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ゲゲゲの鬼太郎
进入21世纪已有近20年，在人们已忘记了妖怪存在的现代。科学无法解明的现象频发，流言飞语散布各处，大人们只能疲于奔命。希望想办法解决这一情况而写信给妖怪信箱的13岁少女·真奈的面前，随着咔哒咔哒的木屐响声，鬼太郎来到了…。
涩谷的十字路口出现森林，行人突然变成树木的不可思议现象发生。中学生麻奈半信半疑地向妖怪信箱投了信，随着木屐声，咯咯咯的鬼太郎来了。
人气偶像组合电池组的巨蛋演唱会，数万观众瞬间消失。事件的背后，与鼠男成立的演艺事务所“哔哔哔Promotion”有关……
得知各地发生儿童失踪事件的麻奈，干劲十足地要和鬼太郎等人查明真相，但鬼太郎断言“妖怪和人类成不了朋友”。此时，麻奈被那个诱拐儿童的妖怪掳走……
小学生裕太从邻居麻奈那里听说了鬼太郎的事，来到了咯咯咯森林。鬼太郎不情愿地带着他游览森林。另一方面，喜欢妖怪的裕太非常开心。然而，他摘了山爷爷的树果……
鼠男看中了妖怪雷神的能力，成立了电力公司大获成功。然而，雷神逐渐失控。为了阻止雷神的暴走，鬼太郎出现，但……
收到青年翔寄来的信，说“独自住在深山村庄的母亲被妖怪附身”，鬼太郎等人造访了青年母亲正枝的家。在那里，鬼太郎注意到一只亲近正枝的猫……
居酒屋里，某企业社长正对部下否定妖怪的存在，此时鬼太郎出现。社长等人无视鬼太郎的反驳离去，归途中登上了深夜的奇妙临时列车。
学校社会科参观时，麻奈造访了某个村庄，不小心弄倒了古老的石碑。之后，同学们纷纷病倒入院，麻奈周围也开始发生怪事。然后，麻奈被关进了镜子里……
一家IT企业因薪资微薄、工作繁重，员工接连辞职。正为人手不足发愁的社长面前出现了鼠男，开始介绍妖怪人才。从远野来的河童们，以时薪三根黄瓜的低廉工资开始工作，但……
接到麻奈“最近学校发生怪事”的咨询，猫娘造访了学校。她去找作为学校七大不可思议之一、也是自己朋友的厕所花子，却不见其踪影……
东京湾上空突然出现了第二个月亮。另一方面，本该在200年前被封印的四国八百八狸军团，宣布夺取日本政权。试图向鬼太郎求助的麻奈被貉们抓住了。
日本政权被貉篡夺，反貉派接连被捕，人们开始互相监视言行。另一方面，为了解救被刑部狸诅咒石化的鬼太郎，麻奈和猫娘等人前往地下。
鼠男经营的特价钻石店生意兴隆。怀疑此事的鬼太郎遭鼠男反驳，两人陷入绝交状态。其实鼠男暗中和轮入道联手，将人类变成钻石贩卖，但……
少年正志担心一睡不醒的父亲，通过麻奈向鬼太郎求助。眼球老爹听说还有其他很多长睡不醒的成年人，推测可能是翻枕妖所为，但……
追逐偶像的少女琪拉拉，有着强烈的变可爱愿望，憎恨着自己的容貌。某天琪拉拉遇到了妖怪无面人。无面人劝琪拉拉接受灵形手术……
麻奈造访了叔叔和婶婶居住的境港。为了麻奈，叔叔庄司出海去捕新鲜的鱼，却一去不回。与镇上渔民一同乘船搜寻的麻奈，在海上遭到了船幽灵们的袭击……
鸟取县境港的镇上，悄然发生着每夜出现诡异修行僧，出谜题并将答不出的人变成铜像的事件。不知情的鬼太郎伙伴们接连被变成了铜像……
鬼太郎家门口送来大量蔬菜，鬼太郎和眼球老爹怀疑是谁干的。这些蔬菜是猫娘借了没人用的田地种出来的。某天，猫娘在路边发现了一个倒地的少年。
就在流传着有不用考试之类的妖怪学校的传闻时，麻奈受裕太委托，说他朋友说要去变成妖怪就消失了。另一方面，收到同样内容信件的鬼太郎，开始寻找妖怪学校。
某天，麻奈和母亲纯子一同去探望住院的姨婆淑子。受淑子所托去看家里是否开花，麻奈亲眼目睹了不仅在庭院，连屋顶和墙壁都盛开着鲜红花朵的景象。
