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宝可梦
当小智、小遥和他们的朋友们继续在丰缘地区冒险时，一种阴影笼罩着他们，这不仅仅是烟囱山的阴影——熔岩队和水舰队也开始行动，而我们的英雄们不幸被卷入其中！在挫败邪恶计划的同时，小智和小遥也在追逐各自的个人目标：小智为争夺另外三枚道馆徽章而战，小遥则赢得了她的前三枚华丽大赛缎带。这群人还获得了新的宝可梦，如煤炭龟和妙蛙种子，但它们会不会难以驾驭呢？
小智一行人发现路边的河上漂来了三个西瓜，他们将西瓜捞上来开始一起吃西瓜。吃西瓜吐西瓜子的习惯让小智想到了可以让木守宫练习种子机关枪绝招。就在他们边吃边练的时候，一位少女带着她的宝可梦们怒气冲冲的前来，说小智一行人是偷瓜贼。在被证实是冤枉的之后，这名少女感到十分惭愧，决定带着小智一行人前往自己的瓜园参观以赔罪……
小智一行人在远遥湖边看见湖中心的平台上，有一对年轻人和他们的电萤虫与甜甜萤在做着某种表演。原来这里在进行远遥祭排练，可是电萤虫的训练家罗密欧似乎太过紧张，以至于把排练搞得一团糟。但罗密欧一个人表演的时候却可以十分完美的完成，只要和甜甜萤的训练家茱丽叶一起就会十分慌乱。小遥一针见血地说出了其中的原因：罗密欧爱上了朱丽叶……
小智一行人在山区行走，突然一只宝贝龙从山崖上冲出，然后用坚硬的脑袋撞碎了小智面前的大岩石。小智以为这只宝贝龙是野生的宝可梦，于是派出傲骨燕和它战斗。这时，宝贝龙的主人米雪儿出现并阻止了战斗。原来这只宝贝龙梦想着早日能在天空中翱翔，所以经常从悬崖跳下想要飞行。为了让宝贝龙早日进化成能够飞行的暴飞龙，小智同意和宝贝龙来一场战斗。结果会如何呢？
小霞因为收到了波克比祭典的邀请函而来到了丰缘地区，和小智一行人约好了见面。小霞进入了所谓的会场，却没想到这是一艘飞艇改装的。小智一行人也不顾危险强行上了飞艇。他们被带到了一个叫做米拉祖王国的地方，接待他们的人是想要夺走波克比摄政大臣韩佐。面对韩佐的攻势，小智和小刚让小霞等人先跑，他们留下来应战。韩佐为什么要觊觎波克比？小智一行人的下场又将如何？
在韩佐的宝可梦们的攻击下，波克比使用神秘守护，将众人带到了海市蜃楼中的波克比的乐园。但是众人发现波克比乐园变得十分荒芜，连里面的波克比们也十分虚弱。这一切都是因为涉政韩佐心术不正而影响了里面的环境。韩佐企图强制打开通往波克比乐园的门，小霞的波克比为了保护乐园，被韩佐抓走了。得到了波克比的韩佐立刻就开始了政变……波克比的命运会如何？波克比乐园能否回复从前的景象？
小智一行人在前往秋叶镇的路上因为水喝光了而昏倒在地。幸运的是，他们被在附近耕作的连胜家族给救了。小智一行人想要报答对方的救命之恩，然而连胜家族的老奶奶光代却提出要报答就来对战。小智答应了光代，并和连胜家族展开了4对4的宝可梦战斗。战斗的结果会如何呢？
在为即将到来的华丽大赛做准备的小遥无意中把飞盘扔远了。前去捡飞盘的火稚鸡发现了草丛中有一只虚弱的向尾喵。为了让向尾喵恢复，小刚带着众人来到可以做芳香疗法的研究所。在芳疗师亚里莎的芳香疗法治愈下，向尾喵很快就恢复了干劲。就当小遥准备在向尾喵恢复之后收服向尾喵时，火箭队突袭研究所并打算抢夺这里的香精。在一阵混乱之后，向尾喵不见了……
在前往秋叶镇的路中，小智一行人在森林中看见了两只猫鼬斩。原来其中一只就是曾经遇到过的短裤小子阿奇假扮的。阿奇再次向小智发起了挑战。小智的木守宫帮小智赢下了第一局。就在阿奇换上猫鼬斩时，猫鼬斩似乎察觉到了草丛中的异动，跳进了草丛。猫鼬斩找到了武藏的饭匙蛇，这两个天生的死对头不顾训练家的命令打了起来。宿敌的对决，也激起了武藏和阿奇的斗志，究竟谁胜谁败呢？
小智一行人在森林中的一家宝可梦中心休息时，看见了一位从名字到外貌都和小胜很像的少年，胜人。可是小胜和胜人看似很像，却一见面就吵架。小遥带着小胜来到湖边，他们看见了胜人正在抚摸一只溜溜糖球，就在小胜和小遥准备靠近溜溜糖球观察时，胜人阻止了两人并再次和小胜吵了起来。胜人为什么要和小胜争吵？两个人之间的关系能否和好？
小智一行人终于来到了即将举办宝可梦华丽大赛的秋叶镇。他们在宝可梦中心遇见了正在修炼的葛蕾丝和她的恰雷姆。葛蕾丝教授了小遥参加华丽大赛的心得，并让恰雷姆向她展示了组合招。但是，小遥似乎还不会让狩猎凤蝶使用组合招。接着到来的小瞬向小遥展示了自己获得的三个奖章，这让小遥显得更加迷茫。小遥能否让狩猎凤蝶使用组合技？她为华丽大赛能否准备充分？
在秋叶镇举办的华丽大赛终于拉开了帷幕。在第一轮的招式展示中，小遥和她的狩猎凤蝶好不容易以微弱的优势晋级了第二轮。在第二轮的对战中，小遥的对手是化妆参赛的武藏。对着在第一回合拿到了最高分的武藏的毒粉蛾，小遥的狩猎凤蝶最终还是凭借着漂亮的招数将其打败。终于晋级决赛的小遥的对手将在葛蕾丝和小瞬之间产生。到底谁会晋级决赛？小遥能否迈出华丽大赛的第一步？
前往釜炎镇的小智一行人路遇曾经在紫堇市附近山上灯塔的小男孩和智。和智说他下定决心出来旅行，然后加入了专门为宝可梦比赛加油的应援道。火箭队也看见了应援道这个机会，请应援团的关户团长帮他们加油让他们在和小智的对决中取得胜利。谈妥了委托金后，关户答应了他们并表示一定让他们赢。关户团长为何如此有自信？火箭队的挑战能否胜利？这一次挑战藏着什么阴谋呢？
因为向尾喵的调皮，被熔岩虫追逐的小智一行人不得不在热焰小径中强行冲出洞穴。这时，他们看见了一只呆火驼。随后，呆火驼的主人阳子前来并邀请小智一行人前往她家过夜。就在小刚帮助阳子照顾呆火驼时，小遥想用向尾喵和阳子来场战斗。在看过图鉴之后，小遥知道了向尾喵可以使用借助绝招。使用借助绝招，向尾喵竟然使用出了火花和银色旋风……
小智一行人乘着缆车打算翻过烟囱山，可是就在缆车上升到半空时突然停了下来。原来在烟囱山上，索蓝斯博士发现了一块不久前落下的陨石，而海洋队和熔岩队也都驾驶着直升机赶到烟囱山，企图抢走陨石。一场在两大势力之间的战争一触即发。他们为什么都盯上了那块陨石？战斗又会朝什么方向发展？小智一行人又能否安全到达目的地呢？
小智一行人终于到达了以温泉闻名的釜炎镇。迫不及待的小智立刻就拉着大家前往釜炎道馆进行道馆比赛。他们在釜炎道馆门口遇见了刚刚接手道馆工作的新人道馆训练家，亚莎。小智立刻就想向亚莎挑战，但是进到道馆才发现战斗场地因为之前的战斗而变得到处是坑洞。为了比赛能够早日开始，小智一行人也帮着亚莎修整战斗场地。暗中看着刚刚上任的道馆训练家，原道馆训练家，亚莎的爷爷穆拉一直放不下心。亚莎能把道馆的工作做好吗？
终于，釜炎道馆道馆馆主亚莎准备好了和小智的道馆比赛。对于亚莎的宝可梦，小智都十分清楚，于是他派上了属性上有优势的龙虾小兵打头阵。亚莎因为属性上的压制一时间失去了冷静，在恢复冷静之后，亚莎更换了策略，但还是没有抵挡住龙虾小兵的攻击。但亚莎的第二只宝可梦熔岩虫却让小智陷入了苦战。小智能否顺利夺得他在丰缘的第四枚徽章？
小智一行人在途中遇到了一群晃晃斑，其中有一只晃晃斑的斑点居然是心形的。随后赶来的爱莉和洛伊兹说那只晃晃斑是能给人带来幸福的晃晃斑，但那只晃晃斑随后就逃跑了。他们希望小智一行人帮助寻找。小刚立刻答应了爱莉的请求。但是山上是成群结队的晃晃斑，在一大群晃晃斑中找一只特定花纹的真是大海捞针。小智一行人能否找回晃晃斑？晃晃斑又为什么会逃跑呢？
小智一行人在返回紫堇市的山谷中遇见了一只被小磁怪和盔甲鸟袭击的煤炭龟。小智和皮卡丘赶走了小磁怪和盔甲鸟救下了煤炭龟，但是煤炭龟又向山谷中跑去。在追上煤炭龟后，他们看见煤炭龟有和那几只宝可梦打了起来。在小智和小遥的宝可梦的帮助下，煤炭龟战胜了那几只钢属性宝可梦。可是煤炭龟到这个叫做钢之谷的地方来到底是为什么呢？
小智一行人再次来到了紫堇市，迎接他们的是一个游乐园。就在一行人和宝可梦在欢快玩乐时，才发现这一切都是火箭队设的陷阱。就在小智等人的宝可梦被火箭队抓住时，铁旋和华特赶到并救了大家。按照之前的约定，小智和铁旋决定再来一次战斗。同时，华特也邀请小遥和他比试。约定的战斗会如何发展？
小智等人向著即将举办华丽大赛的绿荫镇前进。但是，与火箭队的战斗使得向尾喵嗓子出了问题，一行人遂决定到附近的宝可梦诊所看看。向尾喵在经过治疗后恢复了健康。小智等人得知这位负责治疗的女性，是有名的传说的协调训练家绫子时，跟她问了许多的问题。但是，可疑的阴影也正悄悄靠向他们……
