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ぱにぽにだっしゅ！
在校风过度自由的私立高中桃月学园，天才小不点老师蕾贝卡·宫本(通称贝琪)就任！小不点贝琪和个性鲜明的学生们与动物们(？)多彩的校园生活，微妙地奇妙的校园喜剧!!
因原班主任休职，一位新老师来到了桃月学园一年级C班。但是，这位老师并不普通，她是一位年仅11岁便毕业于麻省理工学院的天才小不点老师——蕾贝卡·宫本（通称贝琪）……
贝琪来到桃月学园已经几天了。她似乎已经习惯了C班，站在讲台上的样子也完全变得趾高气扬……不，看起来已经得心应手了。然而，贝琪还没有好好记住学生们的本名。就在这种情况下，贝琪把本来就没什么存在感的久留美叫作“不起眼的土气角色”，让她消沉了……
今早贝琪迟到了，因此C班的各位比平时更懒散。只有姬子一个人异常兴奋地吵闹着。觉得她那充满活力的呆毛晃来晃去很烦人的玲，用力拽了一下。结果，不知为何姬子头上冒起了白烟，玲吓了一跳，下意识地把她扔了回去……
贝琪突然通知C班，明天要考试。平时就难以捉摸的一条同学似乎多少也有些紧张感，提议邀请都一起开学习会。认真学习的都拒绝了，但拗不过话题的走向，玲、姬子、6号同学和久留美也加入进来，最后连作为监护人的贝琪也参加，决定开办学习会……
今天是全体一年级学生参加的露营教室。B班只有早乙女老师一个人情绪高涨地嬉闹，A班是桃濑修照顾着像往常一样宿醉的五十岚老师，D班则是犬神冷静地吐槽老头子莫名其妙的发言——那里呈现着与平时没太大差别的光景。那么，C班又是如何呢……
午休时间，贝琪哼着歌走在走廊上。她手里拿着写有“宫本研究室”的牌子。看起来是因为从校长那里得到了用作研究室的房间而高兴。听到研究室的姬子，开始了“让贝琪变成10个小人的药的研究”或是“让贝琪变成秃头老爹的药的研究”这类意义不明的妄想……
真正的炎热夏天到来了。在强烈的日光下，C班的家伙们被迫穿着泳衣打扫泳池。因为贝琪（因五十岚老师的耍诈）猜拳输了，所以只能由C班独自完成。或许是因为这种情况，大家都没干劲。其中认真打扫的，只有6号同学……
一年级D班的新感觉治愈系魔法少女贝荷伊米正在烦恼。明明一直明目张胆地穿着魔法少女的服装帮助别人，却总是不太受关注。那也是当然的，因为桃月学园里有白鸟铃音、南条操、贝琪等众多个性鲜明的角色。过于沮丧的贝荷伊米想躲进兔子小屋，但……
接到大学时代恩师教授的委托前来进行遗迹调查的贝琪，正前往冲之毒岛。以探险队的心情喝着果汁放松时，上空出现的直升机里有人跳了下来，猛烈地撞进了船里。战战兢兢地窥视那个撞开的大洞，一个金发女孩若无其事地从里面出来了……
新学期开始，C班正在进行自由研究的发表。“自由研究简直像是小学生的作业嘛”玲不满地抱怨道，然而久留美是平淡的牵牛花成长记录，一条同学是用空罐子做的谜之手工，6号是在庙会买的彩色小鸡观察日记等等……明明是高中生，内容却都和小学生一个水平。
放学后，6号同学表情严肃地面向书桌。“在干什么呢？”贝琪搭话后得知，她是在替姬子解填字游戏。而且，桌子上还有久留美、玲、一条同学拜托她买的各类物品。把人家当跑腿的玲他们固然有问题，但说什么都照做的6号也够可以的，贝琪感到无语……
尽管正在上课，今天姬子也舒服地酣睡着。贝琪训斥着她，但被6号同学问到“宫本老师您有未来的梦想吗？”，便开始思考起自己的梦想。然而，因为是天才少女，贝琪并没有普通人所憧憬的那种梦想。“我是没有梦想也没有希望的人吗……”贝琪大受打击……
某天的补习课上，贝琪正准备开始补习的瞬间，突然响起轰鸣的爆炸声。校园里出现了肩扛火箭筒的牛、忍者装扮的女人，以及高耸入云的巨汉。他们是全日本番长联合。前来挑战传闻中掌控桃月学园的小不点番长——也就是贝琪。与番长们的激烈冲突已无法避免，贝琪……
由于学生食堂要关闭一段时间，带着姐姐做的便当的贝琪心情很好。但是，她期待着BLT三明治，打开便当盒一看，却不是培根(B)·生菜(L)·番茄(T)，而是生的西兰花(B)、柠檬(L)和火鸡肉(T)。“姐姐这个笨蛋……”贝琪沮丧地……
贝琪他们陷入了危机。载着C班全员的巴士，此刻正要从悬崖边掉落。车体一半悬空，勉强保持着平衡的状态下，只要稍微一动就会径直坠入崖下的海中……
某日放学后。贝琪和C班的成员们在宫本研究室听取学生会谍报部绵贯的报告。原来是班长一条同学今天请假没来学校。平时就让人捉摸不透的她，这几天的行为明显与往常不同。感到在意的贝琪，委托了谍报部进行调查。而绵贯所看到的是……
今天是学园祭。C班开了家咖啡厅。而且，制服是秋叶原一带流行的女仆装。原本在商量要开什么模拟店时，因为玲提议材料费便宜，就暂且决定开咖啡厅，这便是开端。但是，为了能让客人慷慨解囊，就变成了女仆咖啡厅……
某日的黄昏。爱哭兔在公园的滑梯上看着夕阳，品味着一天平安结束的幸福。这时，一位穿着黑色和服的少女向她搭话：“您能不能变得不幸呢？”自称是见习瘟神的少女妙子，单方面地恳求爱哭兔：“请务必要为了我变得不幸……”
D组的HR（班会）上，老头子老师强烈的装傻充愣大爆发。突然乱入的，是神情异常严肃的贝琪。据说，C班的学生们感染了未知病毒紧急住院，班级被迫停课了。对这突如其来的消息，D班哄堂大笑。然而，试图让学生们安静下来的老头子，突然满脸通红地倒下了……
和平的桃月学园的早晨。C班正上演着姬子黏糊糊地抱住玲，然后被一拳打飞的日常光景。“……肚子饿了啦～”姬子说道，好像是从在中餐馆打工的玲身上闻到了蟹肉炒饭的味道。对于最爱的螃蟹展现出非人般嗅觉的姬子，都感到……
