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宝可梦
无印：119-159 舞台转移到了城都地方，小智踏上新的旅程，来到了若叶镇的空木博士处。以熟悉的菊草叶、小锯鳄、火球鼠为首，咕咕、美丽花、幸福蛋和太阳珊瑚等等宝可梦和新伙伴陆续登场。各种各样的道馆和欢乐的宝可梦华丽大赛的场景也囊括其中。
小智一行人来到了若叶镇，前去登录城都联盟。因为负责登录的乔伊去了空木研究所，小智也前去研究所。他们得知为新人训练家准备的小锯鳄被偷走了，于是前往搜寻。果然，犯人又是火箭队三人组……
开始新的旅程的小智一行人遇到了持有菊草叶的新人训练家奈奈。由于奈奈是一个棒球球迷，但小智说了她所喜欢球队的坏话，使她向小智提出挑战。之后小智使用喷火龙轻松地击败了奈奈的三只宝可梦。难过的奈奈被火箭队挑衅，决定再和小智比一次，但这实际是火箭队的陷阱……
小智在一片正在枯萎的森林中发现了一群赫拉克罗斯，正当小智要收服它们时，森林警备队的森男出现阻止了他。他告诉小智因为未知的原因，森林中的凯罗斯开始离开自己的领地而侵占赫拉克罗斯的领地了。为了弄清这个原因，小智和森男前往调查。果然，这还是火箭队在作怪。
小智一行人在一座小山谷中发现了一只年幼的顿甲。正当小智要收服它时，它的主人衣其小姐出现阻止了小智。知道这里的顿甲有找寻玛瑙的能力，火箭队抓住了这只年幼的顿甲。为了拯救顿甲，小智、小刚、小霞决定帮助衣其小姐。
小智一行人在迷惑森林中迷路了，偶遇的小茂告诉他们要通过森林必须借助咕咕的力量。小智追逐一只咕咕来到租赁咕咕的铃金的家。得知只剩下一只无法独当一面的咕咕，小智还是租了。这只咕咕不仅不能驱散迷惑森林的幻觉，还很胆小。小智能否顺利穿过森林呢？
小智一行人来到了以街头表演出名的东门镇并决定要去看看表演。他们看见了两只跳舞的美丽花。它们有一个动作一直做不好，小智想帮助美丽花的主人阿丽练习那个动作好参加镇上的表演大赛。可是火箭队仍旧屡屡妨碍小智等人。美丽花们能学会最后的动作吗？
来到圆丝蛛镇的小智一行人被圆丝蛛的丝包裹了起来。小智从君莎那里得知，有号称“二代猫八”的怪盗在附近作案，而且君莎还邀请小智一起办案。这时，一封犯罪预告书被发现，小智能否守护盗贼觊觎的宝物？
小智一行人在天母镇遇见了一只有钱人家的布鲁。在它的主人金妇的豪宅中，小刚发现布鲁并不快乐。这时，火箭队溜进了金妇的庭院。布鲁似乎对喵喵的尾巴十分喜爱，一直咬着不放。为了把布鲁送回主人手中，小智再度和火箭队交手……
小智一行人在鹿角镇的鹿角公园中看见了一只受伤的小惊角鹿。小刚正要为它处理伤口，忽然一群惊角鹿向小智一行人冲了过来。在警察局，小智一行人再一次看见鹿群，不过小刚发现这只是小鹿造出的幻影。小刚治好小鹿，依依不舍地和小鹿分别。这时火箭队却盯上了小鹿……
小智一行人在旅行的途中遇见了一只野生的菊草叶。小智想要收服它，而且菊草叶也想向小智发出挑战。这只菊草叶一直不服输，直到遍体鳞伤。小智急忙把它送到宝可梦中心。看见充满斗志的菊草叶，火箭队也想将它纳入自己的麾下。到底谁会得到这只菊草叶？
在吉花市的河边，小智的GS球被野生的沼王抢走，正当好不容易夺回GS球的小智要收服沼王时，君莎逮捕了小智一行人，因为沼王对于吉花市来说特别重要。沼王只是喜欢拿走圆形物品，第二天这些物品都会在出现在河上。之后，GS球再一次被沼王抢走的小智决定跟踪沼王一查究竟。
小智一行人正要过一座桥，不料桥突然崩塌。他们正巧遇上芭瓢虫的训练家小诚，小智借用芭瓢虫过了河。小诚也邀请小智观看她的芭瓢虫的工作，为果树授粉。火箭队出现抢走了小诚操纵芭瓢虫的笛子，并扰乱芭瓢虫使它们离开小诚。小智要帮忙找回芭瓢虫。
深夜赶到快乐镇宝可梦中心的小智一行人受到了宝可梦护士——一只热情过度的幸福蛋的照顾。因为幸福蛋的手忙脚乱，小智饿着肚子睡觉了。同样饥饿的火箭队来到宝可梦中心偷食物，武藏惊讶地发现宝可梦中心的幸福蛋竟然是自己在宝可梦护士学校的同学。因此，幸福蛋帮着火箭队搬运食物。第二天，当乔伊责怪幸福蛋偷食物时，火箭队又带着食物回来了。他们要干什么呢?
小智一行人来到了桔梗市的一所宝可梦学校并向那里的同学展示了自己的宝可梦。就当学生们要组织前往喇叭芽之塔参观时，一名学生——小翔抢走了小智的精灵球并要收服皮卡丘。小翔被小智追上时，他把喇叭芽误当成皮卡丘收服了。火箭队再次来抢皮卡丘，却被打飞至喇叭芽之塔。一个更大的阴谋在塔里面诞生了。
小智在前往桔梗道馆的途中被火箭队抢走了皮卡丘，桔梗道馆的道馆馆主阿速救下了皮卡丘。来到桔梗道馆，小智要面临的是一场三对三的比赛，对手是想成为鸟宝可梦的阿速，小智会如何应对？
小智一行人在河边遇到一只有主人的玛力露，它十分爱哭。火箭队开车前来捉走了皮卡丘和玛力露，玛力露因此大哭，而车子也在哭声的影响下失去了控制。最终火箭队一行被炸飞而玛力露和皮卡丘也将落入河中，这时，小霞跟着下去救两只宝可梦，玛力露的主人也赶到了。当小霞上岸时，她已不知道小智他们在何处了……
在小智一行人在路边午睡时，火箭队驾驶着用他们全部积蓄造的怪怪阿柏号机器人向小智前进。在火箭队出来休息时，小霞的波克比和一只尾立溜进了机器人驾驶室并开启了机器。小智和火箭队都想阻止机器人的前进，结果皮卡丘和喵喵也进到了机器中，机器仍停不下来。眼见着机器人要驶向一座城镇，小智他们能否让机器人及时停下呢？
小智在山谷中遇到了使用喷火龙的纪珂，纪珂要带领小智一行人前往喷火龙山谷。小智的喷火龙载人飞行的能力不强，而且在喷火龙山谷之中又被里面的喷火龙多次打败。但是这样，喷火龙似乎斗志仍不减，它要留在喷火龙山谷锻炼自己以成为世界最强的喷火龙！
小智一行人在阳光镇的郊外遇到千纱小姐。千莎带小智一行人回到家里，并向他们介绍了向日花怪选美会。看到千纱想要派去参赛的向日花怪无精打采，小智决定帮助千纱，在喵喵的翻译下，小智解决了向日花怪的心情问题。这下千纱能拿到选美大赛的优胜吗？
在和补习班学生的对战中，小智的菊草叶和对手的拉达都已受重伤，这时小智想换皮卡丘上场。菊草叶因此不高兴了。宝可梦中心的乔伊试图为菊草叶进行心理治疗，但是并不奏效。菊草叶趁大伙儿睡觉时离开了，皮卡丘为了拉回它也跟了出去。外面既有凶暴的野生宝可梦，又有火箭队的搜捕，小智的菊草叶能够安全地被找回吗？
