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公孙丽自小与两位师兄跟随爷爷习武，偶遇少年嬴政遭人欺负将其救下，嬴政对这位妙龄少女念念不忘。战国纷乱，公孙丽与二师兄相恋，二人因战争离开家乡，相依为命。二师兄因保护公孙丽中毒受伤。为换解药，公孙丽进宫嫁给嬴政，成为丽姬，却发现已怀有身孕，嬴政替丽姬瞒下此事，谎称孩子是自己的，天明出生后，嬴政对他视如己出，丽姬深受感动。大师兄韩申进宫营救，得知真相后为保护丽姬及孩子，潜伏宫中做侍卫。丽姬在与嬴政相处中发现这个冷血男人细腻柔软不为人知的一面，不知不觉爱上了他。险象环生的后宫，丽姬面对为争宠心机重重的妃子，以聪慧和善良赢得尊重并以爱的力量感化身边每个人。
秦王嬴政在西山猎地狩猎，却被逼将猎物上缴长信侯嫪毐。卫国统帅公孙羽欲招揽天下第一剑客盖聂，盖聂和他比武获胜后拒绝助其对抗强秦。嫪毐乃太后男宠，他谎称嬴政遇袭而亡，又凭借太后调兵令牌兴兵反叛。嬴政在雍城行冠礼，他率兵亲征镇压嫪毐叛乱。秦国大将蒙武率军攻打濮阳，公孙丽目睹爷爷公孙羽死于秦国四大高手手中。公孙丽幼年时曾救嬴政，时至今日嬴政仍对她念念不忘。
嬴政冠礼后亲政，他下令尽数诛灭嫪毐门客。公孙丽女扮男装，陪同师兄荆轲寻找剑痴鲁勾践。嬴政微服出宫时和公孙丽联手惩恶，他们把酒言欢后意外同床一晚。吕不韦私囚嫪毐，他因此落入嬴政的圈套。嫪毐余党行刺嬴政，公孙丽为救嬴政受伤，嬴政为公孙丽求医才得知她是女子。丹顶门觊觎公孙羽的鹄落剑法，荆轲因此遭到鲍野追杀，危难之际剑痴鲁勾践现身搭救荆轲。
相国吕不韦回忆旧事，嫪毐原是他为讨太后欢心所送之礼。祖太后为了清君侧并试探成蟜，与相国密谋欲派其出征，嬴政虽然不喜却也无法阻止。与此同时公孙丽于卫王府悠悠转醒，嬴政为了隐藏自己的真实身份，便向前来探望公孙丽的卫王行臣子之礼。成蟜正在驻军大帐内休息却迎来一位不速之客太子嘉，在其相告之下成蟜方才明白母后之死与嬴政身世有关。难以抑制情感的成蟜决定兵向嬴政，兄弟二人从此决裂。
嬴政和成蟜对峙两军剑拔弩张，当岂曰无衣与子同袍的歌谣在两军间响起，嬴政兄弟二人断绝关系从此陌路。荆轲、公孙丽流浪时结识盖兰，他们在林间目睹盖聂以一敌二的绝世风采。祖太后在华阳宫与众位嫔妃聊起子嗣之事，惊奇发现嬴政多年来竟是独寝。嬴政刚刚回宫就被祖太后询问立后之事，却被心里挂怀公孙丽的嬴政搪塞过去。
嬴政为了找到公孙丽，遂下令全国通缉她。荆轲与公孙丽看到通缉令，便决定尽快离开秦国。嬴政前去相国府却遇上了吕不韦的门生李斯，一番交谈下来嬴政觉得此人可堪重用。荆轲师兄妹路遇秦国士兵被认出，二人夺路而逃。嬴政于王宫宴请吕不韦，在席间将吕不韦的官爵革去。秦国高手将荆轲师兄妹拦截在半路，荆轲为保公孙丽身受重伤。公孙丽带荆轲前去医治的途中路遇田光，方才得知秦王下令通缉是为了得到自己。
公孙丽将荆轲交给田光，她孤身入秦王宫殿寻求解药，却惊诧发现秦王嬴政的身份。嬴政坦白想要的唯有公孙丽，公孙丽承诺三个月后入宫，她用自己换取荆轲的解药。荆轲服下解药后转危为安，公孙丽并未将解药来源告诉他。荆轲和公孙丽一起出外游玩，荆轲买丝巾当定情物送给公孙丽。李斯谏言进攻韩国，嬴政封他为廷尉。荆轲一心想要精进剑术，田光遂举荐他和高渐离切磋武艺。
荆轲和公孙丽自创双人剑法，一招一式间全是情愫。嬴政撤免相国吕不韦辅政之职位，又命赵高监视封地中的吕不韦。公孙丽和荆轲在山洞中躲雨，公孙丽欲背弃诺言和荆轲远走高飞，她动情的献身荆轲。荆轲赶赴和高渐离的比武之约，公孙丽则被迫了断前缘进入秦王后宫。后宫妃子恶意中伤公孙丽，此时公孙丽被太医诊断有孕，嬴政得知此事含怒下令杀死胎儿。
公孙丽以死相逼保全胎儿，嬴政遂设法为她隐瞒怀孕之事。嬴政册封公孙丽为良人丽姬，她却当众念诗以证明对荆轲的爱意。丽姬比武意外战胜蒙武，嬴政却食言不肯将公孙氏祖传的青铜短剑归还丽姬。嬴政欲认丽姬腹中胎儿为亲生骨肉，他强逼丽姬发誓终身留在秦宫。公孙丽坦白对嬴政的恨意，嬴政遂改为宠幸景良人。荆轲夜闯秦宫却被捕入狱，他遭到狱卒折磨虐待。
嬴政为了让丽姬怀孕之事不受质疑，遂假装和她同房。荆轲成为苦力，被押往骊山筑城修渠。祖太后谏言立后，嬴政以公孙丽已有身孕拖延立后时机。祖太后欲让楚夫人当皇后，遂欲谋害丽姬滑胎。丽姬腹痛险些滑胎，太医诊断她的膳食中被人混入滑胎药，丽姬怀疑嬴政就是下药之人。楚夫人收买景良人下药陷害丽姬，敏夫人却主动和丽姬交好。韩申得知丽姬有孕成为秦王宠妃，他却难以进入秦宫。
太后发疯深夜袭击丽姬，嬴政及时赶到救了丽姬。太后对吕不韦痴心不改，嬴政痛斥她沉溺私情。赵高调查下药谋害丽姬一事，楚夫人暗示幕后黑手是祖太后。赵高隐瞒下药内情，嬴政却已猜出真凶。田光设法救出荆轲，他说出丽姬希望荆轲拯救乱世的心愿。嬴政宣布以后和丽姬共用膳食，丽姬绝食却被嬴政以口喂食。鲍野擒获荆轲欲强抢鹄落剑法，盖聂现身救了荆轲。
盖聂揭穿公孙羽就是昔日名满江湖的血影，他鼓励荆轲潜心修习鹄落剑法。丽姬在秦宫生下一名男婴，她为孩子起名天明。韩申深夜潜入丽姬房内，他欲杀嬴政之子天明，丽姬坦白天明是荆轲骨肉。韩申对丽姬情根深种，他坦白为了丽姬应征担任秦国皇宫侍卫。赵悼襄王赵偃觐见秦王，嬴政暗示他讨伐燕国。楚夫人质疑天明早产之事，随后祖太后故意设法刁难丽姬。
嬴政为丽姬敷药，他坦言宁肯被恨也无法接受丽姬无视自己，随后丽姬被晋升为夫人。荆轲和丽姬彼此魂牵梦萦，他们心有灵犀同时舞起双人剑法。嬴政为了赢得丽姬的芳心，决定将天明留在秦宫抚养。赵高泄露赵国欲攻打燕国的情报，欲劝燕太子丹促成燕赵结盟。赵高的密使被李斯灭口，随后秦国以救燕之名攻打赵国大军，赵王闻讯吐血而亡。楚夫人赠送黄金支持太子嘉夺王位，以此收买赵高暗害天明。
天明离奇失踪，丽姬忧心如焚四处寻找儿子，赵高心怀鬼胎声称天明可能离开秦宫。韩申就是行刺嬴政的刺客，他身受重伤却必须接受李仲的盘查。楚夫人心怀恶意炫耀抚养扶苏公子之事，丽姬则反击劝楚夫人不要生下秦王子嗣。丽姬质疑嬴政劫持天明，嬴政倾诉衷肠承诺会保护丽姬母子。韩申听到冷宫有婴儿哭声的传闻，他冒死向嬴政提供线索。
丽姬在冷宫中找回天明，韩申却曝光伤势被李仲怀疑是刺客，危急之时丽姬出言庇护韩申。各国使臣争相游说吕不韦出任高官，吕不韦看穿六国势弱一心返秦。嬴政在李斯的挑拨离间之下私会吕不韦，吕不韦誓言不会背叛亲生骨肉嬴政。此时门客宣称吕不韦即将出任楚国令尹，嬴政闻言含怒将吕不韦流放蜀地。韩申欲带丽姬母子逃离秦宫，天明的啼哭却引来秦宫护卫。
荆轲为情所苦意志消沉，高渐离借比武激励他重新振作。赵高认定丽姬出逃是和身边人串谋，遂严刑拷打丽姬的婢女清儿。丽姬抛下天明逃离秦宫，她和荆轲终于重逢，此时丽姬的心里却想起嬴政。韩申爱慕丽姬，而盖兰喜欢荆轲，但是他们都希望丽姬和荆轲能够破镜重圆。李斯就是陷害吕不韦的幕后黑手，不久吕不韦饮鸩自尽，嬴政闻讯情不自禁回想起和吕不韦的种种过往。
荆轲与丽姬等人在酒桌上重叙旧时话题，谈论天下大事。荆轲几人一致认为当今的秦王暴虐无道，只有丽姬出言袒护秦王。嬴政朝堂上暴怒将护卫丽姬的侍卫杀掉，就连赵高也差点送命。丽姬为了保护荆轲和孩子谎称天明是嬴政骨肉，随后她返回秦宫。赵高奉命调查宫中奸细，欲借刀报复丽姬。祖太后与楚夫人为了母国大楚，赠送重礼拉拢李斯当亲信。
荆轲难以面对失去丽姬的痛苦，竟然举剑攻向韩申。嬴政得到禀报丽姬已经回宫，前去迎接的他看着丽姬一时爱恨难明。赵高对被关进了牢房的丽姬欲动刑，却被赶来的嬴政发现并阻拦。楚夫人为了能够稳住后宫的地位，趁此机会向祖太后状告丽姬。祖太后派人前去牢房收拾丽姬，却被闻声而来的嬴政喝退。韩申回到宫中主动认罪，被嬴政关进了牢房。丽姬乔装打扮欲前去探望师兄。
丽姬进入牢房前去看望韩申，却被闻讯而来的嬴政碰在当面。嬴政以为两人的关系非同一般，直面丽姬诉说心中爱意。嬴政没有办法单纯的相信二人的师兄妹关系，要求韩申与蒙武比试来确认其身份。丽姬下场与韩申同战蒙武，韩申身份得到确认。荆轲自丽姬走后就不断借酒浇愁，再也无心练剑整日颓废。嬴政于宫中召见韩申，用留在秦宫作为条件换其效忠自己。盖聂对颓废的荆轲大骂不止并且稍带上了公孙羽，荆轲气不过与其交手，一番比试下来荆轲终于幡然醒悟。
荆轲割发明志，决定从今以后摒弃私情潜心练剑。荆轲欲四处探访寻找遗散的鹄落剑法，盖兰甘愿追随左右。嬴政要求同寝发生关系，丽姬拒绝后被他强吻。翌日嬴政再度求欢，丽姬手握银簪欲和他同归于尽，岂料嬴政却以天明要挟丽姬。祖太后命丽姬为嬴政献剑舞贺寿，实则设下圈套安排侍卫欲杀丽姬。丽姬献舞之时宫女行刺嬴政，丽姬奋力恶斗侍卫最终诛杀宫女，却被李仲误当刺客重伤。
太子丹利用祖太后算计丽姬之际，暗中安排宫女行刺嬴政。丽姬受伤高烧昏迷，嬴政亲自照料并喂她喝药。高渐离比斗内力大胜秦舞阳，他和荆轲、盖兰意外找到鹄落剑法的藏身处。时值大秦联魏攻楚，嬴政看穿祖太后陷害丽姬，他不惜冒着楚魏联手的风险欲逮捕祖太后的侍卫。祖太后以死相逼和嬴政僵持不下，丽姬出面求情平息事端。丽姬认为魏国为求自保离间秦楚开战，嬴政遂撤兵停止攻楚。
