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宝可梦
《精灵宝可梦超世代》（Pokémon Advanced Generation）共分为芳缘地区丰缘联盟及关都地区对战开拓区两篇，《精灵宝可梦超世代》和前面的剧情不一样的就是，故事变成了两个主线，小智为了参加丰缘联盟，努力挑战道馆，丰缘联盟结束后，则改挑战故乡关都地区新设的对战开拓区，而小遥则以成为协调训练家努力，挑战各地的华丽大赛，取得优胜缎带勋章，好参加大型庆典，两人都为了达成各自的目标，与宝可梦一同奋斗。 这个星球上生活着不可思议的生物宝可梦。现在开始讲述少年小智和宝可梦们的相遇、冒险和战斗经历的故事。 立志成为宝可梦训练大师的小智胸中怀着新的理想，带者皮卡丘终于来到了芳缘地方在路上认识了刚成为宝可梦训练员的小遥和她弟弟小正以及在路上会和的小刚结伴为了追寻梦想和冒险开始方缘地方的旅程……
以宝可梦大师为目标的小智和皮卡丘初抵丰缘地区，因火箭队攻击导致皮卡丘体内电力失控。小田卷博士的治疗装置因负荷过载爆炸，失控的皮卡丘逃入森林。与此同时，前来领取初学者宝可梦的小遥在途中遭遇野生土狼犬袭击，慌乱中选择火稚鸡为伙伴，却因自行车被皮卡丘电击报废而与小智产生矛盾。火箭队趁虚而入启动巨型电力吸收装置，意外吸走皮卡丘多余电能使其恢复正常，装置超载爆炸后三人组被击飞。目睹小智彻夜守护虚弱皮卡丘的小遥深受触动，最终决定放下芥蒂，与小智结伴开启丰缘地区的冒险之旅。
小智与皮卡丘在丰缘地区展开新的冒险之旅。由于诸多原因，为了与新人宝可梦训练家小遥一起登录参加丰缘联盟，正往宝可梦中心所在的古辰镇前进。小遥对宝可梦的了解依然很生疏，一路上可用手忙脚乱来形容。最后勉强来到宝可梦中心的一行人，从在中心研究古辰遗迹的梅兹博士那里听到有关古代宝可梦之谜的故事。据说博士最近已解开该谜题。也就在这个夜里，数个身穿红色制服的人突然出现把梅兹博士掳走。这些神秘人的目的到底是什么？古辰遗迹到底隐藏着什么秘密？
小智等人完成参加登录丰缘联盟的手续，为了挑战在丰缘地区的第一场道馆战，意气风发的向橙华市前进。可是小遥抵达橙华市后，就好像有意避开道馆，在街头跑得不见踪影，留下小智一人前去橙华道馆。应声开门的是一位向往成为宝可梦训练家的小男孩。他一看到小智就滔滔不绝地提起小智在城都联盟中对战的失误。小智听得很不高兴，要与橙华道馆馆主对战，男孩称自己就是道馆馆主，小智并不相信。争吵中，小遥和一男一女突然出现。男孩称呼小遥为姐姐，小智这时才知道，原来小遥是橙华道馆馆主千里的女儿，而那个男孩是她的弟弟小胜。千里和美津子夫妇得知小智是小遥的朋友后很高兴，留小智吃饭，小智问起橙华道馆的比赛规则，被告知是三对三的战斗。但小智此时身上只带着一只皮卡丘，他想再多收服几只宝可梦再来挑战。千里于是提出先进行一场非正式的训练赛，小智使用皮卡丘对战千里的过动猿，虽然落败，但小智的实力得到了千里的赞许。这时火箭队三人组出现，意图把皮卡丘和过动猿一起夺走，结果混乱中误把火稚鸡当作皮卡丘抓走。小智一行人追赶出去，过动猿与皮卡丘合作打败了火箭队。小胜决定与小智和小遥一起旅行，临走前，千里送给小智和小遥每人一个徽章盒，同时交给小胜宝可梦导航器。
小遥的弟弟小胜也一起加入小智的旅行。不管怎样，一行人热热闹闹的向附近最近的宝可梦道馆所在地卡那兹市前进。森林中小智等人遇到燕子宝可梦的傲骨燕，不仅食物全被抢走，还遭到争夺地盘的傲骨燕群的袭击。其中一只不服输的傲骨燕受到皮卡丘的十万伏特攻击，就是不肯服气。小智一行人被傲骨燕军团包围，陷入大危机。此时跳出来搭救一行人的，竟是之前在常磐市分别的小刚！脱离危机后，小智等人都很高兴这次的再会，小遥与小胜也很快的与新同伴打成一片。但是看上傲骨燕的傲气的火箭队，又打算利用傲骨燕来捕捉皮卡丘的作战计划。小智收服了那只不肯认输、死缠烂打的傲骨燕，并且用它与皮卡丘一起打跑了火箭队。告别傲骨燕群后，小智一行人继续前进。
以卡那兹市为目的地而持续旅行的小智等人在森林遇到体形大得离谱的豆狸宝可梦蛇纹熊。结果发现其实那是穿着短裤、想接触大自然、套着宝可梦布偶想了解宝可梦的心情的古怪少年--阿奇变装的姿态。虽然阿奇由于小智等人的关系没有抓到蛇纹熊，不过正打算到橙华道馆挑战的他，得知小遥是道馆馆主的女儿，便趁此机会向小遥提出对战的要求。小遥接受了挑战，然而还是初学者的她毫无战斗经验，自然很快的输掉这场比赛。阿奇颇为得意，一时失言橙华道馆太容易打赢了，而后得意洋洋的跑去继续抓蛇纹熊。小遥心不甘愿，但也只能在心里抱怨。但是弟弟小胜却吞不下这口气，认为对方可以轻视小遥，但不能让他轻视作为道馆馆主的父亲。于是独自一个人采取个别行动想要报复阿奇，结果却陷入蛇纹熊群的包围，危急时刻还是阿奇及时赶到，帮小胜解了围。小胜对自己的行为非常惭愧，向阿奇道了歉，双方冰释前嫌。这时火箭队再度出现，试图捕捉蛇纹熊，众人齐心合力将火箭队打败，而阿奇也终于如愿收复蛇纹熊。
前往卡那兹市的小智一行人来到一座森林，听说最近这一带目无法纪的宝可梦盗猎者很猖狂。由于发现了盗猎者使用的捕获网的一部份，小智一行人遂加入帮忙君莎小姐追捕犯人。火箭队三人组偶然发现宝可梦猎人阿隆抓到的大量有毒宝可梦阿柏蛇与瓦斯弹，原来他是受雇佣来捕捉毒属性宝可梦的。由于长期以来的好搭挡阿柏怪与双弹瓦斯就是由阿柏蛇和瓦斯弹进化而来，对这两种宝可梦有深厚感情的火箭队，下定决心要救出这群宝可梦并把它们收为同伴。但是这个行动被盗猎者阿隆发现，火箭队的阿柏怪与双弹瓦斯也成了他想要捕捉的目标！面对使用实力强大的宝可梦大嘴雀、班基拉斯的阿隆，火箭队完全无反抗能力！但是喵喵顶着强力的高压电击拼命放出了所有的瓦斯弹和阿柏蛇，并且由武藏和小次郎拼死拖住阿隆的行动，让双弹瓦斯和阿柏怪保护大家迅速逃跑。阿隆打倒了火箭队，试图重新捕捉逃走的阿柏蛇和瓦斯弹，但被赶来的小智一行人和君莎小姐截住，君莎小姐命令阿隆立即释放盗猎得来的宝可梦，阿隆恼怒地说那些宝可梦早已被其他人救走了，小智感慨这个世界还是好人更多。告别了阿柏怪和双弹瓦斯的火箭队三人组走在森林中，仍念念不忘它们能否保护好自己的同伴。这时之前在他们被一群大针蜂围攻时伸出援手的那只刺球仙人掌再度出现，手里还拿着小次郎先前送给它那袋食物。小次郎将食物喂给刺球仙人掌吃后，刺球仙人掌非常开心，于是加入了火箭队，成为小次郎的新宝可梦。
旅行途中，小智在森林遇到以前就很中意的森林蜥蜴宝可梦木守宫，他兴奋地想马上收服木守宫，但是却不小心从山坡上滚下去。与小遥等人走散的小智，滚到了一棵枯萎而神秘的巨大树附近，并遭到一只离群独居的木守宫的攻击。小智派皮卡丘应战，但还是被木守宫敏捷的身手给压制住。这时，一只年长的木守宫带着另外几只木守宫突然介入，结束了这场莫名奇妙的战斗。原来那些木守宫的目的是来带走这只独居的木守宫，它们对于这只顽固的木守宫不肯离开巨大树的行为深感头痛。而由于这只木守宫是在这棵树上出生的，因此它坚持要照顾这棵树。木守宫的行为让小智非常感动，于是他用实际行动全力支持这只一心一意要照顾巨大树的木守宫。这时候，火箭队突然出现，企图大量捕捉木守宫，而小智的皮卡丘也被一起捉走。木守宫挺身而出，巧妙地引诱刺球仙人掌用飞弹针刺破了火箭队的气球，从而使大家趁机逃脱。经历此事后，木守宫得到了同伴们的理解，但那棵巨大树终于还是因过度衰老而倒下了。接着，木守宫向小智发出了挑战，小智派出皮卡丘打倒了它并顺利将其收服。最后，木守宫种下了巨大树留下的种子，告别同伴跟随小智一起离开。
小智一行人在森林公园用餐，这是旅行中最快乐的时间之一。但是有个黑影躲在草丛中专门瞄准这快乐的时刻，原来是毒蛇宝可梦饭匙蛇想要偷走食物。小遥的宝可梦火稚鸡不仅被抢走了食物，还被饭匙蛇玩弄于股掌之间。不过小智的木守宫很快的以漂亮的身手救下了火稚鸡！可是，愤怒的饭匙蛇的反击也让木守宫的右手受了重伤。木守宫被小智等人紧急送去宝可梦中心，治疗过后虽然没什么大碍，但是木守宫无法接受自己被饭匙蛇打败，便悄悄离开宝可梦中心，打算独自找饭匙蛇做个了结。与此同时，火箭队也遇到了饭匙蛇，他们的食物也同样被饭匙蛇一抢而空。怒火中烧的武藏对着饭匙蛇一顿拳打脚踢，并最终成功收服了它。而小智他们在瀑布旁边找到了木守宫，原来它正在独自进行着严酷的特训，以求变得更有力量。这时火箭队出现并派出新收服的饭匙蛇攻击众人，木守宫将饭匙蛇打败，成功地赢回了自己的尊严。
前往卡那兹市的旅途，小智一行人穿越广大的森林，终于来到睽违已久的城镇。一行人分成二组行动，享受都市生活的乐趣。小智带着小胜一顿饱餐后，在街头发现一只因害怕躲在巷中发抖的蘑菇宝可梦——蘑蘑菇。蘑蘑菇最初对小智等人深怀戒心，不过很快的就对温柔呵护自己的两人打开心扉，而小胜对本来应该住在森林的野生蘑蘑菇为何会在城市出现，感到很不可思议。两人带着蘑蘑菇行走在街上，但在经过一栋老旧的房子前面时，蘑蘑菇突然跑进大宅子里面！于是小智等人慌张的追了上去。同时，在街上购物的小遥与小刚听到了镇上被诅咒的大宅院的谣言……到底蘑蘑菇是发生什么事了呢？那个大宅子里面到底有什么东西在呢？
旅行途中，小智一行人发现一所号称拥有“世界最强的宝可梦”的民间道馆。虽然“世界最强”一词令人怀疑，但一行人仍兴致勃勃的前往挑战。里面走出来的是少年安东尼与水鸟宝可梦大嘴鸥。小智马上与这个人展开对战，可是作为水属性宝可梦的大嘴鸥竟然接连使出使出草属性招式藤鞭、火属性招式喷射火焰、电属性招式打雷等，这些不合常理的招式变化，将木守宫、傲骨燕纷纷打倒，皮卡丘勉强打成平手，可是也是两败俱伤的局面。小智虽不甘心，但也带三只宝可梦到宝可梦中心治疗。火箭队想要抢来这只世界最强的大嘴鸥，结果偶然发现最强的宝可梦大嘴鸥那变幻自如的招式秘密，原来就是安东尼事先在大嘴鸥的口中藏好了装有鸭嘴宝宝、喇叭芽、小磁怪等宝可梦的精灵球。火箭队于是以将此事告诉别人而威胁安东尼与他们合作，迫于火箭队的压力，安东尼只能屈从。小智一行人在宝可梦中心治疗受伤的宝可梦时，得知有很多训练家的宝可梦被夺走。他们重新赶回安东尼的道馆，却看见火箭队在使用大嘴鸥同大家对战，并且火箭队称挑战者若是战败就要没收挑战者所使用的宝可梦。小智派皮卡丘去迎战，仍然落在下风。小胜觉得情况非常不正常，于是一个人偷偷溜进道馆内部，想要找出世界最强的秘密，结果遇到了被火箭队控制的安东尼。安东尼坦然向大家承认的自己不应该使用不正当的手段，并用大嘴鸥和众人联手击败火箭队。在战斗中，安东尼意识到大嘴鸥确实很强，于是下决心要将它培养成真正意义的世界最强。
小智一行人在旅行途中误入宝可梦保护区，在那里遇到一群大狼犬的攻击，双方僵持时，一位自称可莉的女子出现。原来她是守护这个保护区不被盗猎者侵害的宝可梦保护官和医生，因为误以为小智、小遥他们是非法盗猎者而发起了攻击。但是在大狼犬之中，有一只是没有进化的土狼犬。听说它是与其它大狼犬同时期出生的，可是不知道为什么，只有这只土狼犬的进化很迟缓。从没目睹过宝可梦进化的小胜，闹着要看土狼犬的进化，坚持要留下来。不得已，一行人只好在这里停留一阵子。小胜告诉土狼犬，如果想要进化，就必须多使用“咬住”，并借用小遥的火稚鸡去跟土狼犬对战，但土狼犬在战斗时总是只会使用撞击。小胜很着急，于是独自带着土狼犬离开。此时，火箭队三人组突然出现，向小胜介绍他们发明的所谓“宝可梦进化装置”，称只要把宝可梦放进去就可以迅速实现进化。小胜虽然没有上当受骗，但土狼犬与很多宝可梦还是被火箭队抓走。危急关头，土狼犬终于听从了小胜的指挥使出咬住撕破了网子，成功地救出了大家，并进化成了大狼犬。小胜如愿以偿见到了宝可梦的进化，而大狼犬的同伴也都为它感到高兴。
旅行途中，小智一行人在湖里游泳时遇到了“浮萍宝可梦”莲叶童子。就在他们与莲叶童子玩得正开心时，一个女孩突然出现，她很生气地呵斥他们不应该在莲叶童子生活的湖中游泳，并强行将小智他们带回家受训。原来这个女孩叫奈绪子，她与两个姐姐典子和玲子经营着一家花店。大姐典子对奈绪子的失礼表示歉意，于是她招待大家享用好吃的树果烹饪，带领众人参观了她们的果园，并热烈谈论起对宝可梦有各种效果的树果。二姐玲子告知花园的灌溉系统损坏，这时湖里的莲叶童子们出现，帮助大家浇灌花木，而其中有一只莲叶童子似乎总是不在状态，小刚见状便耐心地引导它。三姐妹中最年幼的奈绪子似乎喜欢上了小刚，并对小刚过于亲近她的两个姐姐非常不满。由于小刚说他很想看看树果中少见的文柚果，奈绪子竟然独自到森林里去寻找！森林天黑后容易迷路。小智、小刚和玲子急忙出发去寻找奈绪子，而先前那只莲叶童子也跟上来了。最后众人终于在森林深处找到了奈绪子，奈绪子交给小刚一颗文柚果，小刚非常感动。回到花店后，众人撞上火箭队正在大量捕捉莲叶童子，皮卡丘和莲叶童子合作，击沉了火箭队三人组的座船，解救了大家。小智一行人告别了花店三姐妹踏上旅途，而之前那只莲叶童子又跟了过来，于是小刚决定带它一起离开。
小智一行人为了挑战在丰缘地区的第一场道馆对战，以卡那兹市为目标前进。在卡那兹市附近一个特殊场所卡那兹中心，那里正在举办宝可梦华丽大赛。这与依靠实力来决胜负的一般对战不同，比的是绝招的华丽度与宝可梦本身的成长情况。一行人很感兴趣的想要参加，可惜大会已经报名截止。但是，在刚认识的参赛者惠美与英二的好意邀请下，一行人得以助手身份出场。不止如此，以前曾参加这个比赛的火箭队的武藏，也会出场?!对这项比赛抱有浓厚兴趣的小遥兴奋不已，别开生面、精彩的宝可梦大赛现在即将开始!!
小智一行人在森林深处悠游自如的前进。越过这座森林，就是第一个目的地卡那兹市了。此时忽然出现一只“竽虫宝可梦”刺尾虫。小遥最初很害怕刺尾虫，但当她得知之前出现在宝可梦华丽大赛上的狩猎凤蝶就是由刺尾虫进化而成之时，立刻对它表示了浓厚兴趣，想要收服。由于太专注于追逐刺尾虫，小遥不知不觉间与小智等人走散，走入了森林的深处。另一方面，在大会上得到惨痛经验的火箭队，也想捕捉可以进化成狩猎凤蝶的刺尾虫。这两组都想得到刺尾虫的人马，在森林中不期而遇。想得到华丽的狩猎凤蝶的小遥，与火箭队展开争夺刺尾虫之战。正在小遥孤立无援时，突然一位带着赫拉克罗斯姓泽间的男孩帮助了她，打飞了火箭队。得知小遥想要一只刺尾虫，泽间自告奋勇带她去森林里寻找。另一方面，小智正在为道馆战做准备，训练皮卡丘练习使用铁尾，但每次都只差一点点。突然出现一位自称姓泽间的男孩邀请小智来一场双打对战，并告知小智，这种类型的对战在丰缘地区很流行。小智于是欣然应战，并派上了皮卡丘和木守宫。激烈的战斗中，皮卡丘施展出了钢铁尾巴，成功击倒泽间的蜻蜻蜓和阿利多斯。双方均对对方的技术表示钦佩，于是小智一行人便邀请泽间共进午餐。而在森林深处，小遥终于发现了一只刺尾虫，在泽间的指导下，小遥使用火稚鸡，终于成功地捕捉到了刺尾虫，却被火箭队三人组抢走，小遥使用火稚鸡和刺尾虫共同上阵，再次将火箭队击飞。小遥带着泽间与小智等人见面，大家见到两个长相一模一样的泽间非常惊讶。原来这两人是双胞胎兄弟，大哥泽间一郎一直在外旅行，而弟弟泽间次郎则住在这里守护着森林。泽间次郎告诉大哥他也想出去进行宝可梦的修行，泽间一郎鼓励他勇敢前往，并表示自己将代他承担守护森林的重任。
以挑战卡那兹道馆为目标的小智一行人，终于来到卡那兹市，并见到了道馆馆主杜娟。不过由于杜娟同时兼任宝可梦训练家学校的老师，要在这里上课到明天，所以小智还需要等待一天。校长带小智一行人参观了整个学校，告诉他们在成为正式的宝可梦训练家之前，必须在这里进修，学习关于宝可梦各种各样的事。从入门班、竞赛班到博士班，对学校的教育内容制定，都是学生高兴决定的。由于校长的好意，小胜得到一天的时间可以在学校旁听，体验这个入门班所有的事。杜娟老师也把小智和小刚介绍给入门班的学生，并诚恳邀请他们向孩子们介绍经验。而小遥则对有关华丽大赛的培训班表现出浓厚兴趣，她也混进了学生中听课，但得知还要考试后就又溜了出来。小胜在入门班结识了因害怕而不愿与宝可梦接触的浩太、对宝可梦训练家并不感兴趣但被家里人强行送来上课的女孩莎美等朋友，而能力很强但性格高傲自负又爱欺负人的小拓则处处想和小胜分个高下，于是两人分别使用鸭嘴宝宝和蚊香蝌蚪进行了一场对战。小胜使用蚊香蝌蚪顶住了鸭嘴宝宝的几轮喷射火焰攻击，正要使出水枪反击时，火箭队三人组出现并抢走了学校的宝可梦。在浩太的指挥下，小胜、小拓和莎美齐心合力打败了火箭队，救回了被抢走的宝可梦。而孩子们也通过这次合作战斗增进了友谊，大家都非常开心。
小智一行人到达卡那兹市，向丰缘地区第一家道馆挑战的日子终于到了。从以前就对比赛招式华丽度的宝可梦华丽大赛有兴趣的小遥，终于下定决心要成为一名宝可梦协调训练家，目标是参加华丽大赛，从而放弃道馆挑战比赛。于是这场和卡那兹道馆馆主杜娟的战斗就成了小智一个人的挑战。为了对抗杜娟的擅长使用高防御力的岩石属性宝可梦，小智与皮卡丘苦练对岩石属性效果优越的招式“铁尾”，并终于取得了一定的成效。比赛开始后，杜娟首先派出了小拳石上阵，小智一方则使用木守宫迎战，虽然木守宫使出了威力很强的拍击，但由于小拳石防御很高，无法造成有效的打击。而木守宫则因为连续被小拳石的百万吨重拳击中而失去战斗能力。小智随即派皮卡丘出场，皮卡丘运用打雷，将整个岩石地面夷为平地，限制住了小拳石的滚动，成功将小拳石打败。但面对之后出现的朝北鼻，无法随心所欲使出铁尾的皮卡丘还是陷入了苦战。在杜娟命令朝北鼻使出最强杀招电磁炮时，皮卡丘迎难而上，强行用身体接住了这记电磁炮，随后带着巨大电量扑到了朝北鼻的身上，造成了朝北鼻的全身麻痹，皮卡丘旋即及时使出新招式“铁尾”，一击制胜。小智如愿收获自己在丰缘地区的第一枚徽章——岩石徽章。
打赢了卡那兹道馆的比赛，小智一行人的心早就飞向下一个目的地武斗道馆。等待驶往武斗岛的船出发的期间，一行人决定在卡那兹市分开来自由行动一阵子。 小胜在街上认识了从衣服到食品、什么都生产的梦幻公司，得文制造股份有限公司的社长，兹伏奇。喜欢小孩的兹伏奇很欣赏小胜，带小胜到总公司参观，让小胜对一个又一个的新发明大开眼界。这时候，两人发现伪装成社员的可疑男子，展开了跟踪。同一时间，研究所内因为遭窃而一阵骚动。东西是这个男人偷走的吗？他的真实身份究竟是什么？
由于小遥的疏失，小智一行人没有赶上驶往武斗岛的班船。小遥为了负起责任，到处寻找开往武斗岛的船只，她认识了退休的老船员哈奇老人。哈奇老人自愿送一行人到武斗岛，但是等小遥带大家过来时，哈奇老人的态度却是180度大转变，冷淡的赶走一行人。百思不解的一行人，从君莎小姐那里听来令人担忧的消息。上次躲在得文制造有限公司的海洋队的人，听说就躲在这附近，打算与同伴会合。企图在海上与同伴会合的海洋队的男子，与拥有私人船只的哈奇老人的变化，二者似乎有某种关联。一行人抱着这样的想法，赶紧回到哈奇老人的地方。到底，哈奇老人与海洋队之间有什么样的关系？小智一行人是否能够抓住海洋队呢？
小智一行人搭上了哈奇老人的船前往武斗岛，途中他们抵达了一座半月形的岛屿。到了晚上，营火的旁边有一群巨牙鲨在围着他们，当他们不知道如何离开时，小刚提出了一个策略驱赶了巨牙鲨群……
为了尽快得到丰缘地区的第二间道馆徽章，小智一行人来到武斗道馆门口。然而，道馆馆主藤树却拒绝小智的挑战，从道馆跑出去冲浪。斗志高昂的小智气不过去，一直纠缠着藤树，最后终于如愿以偿。小智认定藤树是只晓得玩冲浪的不务正业的人物，所以对这场对战充满了自信。可是面对小智来势汹汹的攻击，藤树的宝可梦却运用冲浪中练出来的身手，很轻松的化解了小智的攻击。小智急得失去判断情况的能力，依然采用硬攻的方式，结果……
