...
少年夏驰天性纯良、聪明缜密，是学校推理社的成员。在一次推理社活动之后，接触过“季陆案件”的夏驰女友晴知神秘失踪，为了寻找晴知，夏驰和好友孟秦无意中发现了一个名为“端脑”的虚拟游戏组织，并一起进入了端脑游戏的世界。在一局一局的推理游戏中，夏驰和孟秦经历了各种人性和智慧的考验，也目睹了这个游戏背后“端脑”组织拥有的巨大权力和财富，更不断怀疑和挑战着这个游戏的最终目的。经过各种九死一生、危险重重的考验，夏驰最终抵制住来自“端脑”世界的种种诱惑，救出了晴知，揭开了端脑游戏的真正目的，并发现了与地球处在平行宇宙中的另一个星球的存在。而端脑，则是这个星球为了平衡两个宇宙而打算消灭地球文明的一个危险计划
黑夜城市亮起霓虹灯，某家金碧辉煌的洗手间里，一名男子正在洗刀，洗手池边放着白色的毛巾，他用毛巾擦刀，抬起手的瞬间发现白衬衣袖口被血浸湿，盆子里沥沥拉拉有半盆血。就在刚才，他杀了一个人，在他看来，杀人真的是非常简单的事情。他邪肆的对着镜子微笑，舔了舔嘴角沾着的血痕。他叫薛鑫，是个侦探推理小说家。
空间里出现一个咖啡店，两人来到咖啡店，夏驰询问侍应生是否见过晴知，却被问有没有会员卡，当回答没有会员卡，侍应生立即告知没见过这个女孩。这时夏驰发现空间消失了，这个咖啡店在外面时候，感觉店挺大，但进来后长度少了三米，空间去哪儿了。夏驰问后，侍应生绽放微笑，按了下响铃，只见原来消失的地方，打开门又是一个空间。
孤独无援的晴知，想到了小时候：在别人看来她生活在富裕幸福的家庭，可谁有知道钱和幸福没有任何关系，今天爸爸又打妈妈了，他每次喝多酒后都会这样，男人都是野蛮生物。那一天爸爸告诉她说，齐龙集团的少爷和你同龄，有空去见一面，他们是我们重要战略合作伙伴，要给人家留个好印象。晴知称是。
夏驰进入一个宫殿，走下楼梯，看到了最开始的玩家，GM再开心的叫夏驰宝宝，时间是最好的老师，可他会在教好你一切时候把你弄死。请大家合力安全离开这个地方，成功离开加十分，失败玩家减八分。他只有六点五分，悄悄话，七号选手，你的可选专属任务，是阻止二号玩家离开，成功加五分，失败不扣分，不影响主线任务。
最后关头，夏驰横着身体从门里出来，让她抬脚，把脚从洞里拔出来。李萌问他为什么要回来，夏驰输了会死的，她之前害过他，她这几关熬过来的方法是没有人会真正相信她，必须以他们的利益为先，并做出让步，否则必死无疑。他们甚至把炸弹绑在她的脖子上，而控制器在他们手里，李萌问夏驰为什么还要回来陪她一起冻死。夏驰说因为他答应了她要一起行动的。
夏驰让他拉一把自己，看着他，春絮香想起不要对人手下留情，但最终还是拉他起来。夏驰开玩笑地责怪春絮香别再继续为这游戏增加难度就好了。游戏一直在测试团队的信任度，他们扛过去了，胜利就在前方。春絮香感叹，能跟夏驰组成团队真好。来到一个豪华宫殿，金碧辉煌，就在此时突然飞过来一把斧头，原来是针对三号春絮香的支线任务。
夏驰再醒来时已在医院，身上有伤。病房来了一位端脑保安公司领队，一身深色西服，向夏驰道歉，告诉夏驰他目前已经安全，没能及时支援是他们的失职。经过保安公司调查追杀夏驰的是一群雇佣兵，幕后指使是另一个电脑玩家，但是否因为报仇还不能确定，目前无法采取行动，因为端脑规定不能主动攻击其他玩家。
团队里八号率先打开行礼箱，发现只是一些生活用品，他一边检查一边念出生活用品的具体，说完八号因泄露本人信息出局。众人吓懵，此时七号自告奋勇做实验打开箱子，发现食物没有问题，而箱子只要背着别人打开就没有关系。夏驰打卡箱子，发现只有两瓶水，他暗自思量根本没有办法撑到第九天，现在看来杀手最好的办法就是不出现，到最后他们不得不通过自己消减人员来保证饮用水。
夏驰终于想明白了，真正的杀手不是十一号，而是七号。因为十一号的存在，他们想当然的认为一号到十号是生存团队，而十一号是杀手。但系统从来没有说过这样的话，十一号只是一个落单的玩家，凶手其实一直潜伏在他们身边。夏驰看着中毒的四号，想到也不是完全没有办法，四号的存活是关键。三号大叫着让十一号杀了七号，却不想博卞杀了她，仅仅因为她聒噪。杀完后十一号还为三号照了张相，七号吓得不轻，大叫变态。
夏驰和孟秦进入端脑游戏，这是夏驰的第四场游戏，余额为十五点五分。这一场游戏GM宣布名字是RUNNING MAN 团队对抗赛，游戏共有两支队伍参加，每个人手上都配备了导航仪，配备上的导航仪上标注了地图，起点就是他们现在的位置。与夏驰共同参赛的还有一个马尾女生和一个黄发男生。三人听完游戏规则，看着墙上的地图路线，周晨眼不眨一下就快速计算出距离和路线，将每一条路段距离报出，孙盼盼和夏驰看得目瞪口呆。
经三人回忆刚才的路线，从复位器上看，对手和他们是走一样的路线，对手确实是存在，除非躲起来，不然不可能碰不到。三人决定认输，集体走A路线，把BC让给对手。为防止对方也走A路线，把A4留着不要动，好让他们有转换的路线。游戏开始后三人同时走A路线，到达A4，等着没有动，这次并没有看到对手，却看到充电线自动抬起，自动复位，然而他们面前什么也没看到。三人原地爆炸，游戏再次失败。
本来是兄弟的六号和三号竟反目成仇，谁也不肯退出游戏，六号假装把安全点让给三号，却在嘱托他时生生把三号推下了方块！孟秦认为六号没有道德，说一套做一套。最后一次天塌开始，孟秦跳入了最中间位置，六号被愚弄，以为自己站的位置就是相应方块，最终被淘汰。等孟秦再次回过神，出现在宿舍里，孟秦新奇的看着周围，跟现实世界中一模一样。
夏驰一听到博卞的名字就犯了难，但找博卞是救晴知唯一的办法了，就在夏驰正要下定决心时，孟秦拍案而起说就这么定了，他要看看这个博卞到底有多变态，随即春絮香表示自己也要一起去。春絮香用自己的万能保镖团发现了博卞，然而转天三人去找博卞时却被吓呆了，原来变态博卞居然是个宠物园园长，画风清奇让三人不敢相信。
三名没有同伴的成员引起了众人的怀疑，随即队内的猪队友开始乱带节奏毫无逻辑地对其中一名成员进行公投，这种行为虽然有人表示不满，但由于少数服从多数，很快便淘汰了一人，成员的死状令其他人瑟瑟发抖，发现这个挑战并没有原来想象的那么轻松。猪队友见此形势就要对另一名无同伴的成员进行公投，而这一举动却遭到了反对。
逻辑思维能力过人的6号对夏驰的情况进行了一番分析，这让夏驰对端脑的套路又有了更深的了解，随即6号试探性的建议夏驰可以从可选任务中寻找更多线索，并暗戳戳的警告夏驰不要尝试高级玩家挑战，两人各怀戒心，幸好夏驰的滴水不漏瞒过了6号。出了小房间，夏驰与虚拟人再次确认今天的目标是淘汰10号。
夏驰被成员发起公投，正如夏驰所料，此次公投失败，于是夏驰开始继续出题，因为有朋友的成员嫌疑相对较小，所以题目主要针对没有朋友的三名成员。通过两道相同的题目，6号嫌疑排除，而另两名成员引起了其他人的注意，夏驰的一番推理顺利引导其他人对另两名成员加深了怀疑。于是这两名成员为了自保开始互相撕咬。
夏驰装作机器人的样子，话说到一半突然出现bug，这让两个猪队友对夏驰是虚拟人的事实更加确定，6号纵然对真相心知肚明，但现在也是百口莫辩，无论自己说什么都难以再挽回两个猪队友的想法，这时虚拟人再次补刀也同意夏驰是虚拟人，就这样夏驰获得整场游戏的胜利，获得高级玩家资格，退出游戏后夏驰返回了游戏大厅。
专家对干扰波找到了一些漏洞，这些干扰波虽然复杂，但没有任何加密，只要把自己的脑波跟这些干扰波进行同步，就可以进入游戏。嘉莉在名单上看到了夏驰，在夏驰成为正式玩家后，她的任务就是潜伏在他们身边伺机查出端脑秘密。而夏驰被攻击是任务之一，那两个死去的杀手从赢世界回去后进入了输世界，被他们保护起来。
游戏开始后，春絮香和博卞是站在大屏幕前观看夏驰的一举一动，六号上来就按掉号码，杀死一号，而夏驰则蒙头佩戴面罩站在场地中央，他琢磨着站在保险箱前没有好处，刚要离开，另一个佩戴面罩的人却袭击他。夏驰昏了过去。但不久后，夏驰又站了起来。此时春絮香已看不下去了，要和夏驰说话，博卞警告她他们只有三次交流机会。
夏驰退出游戏后，来到了湖边，赢世界的晴知质问夏驰，难道他们一起度过的一切都是假的吗。夏驰回说那些回忆固然美好，但不是真正想要的。夏驰戴着携手之戒进入季陆的游戏，终于看到了真正的晴知，晴知哭着和夏驰拥抱，晴知是突然间就到这个空间来了，有一个声音说，这是个游戏，名字叫做最后的谜题。
