存者们绝望地试图逃离小岛，而宾谋划去迎击Kahana上的雇佣兵。前叙则显示海洋航空六人组回到世界的情况。
在潘妮的拯救下，杰克、凯特、萨伊德、赫利、善华、艾伦、德斯蒙德和法兰克逃离了小岛，而宾和洛克则成功移动了小岛。前叙中，洛克探访了海洋航空六人组和华特。
