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Rewrite
故事发生在绿色都市——风祭。居住于这座以“文明与绿色共存”为理念而兴建的都市里的天王寺瑚太朗，与神户小鸟、吉野晴彦等伙伴过着平凡的每一天。在那么和平的风祭市里，每年都有一段时间特别热闹，那就是举城欢庆的收获祭。为了这个类似于文化祭的大型活动，瑚太朗开始干起收集新闻素材的工作。 同一时间，瑚太朗的身边也开始出现种种无法解释的奇怪事件，而在风祭这个地方，正盛行着各种未知生物以及超自然现象之类的流言。瑚太朗开始着手调查这些事件，并向超自然研究会会长千里朱音寻求帮助，还把自己所认识的同学们也一并卷了进来。 这其实是瑚太朗的小小冒险心在作怪。“要是能跟伙伴们一起打打闹闹地生活下去，那该多好啊。” 瑚太朗这时还没有意识到，自己的行动已经和探寻那谁也不知道的“真实”联系在了一起。 ——那个女孩的命运，能够被改写吗。
绿化都市，风祭。在以与文明和绿色共存这一理想之下兴建的都市中，和神户小鸟、吉野晴彦等友人一同度过平凡日常的天王寺瑚太朗，开始每夜为灵异现象所困扰……
瑚太朗见到了学园的魔女·千里朱音，并加入了超自然研究会。为了证明超常现象确实存在，瑚太朗和伙伴们一起开始了超自然研究会的活动。
超自然研究会终于正式启动了。作为初次的调查，他们开始寻找野槌蛇……
瑚太朗为了了解有关未确认生物的事情而去寻找老绅士。在经过一番打听而找到的店里，有着那位老绅士和静流的身影……
某天，超自然研究会收到了有关“旭春花”的投稿，于是瑚太朗立即展开调查。
千早和露西娅的矛盾得以解决，超自然研究会的活动再开。在进行着对各种各样超自然现象的探究过程当中，他们开始对“彩虹乐园”展开调查。
自从井上的消息断绝以来已过了5天，朱音突然宣布超自研的活动停止。
自森林事件以来，与朱音、千早、露西娅、静流、小鸟都无法取得联络的瑚太朗面前，出现了一位少女的身影。
为了帮助失忆的篝寻找自我，瑚太朗开始带着篝走到街上……
与小鸟重逢，并得知了小鸟与篝的秘密的瑚太朗。此时，破坏了结界、侵入秘密基地的某人出现了。
在朱音的命令下，千早前往咲夜的所在之处。她在寻找小鸟的秘密基地而彷徨在森林中时，发现了倒在地上的某个人物。
篝的样子变得越来越奇怪了。而御堂也带着地龙破坏了结界，出现在与露西娅、千早会合的瑚太朗的面前。
毁灭之歌响起，世界在被解放的魔物们与自然的威胁下崩坏。此时，篝醒了过来，正当瑚太朗等人为此高兴时，江坂在他们面前出现了……
