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末日孤舰
在第二季中，钱德勒和船员们积极发放解药，但当他们返回美国后，却遭到了其他想争夺权力的党派和天生对瘟疫免疫想要统治世界的幸存者们的反对。 昔日人马早已散去，钱德勒舰长另任新职，XO斯莱特林担任DDG151号上的新舰长，在钱德勒赴中国之后，斯莱特林遭到袭击被绑架，钱德勒受总统之令再度召集原班人马，前去营救。
钱德勒舰长被派往亚洲去调查可能发生变异的恐怖病毒，“内森·詹姆斯号”副指挥官Slattery和他的船员们向东南亚地区提供治疗服务，但是发现随时都有可能会出现不可预测的威胁。
钱德勒舰长必须想一个带他的部下返回的方法，并开始调查一个危机的陌生的敌人。
钱德勒和船员们在亚洲的道奇城寻找到案，Slattery开始揭露令他不安的艰难处境的真相。
钱德勒必须面对他的新敌人，Slattery对所谓的病毒变异有了更进一步的了解。随着局势的恶化，总统先生的压力越来越大。
随着处境的恶化，钱德勒的任务变得复杂起来。同时，总统先生迎来各地区领导人的烦恼和担忧。
当钱德勒准备完成计划中最后一部分时，他的任务临近结束。而总统先生担忧起他的仕途命运。
“内森·詹姆斯号”必须躲避巨大的威胁。在圣路易斯市的一个意外发现将总统先生致于一个可怕的境地。
当钱德勒进一步研究可能发生的病毒变异时，一场悲剧在美国悄无声息的到来。
钱德勒找到一个可以解决威胁问题的线索。Kara在白宫做了一些深入的调查。
当白宫的命令下达时，钱德勒无比艰难地做着决定。
钱德勒与劲敌免不了来一场终极对决。Kara加入了一个可以帮她完成使命的团伙。
钱德勒回到了美国，他想弄明白到底发生了什么。
为国一战终于到了头，钱德勒接受的挑战可能永远改变他的生活。
