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洛克人EXE
在公元200X年，由于网络科技日新月异，人类已经进入一个全新网络时代。每个人都会随身携带类似小型个人计算机的PET，其中安装称之为“网络领航员”的人工智能计算机。PET及网络领航员的发明为人类生活带来许多好处，但是网络黑客、病毒传播及高科技犯罪也成为日益严重的问题。 光热斗是个国小5年级的小学生，住在秋原镇。在他升上5年级的时候，父亲设计了一个个人网络领航员─洛克人作为礼物，于是他与学校的好朋友们组成网络领航员团队，专门解决网络上发生的问题，结果发现，这些神秘犯罪的始作俑者就是邪恶组织ＷＷＷ。为了阻止ＷＷＷ组织网络领航员的破坏计划及散播病毒，洛克人不断地与之战斗。在神秘人与伊集院炎山的帮助下，光热斗与洛克人勇敢地打击犯罪。洛克人、热斗和伙伴们的友谊及团队力量是否能战胜ＷＷＷ组织邪恶的野心？
热斗的爸爸答应在他升上小学五年级的时候，为他设计一个网络领航员，这天爸爸果然依约寄来一张RD磁盘，他特地为热斗设计了网络领航员-洛克人！ 正当热斗以洛克人和同学--迪卡欧的气力人对战较劲时，却发现同班同学-美露出事了！！
热斗和美露为了帮玛莉老师追回她被机器狗咬走的包包，来到了一列地下铁的列车上，没想到刚好碰上列车失控的突发状况！洛克人调查出有病毒从中作祟，然而失控下超高速行驶的列车即将撞上终点站，热斗、美露与所有乘客能平安逃过这场大灾难吗？
WWW组织的威利博士又派遣了一个神秘的女孩：色绫丹居进行邪恶的破坏行动，她的网络领航员：彩色人将秋原镇的红绿灯全部陷入故障的局面，弄得到处塞车，甚至引发不少的交通事故，在热斗的洛克人和转学声伊朵的葛莱德的同心协力下，终于将彩色人打跑了…
热斗的学校这次来了一位实习老师：日暮闇太郎，没想到他竟然对伊朵的稀有芯片非常感兴趣，甚至利用强迫的方式逼伊朵的网络领航员：葛莱德和他的网络领航员：数字人进行网络对战，最后还是不敌热斗等人的通力合作…
这次WWW组织竟然控制住了机器水族馆里的安全系统，让所有的机器鱼通通飞到了秋原镇的街头上空，为了阻止这一切，热斗便派洛克人前去水族馆的控制室查明一切，原来控制室又受到了计算机病毒的影响而失控，但在这次的战斗中，到底是谁帮了热斗一个大忙？那个叫鲨鱼人的网络领航员又是谁呢？
WWW组织为了造成人类世界的骚动与不安，这次竟然把脑筋动到了水利局，控制住水利局的安全系统之后，造成秋原镇的用水全部就此中断，引起镇民生活上极大的不便，原来是WWW组织的色绫丹居挟持了水利局技术员的儿子冰川透，藉此进入计算机程序中进行破坏…
为了能够抢先一步玩到最新版的游戏软件，热斗和美露、迪卡欧都留在伊朵家等着午夜12点，就准备好好的享受一下新软件的乐趣，谁知道WWW组织这次派出了电击伯爵来进行破坏，企图将这个软件的原始数据偷走，让所有的小朋友失望…
火野健一每次有个新的计划都会毁在洛克人的手上，因此心生报复，决定派出火焰人找洛克人下战书，约在焚化厂那里进行决斗，没想到后来应战的竟然是美露的网络领航员：萝露，就在千钧一发之际，洛克人终于赶到，解除了萝露的危机…
WWW组织这次派出了瑜珈战士：玛哈尼˙杰玛来对付碍眼的洛克人，他的魔术人竟然利用催眠波将镇上的人都催眠了，但是在伊集院炎山的帮助下，洛克人惊险逃过一劫，炎山究竟是敌是友呢？
眼看着大家期待已久的N1锦标赛就要在今天正式的举行，谁知日暮先生却跑来找热斗帮忙，因为他的数字人在经过规格的修改之后产生了失控的状况，还好有个骷髅人及时出现，将数字人打倒之后，热斗他们才能够在时间之内赶往会场…
热斗的第一场比赛被排在N1锦标赛的第一天下午，与他对觉得竟然是算命师美雪和她的网络领航员：骷髅人，美雪预测热斗将在五分钟之内败下阵来，但在热斗的努力尝试下，美雪放弃了这个坚持，自动脱离程序，让热斗取得了胜利…
热斗和萝露今天都要上场比赛，热斗的对手是WWW组织的火野健一和火焰人，萝露的对手是WWW组织的色绫丹居和彩色人，丹居为了打倒萝露不惜使出卑鄙的手段，但萝露却在伊朵给的稀有芯片的帮助下，在最危急的时候打倒了丹居的彩色人…
洛克人与火焰人再度对阵，洛克人一开始以惊人的攻击让火焰人处于劣势，谁知火野健一却利用会场的太阳能系统提供火焰人主要的能量，让它的威力顿时提升好几倍，会场的温度热得吓人，也因此影响了热斗的战斗力…
伊朵为了替热斗他们庆祝第一天比赛的胜利，决定请他们到大餐厅吃饭，谁知碰上伊集院炎山，用言语奚落他们，弄得热斗对炎山提出挑战，在大街上就开始进行网络对战，引来了威利博士手下的网络领航员的觊觎…
为了能够得到更强大的战斗力，热斗和洛克人在迪卡欧的帮助下，一起在会场的训练室进行最后的练习，而美雪看似中途出来搅局，其实是在 为热斗进行训练，热斗在对抗曼哈尼˙杰玛的魔术人时虽然使出了程序进阶，但是威力和炎山所使用出的效果相比，实在差太多了…
在所有单人赛的赛事结束之后，N1大赛紧接着要进行的是配对赛，第一场比赛就由萨洛关姊姊和迪卡欧配对出击，没想到她们第一次连手就碰到WWW组织的暴风人和炸弹人、面对这两个完全自律型的网络领航员，它们自己就是自己的主人操控者，看得大家全都傻眼了…
比夫司令与热斗这次要连手出席配对赛，对抗自律型网络领航员暴风人和炸弹人，但暴风人它们却让洛克人和鲨鱼人脱离了主人操控者，为的就是让他们无法得到主人的芯片支持，比夫司令和热斗为了救出被带出场的两个领航员，一路向比赛会场附近的灯塔挺进，比夫司令却在这个过程中暴露了他就是阿正叔的秘密
大会为了让曾经打败过一次的网络对战员还有赢得优胜的机会，特别推出了一个败部复活赛的单元，WWW组织的丹居和火野健一利用卑鄙的手段让自己被抽签系统选上，曼哈尼˙杰玛又利用易容术将一片邪恶的芯片送给美露，让萝露在比赛的时候一瞬间变成了邪恶天使，开始打自己的伙伴：洛克人…
当美露为萝露插入恶魔芯片之后，萝露的性情转眼有了绝大的变化，甚至开始攻击自己的队友，还好伊朵等人发现不对劲，开始追查是谁在遥控萝露，熟谙稀有芯片的日暮先生也适时的清醒过来，告诉热斗和美露破解的方法，才惊险的打赢了这一场。
眼看着炎山就要和热斗配对对抗暴风人和炸弹人了，但是炎山的父亲因为临时有事，要炎山到附近的饭店签一份40亿的合约，在与伊朵共乘一个电梯时，意外地被困在电梯里，所幸最后及时赶到会场…
