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宝可梦
银河队的威胁继续笼罩着神奥地区，小智和小光不断被卷入这个神秘反派组织的阴谋中——同时还面临着其他意想不到的挑战！ 小光正忙于处理她宝可梦的各种问题，而小智与真嗣的长期竞争最终在一场全员6对6对战中达到高潮！ 这可能是训练方式的终极考验——我们的英雄能否胜出？
暂时停留在水脉市的小智一行人，和久违的大木博士联络时，听说了只在「森之洋馆」饭店才吃得到的「森之羊羹」的事，立刻决定要去吃羊羹。但是，不巧碰上旅馆停业，而且还听说旅馆有妖怪出没！就在大家准备放弃的时候，应该没人的旅馆大门自动打开了！小智等人大吃一惊，唯独皮卡丘发现到什麼，跑进旅馆里去了！慌忙追过去的小智他们，不得已地在寂静的旅馆中前进，面前的地板上却出现不该在这的微波炉。和不可思议地观看的小智等人不同，只有皮卡丘感到兴味盎然。这时，微波炉突然袭击过来了！
小智他们在等待道馆训练家归来的同时努力特训。小光也为了让小山猪进化而成的"野猪宝可梦"长毛猪在下次华丽大赛出道而展开特训，但是长毛猪却不听小光的话！它甚至还被食物的味道吸引，随便跑到别地方去。这让小光对往後能否与它好好相处感到不安。这时候，小智一行人看到了写著「宝可梦交友训练营」的海报！上面竟然说，只要和宝可梦一起参与课程，就能够和它们感情变好！这样就万无一失！小光这麼想著，马上就前往训练营，但是…
得知道馆训练家已经回来，小智一行人立刻前往水脉道馆。在大家抵达道馆前的时候，听见里面传来很大的争吵声！进去一看，在对战场地里的人竟然是水脉道馆的馆主‧东瓜，以及钢铁道馆的馆主‧瓢太！原来，这两个人是父子！刚才的争吵声是都擅用由化石复活的宝可梦、还同为道馆馆主的这对父子，在争论谁比较喜欢化石的声音。而且光是争吵还不够，事态最後发展到对战！东瓜以自豪的护城龙迎击瓢太的战槌龙！双方都毫不相让的大激战！到底会怎麼样呢！？
期盼多时、与道馆训练家东瓜的水脉道馆战终於要开始了！小智选择小火焰猴、泳气鼬与天蝎王展开对战！东瓜派出的第一只是铜镜怪！而小智则以适性良好的小火焰猴挑战！小火焰猴使出炎系绝招一口气抢功，但是对上东瓜固守防御等待机会的战术，一直没法造成决定性的伤害！然而攻击还是最大的防御！小智坚持不减缓攻势，强势地继续攻击！是防守的东瓜，还是进攻的小智会赢呢。两人互不相让的信念彼此冲突，决定了第六个徽章的去向！！
为了前往举办下一场华丽大赛的木通镇，小智一行人来到水脉市的码头。正要吃午餐的时候，宝可梦食物被突然出现的"电光宝可梦"勒克猫抢走了！小智与皮卡丘追著勒克猫进入了下水道。他们在那看到，勒克猫把宝可梦食物送给迷路的"球鲸宝可梦"吼吼鲸！勒克猫是住在下水道里的宝可梦们的领导者，它想要帮助吼吼鲸。小智知道勒克猫的心意後，主动表示要帮’忙让吼吼鲸回到海里！可是，与勒克猫它们合作进行的计划，规模非常大！真的能顺利做到吗！？
小智一行人在水脉市的宝可梦中心，等待前往木通镇的船。这时他们接到一通电话。竟然是在钢铁岛修行的阿驯打来的！不过，阿驯看来跟平常不太一样。一问之下才知道，原来阿驯的帝王拿波突然间开始胡乱攻击。阿驯一心想著「要查出原因！」，为了帮忙他，小智一行人也决定前往钢铁岛！抵达钢铁岛後，他们看到了四处大闹的"钢系宝可梦"们。宝可梦袭击宝可梦的景象，让小智他们哑口无言。面对试图阻止暴走的小智，钢系宝可梦们发动了攻击！！此时，路卡利欧与一位波导使者现身保护了小智！！
与波导使者亚玄一起调查钢铁岛异变的小智一行人，得知造成钢系宝可梦暴走的原因，是覆盖了整座岛的低周波。同时，亚玄那以波导之力防御低周波的伙伴‧路卡利欧，因为无法阻挡突然发生、直冲天际的强大能源波，还是失控暴走了！追著路卡利欧而去的小智一行人，看到的竟然是在调查巨大遗迹的银河队干部‧夥星。接著，发现是可疑装置产生出能源的小智他们，现身对抗银河队。银河队的目的是什麼？究竟他们能不能拯救钢系宝可梦呢！？
小智一行人搭上船，前往下一场宝可梦华丽大赛的举办地木通镇。波加曼与皮卡丘在船内游玩，不过，它们在小智等人稍不注意的空档，被潜入船内的火箭队带走了！火箭队喊著「好棒的感觉啊～！」准备逃跑，但是海象突然恶化，让皮卡丘它们趁机逃脱了！皮卡丘它们漂流到了一座无人岛。为了回到小智等人身边，它们努力的奋斗，这时却看到岛上的宝可梦们在拼命搬运石头的样子！跟去一看，目的地有不可思议的茧和对它有反应的大量岩石…这个茧到底是什麼！？而皮卡丘它们能平安回到小智等人身边吗？
小智他们抵达了要举行宝可梦华丽大赛的木通镇。不过，整个城镇都处於热闹的祭典状态，到处都在贩卖"海洋宝可梦"霏欧纳的商品！原来这个时期，似乎可以在木通镇看到霏欧纳。而且据说能看到霏欧纳的话，幸运就会降临。对鼓足干劲、马上要挑战华丽大赛的小光来说，这是独一无二的机会！她想著「绝对要看到霏欧纳」，搭上了可以赏霏欧纳的船。接著，远方出现发光的身影…。小光他们到底能不能，遇见霏欧纳得到幸运呢！？
小光他们结束为了明天举行的宝可梦大赛‧木通大会所做的特训。在期待已久的点心时间，看到最喜欢的面宝让帕奇利兹非常开心！然而，面宝却在眼前被"洞穴宝可梦"尖牙陆鲨踩烂了！气到发抖的帕奇利兹，似乎因为食物的怨恨而发动了新绝招"愤怒之牙"！但是像要制止它一样，一名协调训练家出现了！这位少女名字叫乌拉拉，她的目标是与尖牙陆鲨一起参加华丽大型庆典，所以才来参加木通大会。而且乌拉拉不知为何对小光显示出敌意！那种态度让小光忍无可忍，决定在木通大会和她一决胜负，可是…
小智一行人为了到切锋市进行道馆战而持续旅行。途中，想要抢皮卡丘的火箭队出现了！虽然皮卡丘使出"十万伏特"惊险渡过危机，却因为冲过头在空中失去平衡！就在小智他们因为来不及接住皮卡丘而焦急的时候，骑著机车的君莎跳上半空中直接接住皮卡丘！在千钧一发之际救了它。可是，戴著墨镜、肩上停著"音符宝可梦"聒噪鸟的这位君莎，气质好像跟其他君莎不太一样…。然後，这个自称狂野君莎的人物，拜托小智一行人帮忙进行逮捕火箭队的搜查，可是…
小智一行人，朝著切锋市前进，在雪地中继续他们的旅程。但是，下个不停的雪让他们迷路了。这时，在小智等人面前，出现了一只向他们招手的"雪国宝可梦"雪妖女。跟过去一看，竟然有一栋小木屋！雪妖女准备了温暖的热汤、还有宝可梦用的浴缸。波加曼高兴的跳了进去，但是下一瞬间就被冻住了！原来小木屋是个陷阱！小光质问它为什麼要这麼做，结果从更里面传来火箭队喵喵的声音。照先落入陷阱的喵喵的说法，要救波加曼就得先帮雪妖女。到底雪妖女的目的是什麼！？
火箭队像往常一样为了抢皮卡丘而骚扰小智一行人。但是，他们又失败了。被皮卡丘打飞，身心都疲惫不堪的火箭队发现一间拉面店，马上就冲进去要填饱肚子。而他们在那里遇上意想不到的人物！原来那间店的店长是武藏和小次郎在火箭队培训所时期的学弟！而且他还想挖角喵喵到他的店里工作。对总是失败的火箭队感到厌烦的喵喵，竟然接受了！而且连听喵喵表明决心的武藏都说要退出火箭队！只剩下小次郎一个人。究竟火箭队会变成什麼样子呢！？
旅行途中，小智一行人经过强风镇。在那个镇上，正在进行由飞行系宝可梦争夺圆环的「神奇圆环」竞技大会。对「神奇圆环」兴致勃勃的小智他们，决定要派姆克鸟登记参加大会！小智与姆克鸟巧妙的使用绝招通过第一轮比赛。在等待第二轮的空档，小智一行人等在萤幕前要观看其他参赛者的比赛。此时映入眼帘的，竟然是真司与乌鸦头头！两队都顺利的晋级，终於在决赛碰上！小智VS真司。以「神奇圆环」强风镇大会为舞台展开的比赛，最後将是谁胜谁负！？
朝著切锋市前进的小智一行人，正穿越广大的森林。半路上发现水壶已经没水可喝的小光，一个人去装水。此时，波士可多拉突然出现出现在小光眼前，并且发动攻击！慌张逃命的小光在混乱中摔落山崖，被河水冲走了！努力游上岸的小光，为了找小智他们而进入森林。结果，波士可多拉又出现了！认为逃跑无法解决问题的小光决心应战，她选择的是唯一能与重量级的波士可多拉对抗的象牙猪！但是象牙猪又不听话了。小光与象牙猪，到底能不能渡过这次危机呢！？
小智与小光讲述前面集数所发生过的事情。(总集篇 第2集)
为了挑战切锋道馆，在雪地中持续旅行的小智一行人为树林龟进行特训。这时候，就像先前的晴天是假象一样，吹起了暴风雪！大家慌张走避，却瞬间就被冰住！接著，出现一只喜孜孜地看著小智他们的宝可梦。它是"树冰宝可梦"雪笠怪！看样子，它是为了引起人类注意才恶作剧。小智等人靠小火焰猴的火焰融冰脱困，却又因为雪笠怪恶作剧而引发大混乱！不过，大家很难对没有恶意的雪笠怪生气，只有无奈地让它同行。小智一行人与雪笠怪的旅程，到底会怎麼样！？
得知立浪镇要办宝可梦华丽大赛的小光，正在为华丽大赛做特训。小光的宝可梦们就像平常一样，活力十足的跑出精灵球。但是，只有波加曼莫名的没精神。大家都担心它是不是哪里不舒服，波加曼却还是逞强表示没事。这时候，波加曼的身体突然开始发光！大家都为这进化的徵兆感到兴奋，波加曼却不知为何使用「忍忍」放出进化的能量！很高兴看到波加曼进化的小光，无法理解它的行动。究竟拒绝进化的波加曼，真正的想法是什麼！？
立浪大会终於要开始了！只差一个缎带勋章就能参加华丽大型庆典的小光充满斗志。加上青梅竹马的劲敌健悟也要出场，让她忙著练习。而立浪大会从第一次审查就展开激战！比小光少一个缎带勋章的健悟说绝对要在这场大会追上来，高分贝向小光做出宣战布告！而他也如宣言般以最佳表演展现出豪力的力量。相对的，小光也坚持绝不让出第五个缎带勋章，与融入新动作演出的双尾怪手做出默契十足的表演！劲敌之间互不相让的对抗。立浪缎带勋章会落入谁手中！？
阿驯充满斗志的要与帝王拿波一起称霸宝可梦乒乓大会。虽然还是新手，不过小智他们也报名了。宝可梦乒乓，是由宝可梦与训练家两人一组打球的竞赛。小智选择皮卡丘，小光则与双尾怪手搭档挑战大会。他们利用开赛前的空档进行加强特训，而双尾怪手在练习中利用两条尾巴使出了强力杀球！看到这一幕的大会上届冠军O选手，似乎认为双尾怪手有著过人的天分。在万分期待下，宝可梦兵乓大会终於开始了！不同於对战和华丽大赛的兴奋就在这里！令人屏息的激战，优胜的桂冠究竟会落入谁手中！？
