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宝可梦
无印：212-276 随着尼比市道馆暂时关闭，我们的英雄们启程前往漩涡杯大赛——小霞也跃跃欲试想要参赛！继续旅途中，他们发现需要提防的火箭队成员不止武藏、小次郎和喵喵这个阴险三人组。在与最后一位道馆训练家激烈对决后，小智晋级白银大会，但他是否有实力迎战老对手小茂？
小智一行人在船上和火箭队开始了战斗，双方都被炸飞。落入海中的小智一行人虽然放出了水属性宝可梦，但是强大的漩涡还是让他们无法前进。这时，他们被太阳珊瑚和毒刺水母救上了一艘船。在船上，小智一行人遇见了路过的空木博士。乘船来到青岩岛的库加市，他们从空木博士那里了解到了漩涡岛杯的水属性宝可梦比赛，小智和小霞都决定参赛。
以漩涡岛大赛为目标，展开漩涡岛之旅的小智一行人途中遇到叫做飞太的青年，并得知了大波波岛的事情。这个岛上生活着体型是普通的三倍以上的巨大波波，因为体型过大它们已经失去了飞行能力。在这不可思议的岛上，到底发生什么事了呢？这些波波中有一只正常的波波，它似乎并不甘愿失去飞行能力，它要朝着太阳，飞向从未有宝可梦到达的高空。
前往芝拿镇的小智一行人乘缆车到达青湖。幸运的他们赶上了岛上一年一度的灯笼鱼的迁徙活动，灯笼鱼要从大海中回到山中的出生地产卵。小智一行人和阿义及他的父亲一起护送灯笼鱼前进，结果还是遇见了火箭队。在一阵骚动后，火箭队被赶跑，但是小智与阿义和其他人在混乱中分开了。他们能否将灯笼鱼送抵目的地？
来到黄岩岛的美奇市的小智一行人在海边看见了一栋被海浪冲走的屋子，上面困住了一位小女孩。小智一行人奋力救下了小女孩，之后她的家人赶到。原来这是一个建在太阳珊瑚巢穴上的屋子，最近因为有一只新的太阳珊瑚出现，把其他的太阳珊瑚全吓跑了，房屋才滑入海中。于是，小智一行人开始帮忙寻找失踪的太阳珊瑚们。他们把所有太阳珊瑚找回吗？
小智一行人错过了开往赤岩岛的通讯船。就在他们准备去宝可梦中心时，他们遇见了一位叫露佳的女子。露佳答应开船送小智前往赤岩岛。在船上，小智注意到了露佳船上的寻宝图，原来这是银色之羽的所在地。得知寻宝地点的小智急不可耐地要前往寻宝。而偷听到他们对话的火箭队也准备跟随小智以抢夺他们找到的宝藏。小智能顺利找出并拿走宝藏吗？
小智一行人终于来到漩涡岛大赛的举办地——赤岩岛。这地方爆满了像小智等人一样过来挑战的宝可梦训练家。第二天大赛的预赛就要开始了，斗志高昂的小智等人不知背后有可疑的黑影在追踪他们。后来才晓得，这出现在小智等人面前的可疑人物，原来是宝可梦训练家八郎，他却提出拜托小智等人陪他打一场的要求。比赛结束后，他的铁炮鱼如愿以偿地进化成了章鱼桶。
漩涡岛杯比赛的决赛终于拉开了序幕，小霞和小智分别要面对强大的对手。为了凑够两只水属性宝可梦，小智从大木博士那里传来了巨钳蟹。小智第一场比赛的对手派出了刺龙王，面对强大的龙属性，小智的小锯鳄该如何应战？小霞第一场则是对战经验丰富的训练家张造，她能否赢得比赛？
赢得漩涡岛杯比赛的决赛第一场比赛的小智和小霞竟然在第二场比赛中相遇了，同样直指冠军的两位好友在比赛场上也当仁不让。在小智的第一只宝可梦小锯鳄输给了小霞的蚊香君后，小智只剩下巨钳蟹，他会如何应对这位最熟悉的对手？另外，火箭队看上了麻亚手中的“大海之魂”的宝珠，还发犯罪预报给主办方，他们能否偷走“大海之魂”？
结束了漩涡岛杯比赛的小智一行人要前往鲳鱼镇以返回浅葱市，走在路上的他们落入了陷阱之中。就在一旁的火箭队得意地前去查看时，却也掉进了陷阱中。这时一位女生出现救起了大家，并向小智一行人道歉，她希望小智一行人和火箭队能帮她一个忙。因为有大餐作为奖励，所有人都答应了。来到地鼠之村，小智和火箭队得知原来这个村子用来耕作的地鼠被小偷盯上了，村中只有老年人，所以才请训练家们来帮忙赶走小偷。火箭队这次也决心要认真帮助村子，他们和小智一行人的合作会怎样呢？
小智等人之前在海底的沉船中发现了银色之羽，后来到了银岩岛的卡沙多市后，看见林立街头的土产店都在贩卖小岛的特产，银色之羽商品。途中，小智等人遇到了饰品店老板百合子，而到她的店里参观。店中排列的许多美丽装饰品都是用只有银岩岛才能采集得到的银岩石做的。据说用这种石头做出的装饰品有护身符的作用。岛民们深信的银色之羽，到底隐藏着什么样的力量？
小智一行人追踪传说的宝可梦而来到冲岛，他们遇见了小智的劲敌——同样来冲岛的阿弘，并和他一起搜寻那只宝可梦。他们见到了一位海边的少年修一，他表示不知道传说的宝可梦，可阿弘觉得修一在遮掩什么。另一方面，火箭队的南波博士也在策划一个针对传说的宝可梦的阴谋。这只神秘的宝可梦到底是什么？
火箭队的亚马多和小三郎抓走了小银。因为找不到自己的孩子，大的洛奇亚开始暴走并威胁到了漩涡岛的城镇。为了拯救城镇，小智尽全力说服了洛奇亚并和它定下约定，一定把小银救出来。少年们开始搜索火箭队的藏身处。武藏和小次郎想和亚马多等抢功劳，也打算潜入基地破坏。小银能否获救？
小智一行人和阿弘决定尽他们最大的能力从火箭队手中救回小银，但是被火箭队打败而关进了秘密基地中。没有被抓的修一决定独自前往救援大伙儿，他刚从秘密基地的通风管道潜入基地内部时，就被火箭队的队员发现并抓住了。就在危险关头，武藏和小次郎出现并带走了修一。在小智这边，南波博士骄傲地将计划告诉给了小智一行人，并要向他们展示打败他们的装置，他要用小智的皮卡丘做实验。小智一行人的命运究竟如何？和洛奇亚的约定还能否实现？
为了返回浅葱市，小智一行人来到赤岩岛的鲳鱼镇。在这里，小智和浅葱道馆的阿蜜约好第二天战斗。可是小智却错过了当天的最后一趟定期船。在一位老人口中，他们得知有一家叫做咕咕航空的航空公司可以帮他们前往浅葱市。 他们到那时，才发现刚才告诉他们消息的老人竟然就是航空公司的飞行员，飞鹰。在小智一行人的帮助下，飞机勉强起飞。他们刚起飞不久，才发现已经进入了一片暴风雨区域……
小智正准备前往浅葱道馆挑战时，途中遭遇了火箭队的巨大果然翁机器人的袭击。在危难关头，阿蜜的大钢蛇出现并救下了被抓住的皮卡丘，摧毁机器人并赶走了火箭队后，小智随即和阿蜜前往道馆进行道馆战。小智要如何打破对手的战术，赢得这枚徽章呢？
小智得到了大木博士一个奇怪的请求：大木博士实验室的部分宝可梦似乎在互相争斗，而大木博士无法平息它们的纷争。在知道小智的妙蛙种子有丰富的调解宝可梦的经验后，大木博士请求小智传送妙蛙种子。虽然妙蛙种子到后很快就平息了纷争，但只要它离开，争斗又立刻开始。小智是否舍得与陪伴他时间最久的一个伙伴分开呢？
以卡吉镇为目标的小智一行人再次来到了缘朱市。小霞和樱花约好了再次见面。樱花的伊布已经进化为太阳伊布了。因为樱花的姐姐们要去一位来缘朱市的舞蹈家那里上课，只好由樱花招待大家。樱花提出了要和小霞战斗的请求，小霞接受了挑战。樱花的四位姐姐在舞蹈家处学习，但这两位舞蹈家竟然是火箭队的武藏和小次郎。他们的目标是抓住所有的伊布进化形还有皮卡丘，他们会得逞吗？
小智一行人听到了铃铛塔上传出铃铛的声音而前去调查，他们巧遇了缘朱道馆的道馆馆主松叶和他的好友水京。松叶和水京发现铃铛塔顶层的透明铃铛被盗了，这些铃铛只会在凤王来到时响起。盗走铃铛的原来又是火箭队三人组，他们想利用透明铃铛召来凤王。因为一直无法使铃铛发出声音，武藏失手打碎了一只铃铛。这时，森林里的所有宝可梦开始躁动，它们开始大举向缘朱市进攻，并用吐丝将所有建筑包裹起来。小智和松叶要如何化解这场灾难呢？
小智一行人在前往卡吉镇的途中再次遇见了小茂，他正在和他的风速狗为一个比赛而练习。小智决定他也要参赛并赢过小茂。他从当地的宝可梦培育屋主人那里得到了比赛用的缰绳，并开始和月桂叶一起进行训练。这时，火箭队来到培育屋企图抢走培育屋的蛋。小智和月桂叶配合将蛋夺回，并且找到了比赛的感觉。第二天，宝可梦竞速赛开始，宿敌之间再次针锋相对，到底谁能获得胜利？
小智一行人在一家宝可梦中心休息，当他们醒来时，小智注意到他之前在培育屋得到的宝可梦的蛋不见了。正在小智等人为寻找蛋焦急万分时，乔伊请来了自称名侦探的君莎帮忙。但是君莎看似自信十足的推理却根本没有任何帮助，不过误打误撞地撞见了来宝可梦中心偷食物的火箭队三人组。蛋是被火箭队偷了吗？
