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インフィニット・デンドログラム
2043年7月15日，带有能根据玩家的不同而千差万别，不，已进化到有“无限”可能的独立系统“胚胎“的VRMMO游戏＜Infinite Dendrogram＞发售。＜Infinite Dendrogram＞具备了之前的VRMMO所无法实现的，技术上被认为不可能的玩法，瞬间成为一股潮流席卷世界。＜Infinite Dendrogram＞发布一年后，结束高考后开始一个人在东京生活的青年”椋鸟玲二“，为了纪念漫长考试生活的结束以及被哥哥劝诱，而开启了＜Infinite Dendrogram＞。
VRMMO游戏Infinite Dendrogram自发售后大约已有1年半的时间。结束了大学入学考试的椋鸟玲二终于玩上了自己期盼已久的Infinite Dendrogram。他化身为玲·斯特林，为了与哥哥修会合而来到了阿尔塔王国，但是却突然被卷进了一项任务当中……！？
玲借助“创胎”涅墨西斯的力量，成功达成了第一个任务。他的下一个目标是成为入榜者。阿尔塔王国因为吃了败仗而导致玩家不断减少，如果在这里的话，将很有希望成为入榜者。于是玲打算抓紧时间火速升级，在练级途中他遇见了卢克和他的“创胎”巴比伦。
王都阿尔特亚周边的PK恐怖袭击全部停息了。根据情报贩子玛丽的说法，组成联合军的PK集团遭到了以费加洛为首的“超级”玩家们的清剿，全部受到了死亡惩罚。亲眼目睹了他们那碾压式战况的玲，震撼得完全说不出话来……
在前往决斗都市基甸的路上，玲一行人遇见了一群正在袭击商人马车的哥布林。不忍心见死不救的玲前去协助他们剿灭哥布林，却因为“UBM”的出现而身陷险境。面对敌人那压倒性的力量和状态异常攻击，玲等人有没有胜算呢！？
在亚历杭德罗的商店里，玲获得了一样神秘的希有道具。然而，要想使用这个道具，就必须先购买一件饰品来习得新的技能。为了赚钱，玲准备前往冒险者公会，但在一条巷子里，他遇见了遭到袭击的女性和打算出手救她的一名少年。
玲营救的少年，其实是山贼团的头目之一嵋兹所操纵的。一时大意之下，玲被对方的匕首刺中了。尽管涂在刀上的秘药给玲带来了多种异常状态，但是汹涌澎湃的怒火和杀意，还是让玲行动了起来。他展现出了震慑住嵋兹的强大压迫感，然而……
决斗都市基甸主办的活动<超级激战>终于就要开幕。到达顶峰的“超级”们汇集一堂，因为这场即将展开的激战，整座城市沉浸在狂欢和喧闹的气氛中。玲也同样对费加洛的这一战充满期待，然而“主宰”们各自的想法却在暗地里涌动交汇。
对迅羽产生误解的玲向他拔剑相向，冲突一触即发。尽管修的介入平息了这场矛盾，但在直面“超级”所具有的气场后，依旧让玲吓出了一身冷汗。随后费加洛和迅羽的一战终于打响了，玲会从这场战斗中看出些什么呢。
突然闯入“超级激战”的Mr.富兰克林，挟持第二公主伊丽莎白为人质，逼迫王国的“主宰”们挑战一个“游戏”。必须在牺牲者数量扩大之前攻克这场游戏。在众多行动受到限制的“主宰”之中，掌握着关键的人正是玲。
在伊丽莎白再次被抢走之后，“奏乐王”贝尔多贝尔阻挡在玛丽面前。将自身奉献给音乐的贝尔多贝尔，他的技能有如指挥乐队一般流丽而丰润。被逼入绝境的玛丽有没有扭转乾坤的手段呢……！？
卢克和雨果不断展开激战。尽管能够预判“魔齿轮”的攻击，但卢克的身体还是一点一点地遭到了雨果的“冻结”技能“地狱门”的侵蚀。身陷如此困境之中，卢克仍然不断思考。他认为这个“冻结”一定遵循着某种法则——
尽管遭受了严重的伤害，玲依然击破了“RSK”——Ray・Starling・Killer。“超级杀手”的暗中活跃，也一点一点地把富兰克林逼入了绝境。但是，紧接着他又打算启动他事先准备好的另外一个计划，也就是“基甸歼灭作战”
修凭借压倒性的力量不断歼灭着怪物。另一边，玲终于来到磐德魔狞墓的顶部，开始和富兰克林对峙。众多悬念开始膨胀。Infinite Dendrogram拥有不断扩张的无限可能性。这里究竟是一个“真实世界”，还是一个“游戏”呢？
